Protein–RNA interactions for Protein: P57772

EEFSEC, Selenocysteine-specific elongation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEFSECP57772 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
EEFSECP57772 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
EEFSECP57772 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
EEFSECP57772 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
EEFSECP57772 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
EEFSECP57772 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
EEFSECP57772 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EEFSECP57772 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EEFSECP57772 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EEFSECP57772 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EEFSECP57772 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EEFSECP57772 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EEFSECP57772 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EEFSECP57772 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EEFSECP57772 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EEFSECP57772 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EEFSECP57772 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EEFSECP57772 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EEFSECP57772 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EEFSECP57772 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EEFSECP57772 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EEFSECP57772 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EEFSECP57772 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
EEFSECP57772 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
EEFSECP57772 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EEFSECP57772 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EEFSECP57772 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EEFSECP57772 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
EEFSECP57772 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
EEFSECP57772 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EEFSECP57772 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EEFSECP57772 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EEFSECP57772 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EEFSECP57772 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EEFSECP57772 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EEFSECP57772 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EEFSECP57772 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EEFSECP57772 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EEFSECP57772 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EEFSECP57772 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EEFSECP57772 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
EEFSECP57772 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EEFSECP57772 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EEFSECP57772 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EEFSECP57772 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EEFSECP57772 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EEFSECP57772 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EEFSECP57772 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EEFSECP57772 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EEFSECP57772 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EEFSECP57772 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EEFSECP57772 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EEFSECP57772 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EEFSECP57772 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EEFSECP57772 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EEFSECP57772 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EEFSECP57772 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EEFSECP57772 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EEFSECP57772 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EEFSECP57772 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EEFSECP57772 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EEFSECP57772 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
EEFSECP57772 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EEFSECP57772 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EEFSECP57772 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EEFSECP57772 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EEFSECP57772 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EEFSECP57772 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EEFSECP57772 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
EEFSECP57772 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EEFSECP57772 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EEFSECP57772 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EEFSECP57772 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EEFSECP57772 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EEFSECP57772 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EEFSECP57772 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EEFSECP57772 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EEFSECP57772 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EEFSECP57772 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EEFSECP57772 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EEFSECP57772 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EEFSECP57772 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EEFSECP57772 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EEFSECP57772 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
EEFSECP57772 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EEFSECP57772 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EEFSECP57772 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EEFSECP57772 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EEFSECP57772 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
EEFSECP57772 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EEFSECP57772 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EEFSECP57772 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EEFSECP57772 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EEFSECP57772 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EEFSECP57772 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EEFSECP57772 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EEFSECP57772 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EEFSECP57772 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EEFSECP57772 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EEFSECP57772 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111 ms