Protein–RNA interactions for Protein: Q12098

SLX4, Structure-specific endonuclease subunit SLX4, yeastyeast

Predictions only

Length 748 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SLX4Q12098 YMC2YBR104W 990 nt8.67□□□□□ -1.02
SLX4Q12098 SOD2YHR008C 702 nt8.66□□□□□ -1.02
SLX4Q12098 FIT1YDR534C 1587 nt8.65□□□□□ -1.02
SLX4Q12098 LSP1YPL004C 1026 nt8.65□□□□□ -1.02
SLX4Q12098 OCH1YGL038C 1443 nt8.64□□□□□ -1.03
SLX4Q12098 AAT1YKL106W 1356 nt8.64□□□□□ -1.03
SLX4Q12098 PET18YCR020C 648 nt8.64□□□□□ -1.03
SLX4Q12098 MRS4YKR052C 915 nt8.64□□□□□ -1.03
SLX4Q12098 FET5YFL041W 1869 nt8.64□□□□□ -1.03
SLX4Q12098 DUR3YHL016C 2208 nt8.64□□□□□ -1.03
SLX4Q12098 CAK1YFL029C 1107 nt8.63□□□□□ -1.03
SLX4Q12098 YLR460CYLR460C 1131 nt8.63□□□□□ -1.03
SLX4Q12098 GCD11YER025W 1584 nt8.62□□□□□ -1.03
SLX4Q12098 YBR056WYBR056W 1506 nt8.61□□□□□ -1.03
SLX4Q12098 ECM27YJR106W 2178 nt8.61□□□□□ -1.03
SLX4Q12098 YIR035CYIR035C 765 nt8.61□□□□□ -1.03
SLX4Q12098 PDC6YGR087C 1692 nt8.61□□□□□ -1.03
SLX4Q12098 CHS7YHR142W 951 nt8.6□□□□□ -1.03
SLX4Q12098 RCR1YBR005W 642 nt8.6□□□□□ -1.03
SLX4Q12098 YLR072WYLR072W 2082 nt8.6□□□□□ -1.03
SLX4Q12098 RRT14YIL127C 621 nt8.59□□□□□ -1.03
SLX4Q12098 YJR149WYJR149W 1215 nt8.59□□□□□ -1.03
SLX4Q12098 YMR210WYMR210W 1350 nt8.59□□□□□ -1.03
SLX4Q12098 YRF1-2YER190W 5046 nt8.58□□□□□ -1.04
SLX4Q12098 snR86snR86 1004 nt8.58□□□□□ -1.04
SLX4Q12098 COG1YGL223C 1254 nt8.58□□□□□ -1.04
SLX4Q12098 EMC3YKL207W 762 nt8.58□□□□□ -1.04
SLX4Q12098 MET30YIL046W 1923 nt8.57□□□□□ -1.04
SLX4Q12098 YER152W-AYER152W-A 567 nt8.57□□□□□ -1.04
SLX4Q12098 BUB2YMR055C 921 nt8.57□□□□□ -1.04
SLX4Q12098 HDA1YNL021W 2121 nt8.56□□□□□ -1.04
SLX4Q12098 TRP2YER090W 1524 nt8.56□□□□□ -1.04
SLX4Q12098 NBA1YOL070C 1506 nt8.56□□□□□ -1.04
SLX4Q12098 MEP1YGR121C 1479 nt8.56□□□□□ -1.04
SLX4Q12098 YER156CYER156C 1017 nt8.55□□□□□ -1.04
SLX4Q12098 FAF1YIL019W 1041 nt8.55□□□□□ -1.04
SLX4Q12098 OLA1YBR025C 1185 nt8.55□□□□□ -1.04
SLX4Q12098 POP2YNR052C 1302 nt8.54□□□□□ -1.04
SLX4Q12098 ECM10YEL030W 1935 nt8.54□□□□□ -1.04
SLX4Q12098 YJL009WYJL009W 327 nt8.54□□□□□ -1.04
SLX4Q12098 HXT11YOL156W 1704 nt8.54□□□□□ -1.04
SLX4Q12098 UTR5YEL035C 501 nt8.53□□□□□ -1.04
SLX4Q12098 YGR139WYGR139W 339 nt8.53□□□□□ -1.04
SLX4Q12098 BXI1YNL305C 894 nt8.53□□□□□ -1.04
SLX4Q12098 SNU66YOR308C 1764 nt8.53□□□□□ -1.04
SLX4Q12098 YNL190WYNL190W 615 nt8.52□□□□□ -1.05
SLX4Q12098 ATG22YCL038C 1587 nt8.52□□□□□ -1.05
SLX4Q12098 RPS6AYPL090C 711 nt8.51□□□□□ -1.05
SLX4Q12098 RPS6BYBR181C 711 nt8.51□□□□□ -1.05
SLX4Q12098 ADE5,7YGL234W 2409 nt8.51□□□□□ -1.05
SLX4Q12098 SHC1YER096W 1539 nt8.5□□□□□ -1.05
SLX4Q12098 YKR023WYKR023W 1593 nt8.49□□□□□ -1.05
SLX4Q12098 IDP3YNL009W 1263 nt8.49□□□□□ -1.05
SLX4Q12098 RHO1YPR165W 630 nt8.49□□□□□ -1.05
SLX4Q12098 LRO1YNR008W 1986 nt8.48□□□□□ -1.05
SLX4Q12098 PAU21YOR394W 495 nt8.48□□□□□ -1.05
SLX4Q12098 PAU22YPL282C 495 nt8.48□□□□□ -1.05
SLX4Q12098 EHT1YBR177C 1356 nt8.48□□□□□ -1.05
SLX4Q12098 UBP13YBL067C 2244 nt8.48□□□□□ -1.05
SLX4Q12098 ABP1YCR088W 1779 nt8.47□□□□□ -1.05
SLX4Q12098 ADA2YDR448W 1305 nt8.47□□□□□ -1.05
SLX4Q12098 SRM1YGL097W 1449 nt8.46□□□□□ -1.05
SLX4Q12098 GRH1YDR517W 1119 nt8.46□□□□□ -1.06
SLX4Q12098 MIM1YOL026C 342 nt8.46□□□□□ -1.06
SLX4Q12098 ATP2YJR121W 1536 nt8.45□□□□□ -1.06
SLX4Q12098 YJL045WYJL045W 1905 nt8.45□□□□□ -1.06
SLX4Q12098 PUP3YER094C 618 nt8.45□□□□□ -1.06
SLX4Q12098 ADE2YOR128C 1716 nt8.45□□□□□ -1.06
SLX4Q12098 LAS17YOR181W 1902 nt8.44□□□□□ -1.06
SLX4Q12098 MFT1YML062C 1179 nt8.44□□□□□ -1.06
SLX4Q12098 THI73YLR004C 1572 nt8.44□□□□□ -1.06
SLX4Q12098 HXT8YJL214W 1710 nt8.43□□□□□ -1.06
SLX4Q12098 YPT31YER031C 672 nt8.42□□□□□ -1.06
SLX4Q12098 BUD20YLR074C 501 nt8.42□□□□□ -1.06
SLX4Q12098 HIS3YOR202W 663 nt8.42□□□□□ -1.06
SLX4Q12098 LEA1YPL213W 717 nt8.42□□□□□ -1.06
SLX4Q12098 DIP5YPL265W 1827 nt8.42□□□□□ -1.06
SLX4Q12098 MAM3YOL060C 2121 nt8.41□□□□□ -1.06
SLX4Q12098 NDE1YMR145C 1683 nt8.4□□□□□ -1.06
SLX4Q12098 YPR084WYPR084W 1371 nt8.4□□□□□ -1.06
SLX4Q12098 MRP1YDR347W 966 nt8.4□□□□□ -1.06
SLX4Q12098 CSM2YIL132C 642 nt8.4□□□□□ -1.06
SLX4Q12098 FRT1YOR324C 1809 nt8.4□□□□□ -1.07
SLX4Q12098 GDH1YOR375C 1365 nt8.39□□□□□ -1.07
SLX4Q12098 BUD31YCR063W 474 nt8.39□□□□□ -1.07
SLX4Q12098 tD(GUC)BtD(GUC)B 72 nt8.39□□□□□ -1.07
SLX4Q12098 tD(GUC)DtD(GUC)D 72 nt8.39□□□□□ -1.07
SLX4Q12098 tD(GUC)G1tD(GUC)G1 72 nt8.39□□□□□ -1.07
SLX4Q12098 tD(GUC)G2tD(GUC)G2 72 nt8.39□□□□□ -1.07
SLX4Q12098 tD(GUC)I1tD(GUC)I1 72 nt8.39□□□□□ -1.07
SLX4Q12098 tD(GUC)I2tD(GUC)I2 72 nt8.39□□□□□ -1.07
SLX4Q12098 tD(GUC)J1tD(GUC)J1 72 nt8.39□□□□□ -1.07
SLX4Q12098 tD(GUC)J2tD(GUC)J2 72 nt8.39□□□□□ -1.07
SLX4Q12098 tD(GUC)J3tD(GUC)J3 72 nt8.39□□□□□ -1.07
SLX4Q12098 tD(GUC)J4tD(GUC)J4 72 nt8.39□□□□□ -1.07
SLX4Q12098 tD(GUC)KtD(GUC)K 72 nt8.39□□□□□ -1.07
SLX4Q12098 tD(GUC)L1tD(GUC)L1 72 nt8.39□□□□□ -1.07
SLX4Q12098 tD(GUC)L2tD(GUC)L2 72 nt8.39□□□□□ -1.07
SLX4Q12098 tD(GUC)MtD(GUC)M 72 nt8.39□□□□□ -1.07
SLX4Q12098 tD(GUC)OtD(GUC)O 72 nt8.39□□□□□ -1.07
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