Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5U6

WDR53, WD repeat-containing protein 53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR53Q7Z5U6 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
WDR53Q7Z5U6 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
WDR53Q7Z5U6 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
WDR53Q7Z5U6 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
WDR53Q7Z5U6 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
WDR53Q7Z5U6 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
WDR53Q7Z5U6 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
WDR53Q7Z5U6 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
WDR53Q7Z5U6 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
WDR53Q7Z5U6 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
WDR53Q7Z5U6 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
WDR53Q7Z5U6 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
WDR53Q7Z5U6 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
WDR53Q7Z5U6 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
WDR53Q7Z5U6 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
WDR53Q7Z5U6 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
WDR53Q7Z5U6 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
WDR53Q7Z5U6 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
WDR53Q7Z5U6 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
WDR53Q7Z5U6 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
WDR53Q7Z5U6 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
WDR53Q7Z5U6 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
WDR53Q7Z5U6 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
WDR53Q7Z5U6 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
WDR53Q7Z5U6 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
WDR53Q7Z5U6 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
WDR53Q7Z5U6 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
WDR53Q7Z5U6 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
WDR53Q7Z5U6 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
WDR53Q7Z5U6 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
WDR53Q7Z5U6 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
WDR53Q7Z5U6 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
WDR53Q7Z5U6 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
WDR53Q7Z5U6 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
WDR53Q7Z5U6 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
WDR53Q7Z5U6 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
WDR53Q7Z5U6 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
WDR53Q7Z5U6 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
WDR53Q7Z5U6 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
WDR53Q7Z5U6 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
WDR53Q7Z5U6 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
WDR53Q7Z5U6 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
WDR53Q7Z5U6 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
WDR53Q7Z5U6 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
WDR53Q7Z5U6 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
WDR53Q7Z5U6 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
WDR53Q7Z5U6 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
WDR53Q7Z5U6 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
WDR53Q7Z5U6 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
WDR53Q7Z5U6 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
WDR53Q7Z5U6 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
WDR53Q7Z5U6 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
WDR53Q7Z5U6 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
WDR53Q7Z5U6 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
WDR53Q7Z5U6 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
WDR53Q7Z5U6 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
WDR53Q7Z5U6 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
WDR53Q7Z5U6 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
WDR53Q7Z5U6 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
WDR53Q7Z5U6 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
WDR53Q7Z5U6 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
WDR53Q7Z5U6 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
WDR53Q7Z5U6 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
WDR53Q7Z5U6 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
WDR53Q7Z5U6 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
WDR53Q7Z5U6 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
WDR53Q7Z5U6 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
WDR53Q7Z5U6 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
WDR53Q7Z5U6 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
WDR53Q7Z5U6 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
WDR53Q7Z5U6 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
WDR53Q7Z5U6 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
WDR53Q7Z5U6 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
WDR53Q7Z5U6 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
WDR53Q7Z5U6 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
WDR53Q7Z5U6 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
WDR53Q7Z5U6 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
WDR53Q7Z5U6 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
WDR53Q7Z5U6 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
WDR53Q7Z5U6 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
WDR53Q7Z5U6 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
WDR53Q7Z5U6 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
WDR53Q7Z5U6 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
WDR53Q7Z5U6 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
WDR53Q7Z5U6 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
WDR53Q7Z5U6 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
WDR53Q7Z5U6 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
WDR53Q7Z5U6 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
WDR53Q7Z5U6 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
WDR53Q7Z5U6 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
WDR53Q7Z5U6 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
WDR53Q7Z5U6 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
WDR53Q7Z5U6 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
WDR53Q7Z5U6 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
WDR53Q7Z5U6 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
WDR53Q7Z5U6 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
WDR53Q7Z5U6 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
WDR53Q7Z5U6 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
WDR53Q7Z5U6 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
WDR53Q7Z5U6 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 211.9 ms