Protein–RNA interactions for Protein: P34228

SEF1, Putative transcription factor SEF1, yeastyeast

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Length 1,148 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SEF1P34228 CBK1YNL161W 2271 nt7.52□□□□□ -1.21
SEF1P34228 RPC31YNL151C 756 nt7.52□□□□□ -1.21
SEF1P34228 RIM2YBR192W 1134 nt7.52□□□□□ -1.21
SEF1P34228 GCD11YER025W 1584 nt7.51□□□□□ -1.21
SEF1P34228 MDM35YKL053C-A 261 nt7.51□□□□□ -1.21
SEF1P34228 MET30YIL046W 1923 nt7.5□□□□□ -1.21
SEF1P34228 KGD2YDR148C 1392 nt7.5□□□□□ -1.21
SEF1P34228 GDH1YOR375C 1365 nt7.5□□□□□ -1.21
SEF1P34228 YPT11YNL304W 1254 nt7.5□□□□□ -1.21
SEF1P34228 MLS1YNL117W 1665 nt7.49□□□□□ -1.21
SEF1P34228 NBA1YOL070C 1506 nt7.48□□□□□ -1.21
SEF1P34228 BAP3YDR046C 1815 nt7.48□□□□□ -1.21
SEF1P34228 YPL247CYPL247C 1572 nt7.47□□□□□ -1.21
SEF1P34228 YFR020WYFR020W 699 nt7.47□□□□□ -1.21
SEF1P34228 ADA2YDR448W 1305 nt7.47□□□□□ -1.21
SEF1P34228 DPL1YDR294C 1770 nt7.46□□□□□ -1.21
SEF1P34228 PET18YCR020C 648 nt7.46□□□□□ -1.22
SEF1P34228 SBP1YHL034C 885 nt7.46□□□□□ -1.22
SEF1P34228 MGM101YJR144W 810 nt7.46□□□□□ -1.22
SEF1P34228 YNL190WYNL190W 615 nt7.46□□□□□ -1.22
SEF1P34228 SNU66YOR308C 1764 nt7.46□□□□□ -1.22
SEF1P34228 PRE5YMR314W 705 nt7.45□□□□□ -1.22
SEF1P34228 SDH8YBR269C 417 nt7.45□□□□□ -1.22
SEF1P34228 YHR131CYHR131C 2553 nt7.45□□□□□ -1.22
SEF1P34228 ECM10YEL030W 1935 nt7.44□□□□□ -1.22
SEF1P34228 MIM1YOL026C 342 nt7.44□□□□□ -1.22
SEF1P34228 UTR5YEL035C 501 nt7.43□□□□□ -1.22
SEF1P34228 TAD2YJL035C 753 nt7.43□□□□□ -1.22
SEF1P34228 AGP3YFL055W 1677 nt7.43□□□□□ -1.22
SEF1P34228 GAS1YMR307W 1680 nt7.43□□□□□ -1.22
SEF1P34228 LSP1YPL004C 1026 nt7.42□□□□□ -1.22
SEF1P34228 PTC6YCR079W 1329 nt7.41□□□□□ -1.22
SEF1P34228 RSM7YJR113C 744 nt7.4□□□□□ -1.22
SEF1P34228 YMR166CYMR166C 1107 nt7.4□□□□□ -1.22
SEF1P34228 YMR316C-BYMR316C-B 309 nt7.4□□□□□ -1.22
SEF1P34228 ELP4YPL101W 1371 nt7.4□□□□□ -1.22
SEF1P34228 LAS17YOR181W 1902 nt7.4□□□□□ -1.23
SEF1P34228 GGA2YHR108W 1758 nt7.39□□□□□ -1.23
SEF1P34228 YRF1-3YGR296W 5580 nt7.39□□□□□ -1.23
SEF1P34228 YRF1-6YNL339C 5580 nt7.39□□□□□ -1.23
SEF1P34228 YRF1-7YPL283C 5580 nt7.39□□□□□ -1.23
SEF1P34228 ADE5,7YGL234W 2409 nt7.39□□□□□ -1.23
SEF1P34228 tD(GUC)BtD(GUC)B 72 nt7.38□□□□□ -1.23
SEF1P34228 tD(GUC)DtD(GUC)D 72 nt7.38□□□□□ -1.23
SEF1P34228 tD(GUC)G1tD(GUC)G1 72 nt7.38□□□□□ -1.23
SEF1P34228 tD(GUC)G2tD(GUC)G2 72 nt7.38□□□□□ -1.23
SEF1P34228 tD(GUC)I1tD(GUC)I1 72 nt7.38□□□□□ -1.23
SEF1P34228 tD(GUC)I2tD(GUC)I2 72 nt7.38□□□□□ -1.23
