Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYY2

LIPM, Lipase member M, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIPMQ5VYY2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
LIPMQ5VYY2 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LIPMQ5VYY2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LIPMQ5VYY2 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LIPMQ5VYY2 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LIPMQ5VYY2 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
LIPMQ5VYY2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LIPMQ5VYY2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LIPMQ5VYY2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
LIPMQ5VYY2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LIPMQ5VYY2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LIPMQ5VYY2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LIPMQ5VYY2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LIPMQ5VYY2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LIPMQ5VYY2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LIPMQ5VYY2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LIPMQ5VYY2 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LIPMQ5VYY2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LIPMQ5VYY2 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
LIPMQ5VYY2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
LIPMQ5VYY2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LIPMQ5VYY2 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LIPMQ5VYY2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LIPMQ5VYY2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LIPMQ5VYY2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LIPMQ5VYY2 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
LIPMQ5VYY2 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LIPMQ5VYY2 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
LIPMQ5VYY2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LIPMQ5VYY2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LIPMQ5VYY2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LIPMQ5VYY2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LIPMQ5VYY2 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LIPMQ5VYY2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LIPMQ5VYY2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LIPMQ5VYY2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LIPMQ5VYY2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LIPMQ5VYY2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LIPMQ5VYY2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LIPMQ5VYY2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LIPMQ5VYY2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LIPMQ5VYY2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LIPMQ5VYY2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.6
LIPMQ5VYY2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LIPMQ5VYY2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LIPMQ5VYY2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LIPMQ5VYY2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LIPMQ5VYY2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LIPMQ5VYY2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LIPMQ5VYY2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LIPMQ5VYY2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LIPMQ5VYY2 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LIPMQ5VYY2 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
LIPMQ5VYY2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LIPMQ5VYY2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LIPMQ5VYY2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LIPMQ5VYY2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LIPMQ5VYY2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LIPMQ5VYY2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LIPMQ5VYY2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LIPMQ5VYY2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LIPMQ5VYY2 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LIPMQ5VYY2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LIPMQ5VYY2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LIPMQ5VYY2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LIPMQ5VYY2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LIPMQ5VYY2 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LIPMQ5VYY2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LIPMQ5VYY2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LIPMQ5VYY2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LIPMQ5VYY2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LIPMQ5VYY2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LIPMQ5VYY2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
LIPMQ5VYY2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LIPMQ5VYY2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LIPMQ5VYY2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LIPMQ5VYY2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LIPMQ5VYY2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LIPMQ5VYY2 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LIPMQ5VYY2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LIPMQ5VYY2 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LIPMQ5VYY2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LIPMQ5VYY2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LIPMQ5VYY2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LIPMQ5VYY2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LIPMQ5VYY2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LIPMQ5VYY2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LIPMQ5VYY2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LIPMQ5VYY2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LIPMQ5VYY2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
LIPMQ5VYY2 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
LIPMQ5VYY2 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LIPMQ5VYY2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LIPMQ5VYY2 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LIPMQ5VYY2 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LIPMQ5VYY2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LIPMQ5VYY2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LIPMQ5VYY2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LIPMQ5VYY2 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LIPMQ5VYY2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.3 ms