Protein–RNA interactions for Protein: Q92966

SNAPC3, snRNA-activating protein complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC3Q92966 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNAPC3Q92966 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNAPC3Q92966 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNAPC3Q92966 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNAPC3Q92966 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNAPC3Q92966 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNAPC3Q92966 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNAPC3Q92966 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNAPC3Q92966 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNAPC3Q92966 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNAPC3Q92966 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNAPC3Q92966 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNAPC3Q92966 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNAPC3Q92966 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNAPC3Q92966 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNAPC3Q92966 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SNAPC3Q92966 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNAPC3Q92966 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNAPC3Q92966 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNAPC3Q92966 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNAPC3Q92966 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNAPC3Q92966 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNAPC3Q92966 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNAPC3Q92966 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SNAPC3Q92966 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNAPC3Q92966 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNAPC3Q92966 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SNAPC3Q92966 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNAPC3Q92966 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNAPC3Q92966 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNAPC3Q92966 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNAPC3Q92966 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SNAPC3Q92966 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNAPC3Q92966 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNAPC3Q92966 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNAPC3Q92966 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNAPC3Q92966 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNAPC3Q92966 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNAPC3Q92966 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNAPC3Q92966 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNAPC3Q92966 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNAPC3Q92966 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNAPC3Q92966 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNAPC3Q92966 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNAPC3Q92966 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNAPC3Q92966 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNAPC3Q92966 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNAPC3Q92966 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNAPC3Q92966 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNAPC3Q92966 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNAPC3Q92966 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNAPC3Q92966 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNAPC3Q92966 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNAPC3Q92966 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SNAPC3Q92966 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNAPC3Q92966 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SNAPC3Q92966 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNAPC3Q92966 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNAPC3Q92966 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNAPC3Q92966 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNAPC3Q92966 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SNAPC3Q92966 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SNAPC3Q92966 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SNAPC3Q92966 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNAPC3Q92966 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNAPC3Q92966 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNAPC3Q92966 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNAPC3Q92966 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNAPC3Q92966 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNAPC3Q92966 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNAPC3Q92966 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNAPC3Q92966 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNAPC3Q92966 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNAPC3Q92966 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNAPC3Q92966 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNAPC3Q92966 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNAPC3Q92966 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNAPC3Q92966 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNAPC3Q92966 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNAPC3Q92966 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNAPC3Q92966 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNAPC3Q92966 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNAPC3Q92966 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNAPC3Q92966 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNAPC3Q92966 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNAPC3Q92966 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNAPC3Q92966 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNAPC3Q92966 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNAPC3Q92966 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SNAPC3Q92966 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNAPC3Q92966 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNAPC3Q92966 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNAPC3Q92966 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNAPC3Q92966 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNAPC3Q92966 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNAPC3Q92966 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNAPC3Q92966 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNAPC3Q92966 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNAPC3Q92966 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNAPC3Q92966 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms