Protein–RNA interactions for Protein: Q05C16

LRRC63, Leucine-rich repeat-containing protein 63, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC63Q05C16 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRC63Q05C16 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRC63Q05C16 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRC63Q05C16 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRC63Q05C16 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRC63Q05C16 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRC63Q05C16 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRC63Q05C16 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRC63Q05C16 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRC63Q05C16 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRC63Q05C16 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRC63Q05C16 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRC63Q05C16 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRC63Q05C16 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
LRRC63Q05C16 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LRRC63Q05C16 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LRRC63Q05C16 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
LRRC63Q05C16 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
LRRC63Q05C16 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LRRC63Q05C16 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRC63Q05C16 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRC63Q05C16 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRC63Q05C16 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRC63Q05C16 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRC63Q05C16 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRC63Q05C16 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRC63Q05C16 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRC63Q05C16 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRC63Q05C16 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRC63Q05C16 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRC63Q05C16 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRC63Q05C16 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRC63Q05C16 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRC63Q05C16 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC63Q05C16 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC63Q05C16 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC63Q05C16 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC63Q05C16 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC63Q05C16 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC63Q05C16 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC63Q05C16 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC63Q05C16 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC63Q05C16 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC63Q05C16 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC63Q05C16 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC63Q05C16 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC63Q05C16 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC63Q05C16 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC63Q05C16 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC63Q05C16 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC63Q05C16 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC63Q05C16 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC63Q05C16 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC63Q05C16 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC63Q05C16 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC63Q05C16 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC63Q05C16 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC63Q05C16 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRC63Q05C16 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRC63Q05C16 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRC63Q05C16 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRC63Q05C16 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRC63Q05C16 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRC63Q05C16 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRC63Q05C16 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRC63Q05C16 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRC63Q05C16 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRC63Q05C16 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRC63Q05C16 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRC63Q05C16 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRC63Q05C16 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRC63Q05C16 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRC63Q05C16 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRC63Q05C16 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRC63Q05C16 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRC63Q05C16 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRC63Q05C16 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRC63Q05C16 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRC63Q05C16 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRC63Q05C16 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRC63Q05C16 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRC63Q05C16 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRC63Q05C16 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRC63Q05C16 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRC63Q05C16 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRC63Q05C16 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRC63Q05C16 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRC63Q05C16 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRC63Q05C16 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRC63Q05C16 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRC63Q05C16 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRC63Q05C16 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRC63Q05C16 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRC63Q05C16 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRC63Q05C16 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRC63Q05C16 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRC63Q05C16 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRC63Q05C16 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRC63Q05C16 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRC63Q05C16 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms