Protein–RNA interactions for Protein: Q16394

EXT1, Exostosin-1, humanhuman

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Length 746 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXT1Q16394 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EXT1Q16394 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EXT1Q16394 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EXT1Q16394 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EXT1Q16394 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EXT1Q16394 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EXT1Q16394 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EXT1Q16394 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EXT1Q16394 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EXT1Q16394 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EXT1Q16394 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EXT1Q16394 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EXT1Q16394 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
EXT1Q16394 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EXT1Q16394 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EXT1Q16394 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EXT1Q16394 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EXT1Q16394 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EXT1Q16394 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
EXT1Q16394 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EXT1Q16394 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EXT1Q16394 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EXT1Q16394 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EXT1Q16394 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EXT1Q16394 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EXT1Q16394 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EXT1Q16394 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EXT1Q16394 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EXT1Q16394 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
EXT1Q16394 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
EXT1Q16394 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
EXT1Q16394 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
EXT1Q16394 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EXT1Q16394 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EXT1Q16394 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EXT1Q16394 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EXT1Q16394 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EXT1Q16394 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EXT1Q16394 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
EXT1Q16394 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EXT1Q16394 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EXT1Q16394 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EXT1Q16394 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EXT1Q16394 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
EXT1Q16394 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EXT1Q16394 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EXT1Q16394 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EXT1Q16394 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EXT1Q16394 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EXT1Q16394 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EXT1Q16394 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EXT1Q16394 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EXT1Q16394 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EXT1Q16394 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EXT1Q16394 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EXT1Q16394 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EXT1Q16394 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EXT1Q16394 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EXT1Q16394 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
EXT1Q16394 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EXT1Q16394 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EXT1Q16394 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EXT1Q16394 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EXT1Q16394 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EXT1Q16394 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EXT1Q16394 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EXT1Q16394 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EXT1Q16394 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EXT1Q16394 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EXT1Q16394 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EXT1Q16394 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
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EXT1Q16394 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
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EXT1Q16394 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EXT1Q16394 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EXT1Q16394 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EXT1Q16394 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EXT1Q16394 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EXT1Q16394 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EXT1Q16394 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EXT1Q16394 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EXT1Q16394 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EXT1Q16394 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EXT1Q16394 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EXT1Q16394 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EXT1Q16394 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EXT1Q16394 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EXT1Q16394 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EXT1Q16394 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EXT1Q16394 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EXT1Q16394 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EXT1Q16394 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EXT1Q16394 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EXT1Q16394 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
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