SEF1P34228 tD(GUC)J1tD(GUC)J1 72 nt7.38□□□□□ -1.23
SEF1P34228 tD(GUC)J2tD(GUC)J2 72 nt7.38□□□□□ -1.23
SEF1P34228 tD(GUC)J3tD(GUC)J3 72 nt7.38□□□□□ -1.23
SEF1P34228 tD(GUC)J4tD(GUC)J4 72 nt7.38□□□□□ -1.23
SEF1P34228 tD(GUC)KtD(GUC)K 72 nt7.38□□□□□ -1.23
SEF1P34228 tD(GUC)L1tD(GUC)L1 72 nt7.38□□□□□ -1.23
SEF1P34228 tD(GUC)L2tD(GUC)L2 72 nt7.38□□□□□ -1.23
SEF1P34228 tD(GUC)MtD(GUC)M 72 nt7.38□□□□□ -1.23
SEF1P34228 tD(GUC)OtD(GUC)O 72 nt7.38□□□□□ -1.23
SEF1P34228 YJR149WYJR149W 1215 nt7.38□□□□□ -1.23
SEF1P34228 MFT1YML062C 1179 nt7.38□□□□□ -1.23
SEF1P34228 YPL041CYPL041C 624 nt7.38□□□□□ -1.23
SEF1P34228 THI3YDL080C 1830 nt7.37□□□□□ -1.23
SEF1P34228 GPM1YKL152C 744 nt7.37□□□□□ -1.23
SEF1P34228 LEU4YNL104C 1860 nt7.36□□□□□ -1.23
SEF1P34228 ADE2YOR128C 1716 nt7.36□□□□□ -1.23
SEF1P34228 ADE1YAR015W 921 nt7.36□□□□□ -1.23
SEF1P34228 ECM27YJR106W 2178 nt7.36□□□□□ -1.23
SEF1P34228 YDR467CYDR467C 327 nt7.35□□□□□ -1.23
SEF1P34228 YER156CYER156C 1017 nt7.35□□□□□ -1.23
SEF1P34228 DUS3YLR401C 2007 nt7.34□□□□□ -1.23
SEF1P34228 INH1YDL181W 258 nt7.34□□□□□ -1.23
SEF1P34228 tE(CUC)DtE(CUC)D 72 nt7.34□□□□□ -1.23
SEF1P34228 tE(CUC)ItE(CUC)I 72 nt7.34□□□□□ -1.23
SEF1P34228 FUS3YBL016W 1062 nt7.34□□□□□ -1.23
SEF1P34228 YJL045WYJL045W 1905 nt7.33□□□□□ -1.24
SEF1P34228 NDE1YMR145C 1683 nt7.33□□□□□ -1.24
SEF1P34228 PET494YNR045W 1470 nt7.33□□□□□ -1.24
SEF1P34228 HBS1YKR084C 1836 nt7.33□□□□□ -1.24
SEF1P34228 FRT1YOR324C 1809 nt7.32□□□□□ -1.24
SEF1P34228 CAK1YFL029C 1107 nt7.32□□□□□ -1.24
SEF1P34228 RRT14YIL127C 621 nt7.32□□□□□ -1.24
SEF1P34228 YJL043WYJL043W 774 nt7.32□□□□□ -1.24
SEF1P34228 FET5YFL041W 1869 nt7.31□□□□□ -1.24
SEF1P34228 MAM3YOL060C 2121 nt7.31□□□□□ -1.24
SEF1P34228 YLR460CYLR460C 1131 nt7.3□□□□□ -1.24
SEF1P34228 YBL095WYBL095W 813 nt7.3□□□□□ -1.24
SEF1P34228 BEM1YBR200W 1656 nt7.29□□□□□ -1.24
SEF1P34228 OCH1YGL038C 1443 nt7.29□□□□□ -1.24
SEF1P34228 PMA2YPL036W 2844 nt7.28□□□□□ -1.24
SEF1P34228 TMS1YDR105C 1422 nt7.28□□□□□ -1.24
SEF1P34228 GGC1YDL198C 903 nt7.28□□□□□ -1.24
SEF1P34228 CHS7YHR142W 951 nt7.28□□□□□ -1.24
SEF1P34228 YIR035CYIR035C 765 nt7.28□□□□□ -1.24
SEF1P34228 MET22YOL064C 1074 nt7.27□□□□□ -1.25
SEF1P34228 RPS6AYPL090C 711 nt7.27□□□□□ -1.25
SEF1P34228 RPS6BYBR181C 711 nt7.27□□□□□ -1.25
SEF1P34228 YIL177CYIL177C 5277 nt7.26□□□□□ -1.25
SEF1P34228 BXI1YNL305C 894 nt7.26□□□□□ -1.25
SEF1P34228 NUP53YMR153W 1428 nt7.26□□□□□ -1.25
SEF1P34228 TDH1YJL052W 999 nt7.25□□□□□ -1.25
SEF1P34228 RPR1RPR1 369 nt7.25□□□□□ -1.25
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