Protein–RNA interactions for Protein: P57088

TMEM33, Transmembrane protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM33P57088 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM33P57088 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM33P57088 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM33P57088 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM33P57088 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM33P57088 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM33P57088 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM33P57088 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM33P57088 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM33P57088 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM33P57088 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM33P57088 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM33P57088 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM33P57088 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM33P57088 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM33P57088 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM33P57088 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM33P57088 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM33P57088 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM33P57088 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM33P57088 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM33P57088 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM33P57088 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM33P57088 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM33P57088 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM33P57088 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM33P57088 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM33P57088 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TMEM33P57088 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TMEM33P57088 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM33P57088 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM33P57088 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM33P57088 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM33P57088 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM33P57088 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM33P57088 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM33P57088 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM33P57088 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM33P57088 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM33P57088 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM33P57088 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM33P57088 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM33P57088 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM33P57088 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM33P57088 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM33P57088 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM33P57088 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM33P57088 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM33P57088 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM33P57088 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM33P57088 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM33P57088 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM33P57088 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM33P57088 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM33P57088 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM33P57088 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM33P57088 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM33P57088 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM33P57088 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM33P57088 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM33P57088 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM33P57088 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM33P57088 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM33P57088 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM33P57088 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM33P57088 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM33P57088 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM33P57088 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM33P57088 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM33P57088 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM33P57088 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM33P57088 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM33P57088 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMEM33P57088 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM33P57088 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM33P57088 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM33P57088 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM33P57088 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM33P57088 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM33P57088 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM33P57088 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM33P57088 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM33P57088 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM33P57088 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM33P57088 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM33P57088 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM33P57088 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM33P57088 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM33P57088 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM33P57088 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM33P57088 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM33P57088 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM33P57088 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM33P57088 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM33P57088 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMEM33P57088 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMEM33P57088 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMEM33P57088 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMEM33P57088 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMEM33P57088 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms