Protein–RNA interactions for Protein: Q53H54

TRMT12, tRNA wybutosine-synthesizing protein 2 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT12Q53H54 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRMT12Q53H54 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRMT12Q53H54 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRMT12Q53H54 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRMT12Q53H54 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRMT12Q53H54 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRMT12Q53H54 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRMT12Q53H54 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRMT12Q53H54 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRMT12Q53H54 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRMT12Q53H54 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRMT12Q53H54 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRMT12Q53H54 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRMT12Q53H54 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRMT12Q53H54 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRMT12Q53H54 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRMT12Q53H54 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRMT12Q53H54 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRMT12Q53H54 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
TRMT12Q53H54 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRMT12Q53H54 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRMT12Q53H54 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRMT12Q53H54 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRMT12Q53H54 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
TRMT12Q53H54 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRMT12Q53H54 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRMT12Q53H54 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRMT12Q53H54 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRMT12Q53H54 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRMT12Q53H54 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRMT12Q53H54 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRMT12Q53H54 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRMT12Q53H54 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRMT12Q53H54 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRMT12Q53H54 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRMT12Q53H54 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRMT12Q53H54 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRMT12Q53H54 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRMT12Q53H54 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRMT12Q53H54 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRMT12Q53H54 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRMT12Q53H54 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRMT12Q53H54 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRMT12Q53H54 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRMT12Q53H54 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRMT12Q53H54 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRMT12Q53H54 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRMT12Q53H54 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRMT12Q53H54 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRMT12Q53H54 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRMT12Q53H54 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRMT12Q53H54 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRMT12Q53H54 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRMT12Q53H54 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRMT12Q53H54 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRMT12Q53H54 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRMT12Q53H54 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRMT12Q53H54 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRMT12Q53H54 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRMT12Q53H54 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRMT12Q53H54 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRMT12Q53H54 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TRMT12Q53H54 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRMT12Q53H54 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRMT12Q53H54 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRMT12Q53H54 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRMT12Q53H54 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRMT12Q53H54 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRMT12Q53H54 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRMT12Q53H54 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRMT12Q53H54 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRMT12Q53H54 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRMT12Q53H54 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TRMT12Q53H54 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRMT12Q53H54 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRMT12Q53H54 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRMT12Q53H54 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRMT12Q53H54 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRMT12Q53H54 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRMT12Q53H54 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRMT12Q53H54 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRMT12Q53H54 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRMT12Q53H54 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRMT12Q53H54 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRMT12Q53H54 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRMT12Q53H54 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRMT12Q53H54 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRMT12Q53H54 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRMT12Q53H54 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRMT12Q53H54 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRMT12Q53H54 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRMT12Q53H54 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRMT12Q53H54 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRMT12Q53H54 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TRMT12Q53H54 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRMT12Q53H54 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRMT12Q53H54 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRMT12Q53H54 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRMT12Q53H54 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TRMT12Q53H54 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms