Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI3

VPREB3, Pre-B lymphocyte protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB3Q9UKI3 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VPREB3Q9UKI3 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
VPREB3Q9UKI3 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
VPREB3Q9UKI3 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
VPREB3Q9UKI3 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VPREB3Q9UKI3 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VPREB3Q9UKI3 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VPREB3Q9UKI3 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VPREB3Q9UKI3 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VPREB3Q9UKI3 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VPREB3Q9UKI3 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
VPREB3Q9UKI3 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VPREB3Q9UKI3 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VPREB3Q9UKI3 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
VPREB3Q9UKI3 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
VPREB3Q9UKI3 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.1
VPREB3Q9UKI3 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VPREB3Q9UKI3 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VPREB3Q9UKI3 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VPREB3Q9UKI3 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
VPREB3Q9UKI3 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VPREB3Q9UKI3 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VPREB3Q9UKI3 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VPREB3Q9UKI3 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VPREB3Q9UKI3 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VPREB3Q9UKI3 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VPREB3Q9UKI3 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VPREB3Q9UKI3 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VPREB3Q9UKI3 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VPREB3Q9UKI3 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VPREB3Q9UKI3 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VPREB3Q9UKI3 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
VPREB3Q9UKI3 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VPREB3Q9UKI3 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
VPREB3Q9UKI3 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VPREB3Q9UKI3 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VPREB3Q9UKI3 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VPREB3Q9UKI3 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VPREB3Q9UKI3 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VPREB3Q9UKI3 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VPREB3Q9UKI3 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VPREB3Q9UKI3 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VPREB3Q9UKI3 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VPREB3Q9UKI3 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
VPREB3Q9UKI3 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VPREB3Q9UKI3 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VPREB3Q9UKI3 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VPREB3Q9UKI3 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VPREB3Q9UKI3 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VPREB3Q9UKI3 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VPREB3Q9UKI3 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VPREB3Q9UKI3 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
VPREB3Q9UKI3 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VPREB3Q9UKI3 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
VPREB3Q9UKI3 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
VPREB3Q9UKI3 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VPREB3Q9UKI3 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VPREB3Q9UKI3 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VPREB3Q9UKI3 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VPREB3Q9UKI3 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VPREB3Q9UKI3 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VPREB3Q9UKI3 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VPREB3Q9UKI3 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VPREB3Q9UKI3 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VPREB3Q9UKI3 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
VPREB3Q9UKI3 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VPREB3Q9UKI3 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
VPREB3Q9UKI3 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VPREB3Q9UKI3 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VPREB3Q9UKI3 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VPREB3Q9UKI3 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VPREB3Q9UKI3 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VPREB3Q9UKI3 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VPREB3Q9UKI3 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VPREB3Q9UKI3 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VPREB3Q9UKI3 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VPREB3Q9UKI3 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
VPREB3Q9UKI3 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
VPREB3Q9UKI3 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
VPREB3Q9UKI3 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VPREB3Q9UKI3 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VPREB3Q9UKI3 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VPREB3Q9UKI3 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VPREB3Q9UKI3 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VPREB3Q9UKI3 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
VPREB3Q9UKI3 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VPREB3Q9UKI3 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VPREB3Q9UKI3 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VPREB3Q9UKI3 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
VPREB3Q9UKI3 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VPREB3Q9UKI3 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VPREB3Q9UKI3 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VPREB3Q9UKI3 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VPREB3Q9UKI3 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VPREB3Q9UKI3 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VPREB3Q9UKI3 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
VPREB3Q9UKI3 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VPREB3Q9UKI3 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
VPREB3Q9UKI3 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VPREB3Q9UKI3 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms