Protein–RNA interactions for Protein: P40550

PDR11, ATP-dependent permease PDR11, yeastyeast

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Length 1,411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PDR11P40550 tE(CUC)DtE(CUC)D 72 nt10.92□□□□□ -0.66
PDR11P40550 tE(CUC)ItE(CUC)I 72 nt10.92□□□□□ -0.66
PDR11P40550 SPG1YGR236C 288 nt10.92□□□□□ -0.66
PDR11P40550 JHD1YER051W 1479 nt10.92□□□□□ -0.66
PDR11P40550 YDR476CYDR476C 675 nt10.92□□□□□ -0.66
PDR11P40550 PUP3YER094C 618 nt10.91□□□□□ -0.66
PDR11P40550 TMS1YDR105C 1422 nt10.9□□□□□ -0.67
PDR11P40550 YJL009WYJL009W 327 nt10.89□□□□□ -0.67
PDR11P40550 HXT8YJL214W 1710 nt10.88□□□□□ -0.67
PDR11P40550 BUB2YMR055C 921 nt10.87□□□□□ -0.67
PDR11P40550 MDM35YKL053C-A 261 nt10.86□□□□□ -0.67
PDR11P40550 YML079WYML079W 606 nt10.86□□□□□ -0.67
PDR11P40550 YMC2YBR104W 990 nt10.86□□□□□ -0.67
PDR11P40550 YBR056WYBR056W 1506 nt10.86□□□□□ -0.67
PDR11P40550 PSP2YML017W 1782 nt10.86□□□□□ -0.67
PDR11P40550 YHR218WYHR218W 1812 nt10.85□□□□□ -0.67
PDR11P40550 YIR035CYIR035C 765 nt10.84□□□□□ -0.67
PDR11P40550 HSL7YBR133C 2484 nt10.84□□□□□ -0.67
PDR11P40550 PNS1YOR161C 1620 nt10.84□□□□□ -0.67
PDR11P40550 ESBP6YNL125C 2022 nt10.84□□□□□ -0.67
PDR11P40550 NPP2YEL016C 1482 nt10.84□□□□□ -0.67
PDR11P40550 YMR209CYMR209C 1374 nt10.83□□□□□ -0.68
PDR11P40550 TIM50YPL063W 1431 nt10.82□□□□□ -0.68
PDR11P40550 CYS3YAL012W 1185 nt10.81□□□□□ -0.68
PDR11P40550 MRS4YKR052C 915 nt10.81□□□□□ -0.68
PDR11P40550 SPR1YOR190W 1338 nt10.81□□□□□ -0.68
PDR11P40550 RIM8YGL045W 1629 nt10.8□□□□□ -0.68
PDR11P40550 UME1YPL139C 1383 nt10.8□□□□□ -0.68
PDR11P40550 PUP2YGR253C 783 nt10.8□□□□□ -0.68
PDR11P40550 AAT1YKL106W 1356 nt10.79□□□□□ -0.68
PDR11P40550 LRO1YNR008W 1986 nt10.78□□□□□ -0.68
PDR11P40550 SRY1YKL218C 981 nt10.78□□□□□ -0.68
PDR11P40550 TPN1YGL186C 1740 nt10.77□□□□□ -0.68
PDR11P40550 KRR1YCL059C 951 nt10.77□□□□□ -0.68
PDR11P40550 snR86snR86 1004 nt10.77□□□□□ -0.68
PDR11P40550 HXT10YFL011W 1641 nt10.77□□□□□ -0.69
PDR11P40550 YHL030W-AYHL030W-A 462 nt10.76□□□□□ -0.69
PDR11P40550 URA1YKL216W 945 nt10.76□□□□□ -0.69
PDR11P40550 CPT1YNL130C 1182 nt10.75□□□□□ -0.69
PDR11P40550 YDR510C-AYDR510C-A 117 nt10.74□□□□□ -0.69
PDR11P40550 DOC1YGL240W 753 nt10.72□□□□□ -0.69
PDR11P40550 PRE10YOR362C 867 nt10.72□□□□□ -0.69
PDR11P40550 EHT1YBR177C 1356 nt10.69□□□□□ -0.7
PDR11P40550 PIH1YHR034C 1035 nt10.69□□□□□ -0.7
PDR11P40550 YAL019W-AYAL019W-A 570 nt10.68□□□□□ -0.7
PDR11P40550 MAS2YHR024C 1449 nt10.68□□□□□ -0.7
PDR11P40550 AGP3YFL055W 1677 nt10.68□□□□□ -0.7
PDR11P40550 ATP23YNR020C 813 nt10.67□□□□□ -0.7
PDR11P40550 DMA2YNL116W 1569 nt10.65□□□□□ -0.7
PDR11P40550 MTO1YGL236C 2010 nt10.65□□□□□ -0.7
PDR11P40550 YGL114WYGL114W 2178 nt10.65□□□□□ -0.7
PDR11P40550 SLM3YDL033C 1254 nt10.65□□□□□ -0.7
PDR11P40550 PMU1YKL128C 888 nt10.65□□□□□ -0.7
PDR11P40550 YOR111WYOR111W 699 nt10.65□□□□□ -0.7
PDR11P40550 ADH6YMR318C 1083 nt10.64□□□□□ -0.71
PDR11P40550 DIP5YPL265W 1827 nt10.63□□□□□ -0.71
PDR11P40550 ALG7YBR243C 1347 nt10.62□□□□□ -0.71
PDR11P40550 CRN1YLR429W 1956 nt10.62□□□□□ -0.71
PDR11P40550 YJL144WYJL144W 315 nt10.6□□□□□ -0.71
PDR11P40550 INO1YJL153C 1602 nt10.6□□□□□ -0.71
PDR11P40550 INH1YDL181W 258 nt10.59□□□□□ -0.71
PDR11P40550 TRP2YER090W 1524 nt10.59□□□□□ -0.71
PDR11P40550 RCF1YML030W 480 nt10.58□□□□□ -0.72
PDR11P40550 YML034C-AYML034C-A 399 nt10.58□□□□□ -0.72
PDR11P40550 MBF1YOR298C-A 456 nt10.58□□□□□ -0.72
PDR11P40550 ARG7YMR062C 1326 nt10.57□□□□□ -0.72
PDR11P40550 POR2YIL114C 846 nt10.57□□□□□ -0.72
PDR11P40550 LAT1YNL071W 1449 nt10.56□□□□□ -0.72
PDR11P40550 ARO3YDR035W 1113 nt10.56□□□□□ -0.72
PDR11P40550 NMA2YGR010W 1188 nt10.56□□□□□ -0.72
PDR11P40550 YJR142WYJR142W 1029 nt10.55□□□□□ -0.72
PDR11P40550 YOX1YML027W 1158 nt10.55□□□□□ -0.72
PDR11P40550 YBL111CYBL111C 2004 nt10.53□□□□□ -0.72
PDR11P40550 BUD31YCR063W 474 nt10.53□□□□□ -0.72
PDR11P40550 YPQ1YOL092W 927 nt10.53□□□□□ -0.72
PDR11P40550 THI6YPL214C 1623 nt10.53□□□□□ -0.72
PDR11P40550 ABP1YCR088W 1779 nt10.53□□□□□ -0.72
PDR11P40550 ERV2YPR037C 591 nt10.52□□□□□ -0.73
PDR11P40550 DST1YGL043W 930 nt10.51□□□□□ -0.73
PDR11P40550 SNP1YIL061C 903 nt10.51□□□□□ -0.73
PDR11P40550 SPS1YDR523C 1473 nt10.5□□□□□ -0.73
PDR11P40550 PSD1YNL169C 1503 nt10.5□□□□□ -0.73
PDR11P40550 FET5YFL041W 1869 nt10.5□□□□□ -0.73
PDR11P40550 ZIM17YNL310C 525 nt10.5□□□□□ -0.73
PDR11P40550 PDA1YER178W 1263 nt10.49□□□□□ -0.73
PDR11P40550 YLR072WYLR072W 2082 nt10.48□□□□□ -0.73
PDR11P40550 PUS4YNL292W 1212 nt10.48□□□□□ -0.73
PDR11P40550 CKI1YLR133W 1749 nt10.48□□□□□ -0.73
PDR11P40550 PSA1YDL055C 1086 nt10.47□□□□□ -0.73
PDR11P40550 AIM46YHR199C 933 nt10.46□□□□□ -0.74
PDR11P40550 CST26YBR042C 1194 nt10.46□□□□□ -0.74
PDR11P40550 MTC6YHR151C 1581 nt10.46□□□□□ -0.74
PDR11P40550 CDC3YLR314C 1563 nt10.46□□□□□ -0.74
PDR11P40550 YNL295WYNL295W 1575 nt10.46□□□□□ -0.74
PDR11P40550 SRM1YGL097W 1449 nt10.46□□□□□ -0.74
PDR11P40550 STE3YKL178C 1413 nt10.46□□□□□ -0.74
PDR11P40550 TES1YJR019C 1050 nt10.45□□□□□ -0.74
PDR11P40550 HIS3YOR202W 663 nt10.45□□□□□ -0.74
PDR11P40550 WSC4YHL028W 1818 nt10.45□□□□□ -0.74
PDR11P40550 RDN37-1RDN37-1 5354 nt10.43□□□□□ -0.74
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