Protein–RNA interactions for Protein: Q05C16

LRRC63, Leucine-rich repeat-containing protein 63, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC63Q05C16 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRC63Q05C16 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRC63Q05C16 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRC63Q05C16 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRC63Q05C16 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRC63Q05C16 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRC63Q05C16 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRC63Q05C16 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRC63Q05C16 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRC63Q05C16 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRC63Q05C16 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRC63Q05C16 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRC63Q05C16 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRC63Q05C16 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRC63Q05C16 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRC63Q05C16 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRC63Q05C16 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRRC63Q05C16 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRRC63Q05C16 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRRC63Q05C16 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRRC63Q05C16 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRRC63Q05C16 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRRC63Q05C16 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRRC63Q05C16 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRRC63Q05C16 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
LRRC63Q05C16 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRRC63Q05C16 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRRC63Q05C16 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRRC63Q05C16 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRRC63Q05C16 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRRC63Q05C16 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRRC63Q05C16 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRC63Q05C16 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRC63Q05C16 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRC63Q05C16 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRC63Q05C16 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRC63Q05C16 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRC63Q05C16 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRC63Q05C16 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRC63Q05C16 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRC63Q05C16 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRC63Q05C16 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRC63Q05C16 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRC63Q05C16 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRC63Q05C16 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRC63Q05C16 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRC63Q05C16 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRC63Q05C16 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRC63Q05C16 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRC63Q05C16 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRC63Q05C16 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRC63Q05C16 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRC63Q05C16 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRC63Q05C16 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRC63Q05C16 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRC63Q05C16 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRC63Q05C16 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRC63Q05C16 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRC63Q05C16 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRC63Q05C16 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRC63Q05C16 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRC63Q05C16 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRC63Q05C16 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRC63Q05C16 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRC63Q05C16 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRC63Q05C16 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRC63Q05C16 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRC63Q05C16 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRC63Q05C16 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRC63Q05C16 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRC63Q05C16 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRC63Q05C16 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRC63Q05C16 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRC63Q05C16 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRC63Q05C16 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRC63Q05C16 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRC63Q05C16 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRC63Q05C16 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRC63Q05C16 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRC63Q05C16 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRC63Q05C16 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRC63Q05C16 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRC63Q05C16 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRC63Q05C16 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRC63Q05C16 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRC63Q05C16 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRC63Q05C16 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRC63Q05C16 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRC63Q05C16 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRC63Q05C16 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRC63Q05C16 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRC63Q05C16 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRC63Q05C16 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRC63Q05C16 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRC63Q05C16 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRC63Q05C16 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRC63Q05C16 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRC63Q05C16 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRC63Q05C16 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRC63Q05C16 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms