Protein–RNA interactions for Protein: Q3C1V9

Putative uncharacterized protein ENSP00000334305, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3C1V9 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q3C1V9 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q3C1V9 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q3C1V9 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q3C1V9 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q3C1V9 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q3C1V9 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q3C1V9 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Q3C1V9 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q3C1V9 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q3C1V9 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Q3C1V9 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Q3C1V9 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Q3C1V9 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q3C1V9 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q3C1V9 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Q3C1V9 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Q3C1V9 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Q3C1V9 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Q3C1V9 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Q3C1V9 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Q3C1V9 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Q3C1V9 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Q3C1V9 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Q3C1V9 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Q3C1V9 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Q3C1V9 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Q3C1V9 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Q3C1V9 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Q3C1V9 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Q3C1V9 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Q3C1V9 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Q3C1V9 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Q3C1V9 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Q3C1V9 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Q3C1V9 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Q3C1V9 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q3C1V9 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q3C1V9 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q3C1V9 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q3C1V9 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q3C1V9 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q3C1V9 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q3C1V9 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q3C1V9 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q3C1V9 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q3C1V9 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q3C1V9 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q3C1V9 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q3C1V9 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q3C1V9 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q3C1V9 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q3C1V9 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q3C1V9 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q3C1V9 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q3C1V9 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q3C1V9 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q3C1V9 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q3C1V9 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q3C1V9 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q3C1V9 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q3C1V9 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q3C1V9 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q3C1V9 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q3C1V9 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q3C1V9 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q3C1V9 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q3C1V9 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q3C1V9 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Q3C1V9 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q3C1V9 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q3C1V9 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q3C1V9 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q3C1V9 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q3C1V9 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q3C1V9 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Q3C1V9 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q3C1V9 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q3C1V9 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q3C1V9 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q3C1V9 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q3C1V9 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q3C1V9 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q3C1V9 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q3C1V9 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q3C1V9 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q3C1V9 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q3C1V9 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q3C1V9 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q3C1V9 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q3C1V9 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q3C1V9 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q3C1V9 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q3C1V9 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q3C1V9 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q3C1V9 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q3C1V9 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q3C1V9 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q3C1V9 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q3C1V9 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.1 ms