Protein–RNA interactions for Protein: P53618

COPB1, Coatomer subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB1P53618 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COPB1P53618 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
COPB1P53618 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COPB1P53618 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
COPB1P53618 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COPB1P53618 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
COPB1P53618 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
COPB1P53618 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
COPB1P53618 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COPB1P53618 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COPB1P53618 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COPB1P53618 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
COPB1P53618 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COPB1P53618 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COPB1P53618 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
COPB1P53618 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
COPB1P53618 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
COPB1P53618 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
COPB1P53618 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COPB1P53618 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COPB1P53618 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COPB1P53618 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COPB1P53618 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COPB1P53618 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
COPB1P53618 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COPB1P53618 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
COPB1P53618 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
COPB1P53618 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
COPB1P53618 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
COPB1P53618 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COPB1P53618 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
COPB1P53618 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COPB1P53618 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COPB1P53618 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COPB1P53618 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COPB1P53618 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
COPB1P53618 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COPB1P53618 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COPB1P53618 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COPB1P53618 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COPB1P53618 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
COPB1P53618 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
COPB1P53618 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
COPB1P53618 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COPB1P53618 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COPB1P53618 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COPB1P53618 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
COPB1P53618 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COPB1P53618 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COPB1P53618 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
COPB1P53618 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COPB1P53618 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COPB1P53618 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COPB1P53618 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COPB1P53618 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COPB1P53618 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COPB1P53618 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COPB1P53618 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COPB1P53618 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COPB1P53618 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COPB1P53618 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COPB1P53618 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COPB1P53618 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COPB1P53618 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COPB1P53618 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COPB1P53618 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COPB1P53618 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COPB1P53618 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COPB1P53618 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COPB1P53618 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COPB1P53618 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COPB1P53618 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
COPB1P53618 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
COPB1P53618 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COPB1P53618 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
COPB1P53618 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
COPB1P53618 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COPB1P53618 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
COPB1P53618 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
COPB1P53618 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COPB1P53618 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COPB1P53618 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COPB1P53618 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COPB1P53618 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
COPB1P53618 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
COPB1P53618 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COPB1P53618 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
COPB1P53618 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COPB1P53618 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COPB1P53618 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
COPB1P53618 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
COPB1P53618 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COPB1P53618 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
COPB1P53618 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COPB1P53618 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
COPB1P53618 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COPB1P53618 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
COPB1P53618 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COPB1P53618 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
COPB1P53618 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms