Protein–RNA interactions for Protein: P53599

SSK2, MAP kinase kinase kinase SSK2, yeastyeast

Predictions only

Length 1,579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSK2P53599 HOL1YNR055C 1761 nt12.93□□□□□ -0.34
SSK2P53599 GPM1YKL152C 744 nt12.92□□□□□ -0.34
SSK2P53599 PSP2YML017W 1782 nt12.91□□□□□ -0.34
SSK2P53599 LAT1YNL071W 1449 nt12.91□□□□□ -0.34
SSK2P53599 PIH1YHR034C 1035 nt12.9□□□□□ -0.34
SSK2P53599 PNS1YOR161C 1620 nt12.9□□□□□ -0.34
SSK2P53599 SLM3YDL033C 1254 nt12.9□□□□□ -0.35
SSK2P53599 UGP1YKL035W 1500 nt12.89□□□□□ -0.35
SSK2P53599 ESBP6YNL125C 2022 nt12.89□□□□□ -0.35
SSK2P53599 ZAP1YJL056C 2643 nt12.89□□□□□ -0.35
SSK2P53599 YJL009WYJL009W 327 nt12.87□□□□□ -0.35
SSK2P53599 YOX1YML027W 1158 nt12.87□□□□□ -0.35
SSK2P53599 ATP23YNR020C 813 nt12.87□□□□□ -0.35
SSK2P53599 MEP1YGR121C 1479 nt12.87□□□□□ -0.35
SSK2P53599 YDR467CYDR467C 327 nt12.86□□□□□ -0.35
SSK2P53599 CPT1YNL130C 1182 nt12.84□□□□□ -0.35
SSK2P53599 AAC3YBR085W 924 nt12.84□□□□□ -0.35
SSK2P53599 SSL2YIL143C 2532 nt12.84□□□□□ -0.35
SSK2P53599 JHD1YER051W 1479 nt12.83□□□□□ -0.35
SSK2P53599 TMS1YDR105C 1422 nt12.81□□□□□ -0.36
SSK2P53599 DOC1YGL240W 753 nt12.81□□□□□ -0.36
SSK2P53599 AVO2YMR068W 1281 nt12.8□□□□□ -0.36
SSK2P53599 YBL111CYBL111C 2004 nt12.8□□□□□ -0.36
SSK2P53599 ODC1YPL134C 933 nt12.8□□□□□ -0.36
SSK2P53599 YIR035CYIR035C 765 nt12.78□□□□□ -0.36
SSK2P53599 BUB2YMR055C 921 nt12.78□□□□□ -0.36
SSK2P53599 SPE3YPR069C 882 nt12.78□□□□□ -0.36
SSK2P53599 DPL1YDR294C 1770 nt12.78□□□□□ -0.36
SSK2P53599 HXT8YJL214W 1710 nt12.77□□□□□ -0.36
SSK2P53599 PUS4YNL292W 1212 nt12.77□□□□□ -0.36
SSK2P53599 TIM50YPL063W 1431 nt12.76□□□□□ -0.37
SSK2P53599 CWP2YKL096W-A 279 nt12.73□□□□□ -0.37
SSK2P53599 GAL83YER027C 1254 nt12.72□□□□□ -0.37
SSK2P53599 POR2YIL114C 846 nt12.7□□□□□ -0.38
SSK2P53599 YMC2YBR104W 990 nt12.69□□□□□ -0.38
SSK2P53599 YBR056WYBR056W 1506 nt12.69□□□□□ -0.38
SSK2P53599 tE(CUC)DtE(CUC)D 72 nt12.69□□□□□ -0.38
SSK2P53599 tE(CUC)ItE(CUC)I 72 nt12.69□□□□□ -0.38
SSK2P53599 AIM46YHR199C 933 nt12.69□□□□□ -0.38
SSK2P53599 CST26YBR042C 1194 nt12.69□□□□□ -0.38
SSK2P53599 LEU4YNL104C 1860 nt12.68□□□□□ -0.38
SSK2P53599 PRE10YOR362C 867 nt12.67□□□□□ -0.38
SSK2P53599 YHR218WYHR218W 1812 nt12.67□□□□□ -0.38
SSK2P53599 MRS4YKR052C 915 nt12.64□□□□□ -0.39
SSK2P53599 PMU1YKL128C 888 nt12.64□□□□□ -0.39
SSK2P53599 ADH6YMR318C 1083 nt12.62□□□□□ -0.39
SSK2P53599 CMP2YML057W 1815 nt12.61□□□□□ -0.39
SSK2P53599 TRR2YHR106W 1029 nt12.6□□□□□ -0.39
SSK2P53599 PMP3YDR276C 168 nt12.59□□□□□ -0.39
SSK2P53599 MBF1YOR298C-A 456 nt12.59□□□□□ -0.39
SSK2P53599 PLB3YOL011W 2061 nt12.58□□□□□ -0.39
SSK2P53599 CRN1YLR429W 1956 nt12.58□□□□□ -0.39
SSK2P53599 snR86snR86 1004 nt12.58□□□□□ -0.4
SSK2P53599 HIS2YFR025C 1008 nt12.58□□□□□ -0.4
SSK2P53599 ZIM17YNL310C 525 nt12.58□□□□□ -0.4
SSK2P53599 LRO1YNR008W 1986 nt12.57□□□□□ -0.4
SSK2P53599 YPQ1YOL092W 927 nt12.57□□□□□ -0.4
SSK2P53599 TPN1YGL186C 1740 nt12.57□□□□□ -0.4
SSK2P53599 AAT1YKL106W 1356 nt12.56□□□□□ -0.4
SSK2P53599 YML034C-AYML034C-A 399 nt12.56□□□□□ -0.4
SSK2P53599 MDM35YKL053C-A 261 nt12.53□□□□□ -0.4
SSK2P53599 RCF1YML030W 480 nt12.53□□□□□ -0.4
SSK2P53599 ALG7YBR243C 1347 nt12.53□□□□□ -0.4
SSK2P53599 YGL081WYGL081W 963 nt12.52□□□□□ -0.4
SSK2P53599 PDA1YER178W 1263 nt12.52□□□□□ -0.41
SSK2P53599 YJR142WYJR142W 1029 nt12.51□□□□□ -0.41
SSK2P53599 ARG7YMR062C 1326 nt12.5□□□□□ -0.41
SSK2P53599 NMA2YGR010W 1188 nt12.5□□□□□ -0.41
SSK2P53599 MCP1YOR228C 909 nt12.49□□□□□ -0.41
SSK2P53599 SPS1YDR523C 1473 nt12.49□□□□□ -0.41
SSK2P53599 CDC3YLR314C 1563 nt12.48□□□□□ -0.41
SSK2P53599 NPP2YEL016C 1482 nt12.48□□□□□ -0.41
SSK2P53599 YLR184WYLR184W 348 nt12.48□□□□□ -0.41
SSK2P53599 CKI1YLR133W 1749 nt12.48□□□□□ -0.41
SSK2P53599 PSA1YDL055C 1086 nt12.45□□□□□ -0.42
SSK2P53599 LDB7YBL006C 543 nt12.45□□□□□ -0.42
SSK2P53599 ERV2YPR037C 591 nt12.44□□□□□ -0.42
SSK2P53599 TES1YJR019C 1050 nt12.43□□□□□ -0.42
SSK2P53599 PRS4YBL068W 981 nt12.43□□□□□ -0.42
SSK2P53599 BUD31YCR063W 474 nt12.43□□□□□ -0.42
SSK2P53599 ARO3YDR035W 1113 nt12.42□□□□□ -0.42
SSK2P53599 PTH2YBL057C 627 nt12.42□□□□□ -0.42
SSK2P53599 EHT1YBR177C 1356 nt12.42□□□□□ -0.42
SSK2P53599 DIP5YPL265W 1827 nt12.41□□□□□ -0.42
SSK2P53599 OSM1YJR051W 1506 nt12.41□□□□□ -0.42
SSK2P53599 BIO3YNR058W 1443 nt12.41□□□□□ -0.42
SSK2P53599 YMR074CYMR074C 438 nt12.4□□□□□ -0.42
SSK2P53599 YPL067CYPL067C 597 nt12.4□□□□□ -0.42
SSK2P53599 LGE1YPL055C 999 nt12.39□□□□□ -0.43
SSK2P53599 AGP3YFL055W 1677 nt12.39□□□□□ -0.43
SSK2P53599 MSI1YBR195C 1269 nt12.39□□□□□ -0.43
SSK2P53599 CYS4YGR155W 1524 nt12.38□□□□□ -0.43
SSK2P53599 YER152CYER152C 1332 nt12.38□□□□□ -0.43
SSK2P53599 KRR1YCL059C 951 nt12.37□□□□□ -0.43
SSK2P53599 AIM20YIL158W 615 nt12.37□□□□□ -0.43
SSK2P53599 AAD14YNL331C 1131 nt12.37□□□□□ -0.43
SSK2P53599 INO1YJL153C 1602 nt12.36□□□□□ -0.43
SSK2P53599 MPH3YJR160C 1809 nt12.36□□□□□ -0.43
SSK2P53599 STS1YIR011C 960 nt12.35□□□□□ -0.43
SSK2P53599 UME6YDR207C 2511 nt12.33□□□□□ -0.44
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