Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4S0

CCDC82, Coiled-coil domain-containing protein 82, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC82Q8N4S0 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CCDC82Q8N4S0 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC82Q8N4S0 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC82Q8N4S0 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC82Q8N4S0 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC82Q8N4S0 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC82Q8N4S0 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC82Q8N4S0 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC82Q8N4S0 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC82Q8N4S0 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC82Q8N4S0 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC82Q8N4S0 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC82Q8N4S0 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC82Q8N4S0 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC82Q8N4S0 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC82Q8N4S0 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC82Q8N4S0 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC82Q8N4S0 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC82Q8N4S0 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC82Q8N4S0 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC82Q8N4S0 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC82Q8N4S0 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC82Q8N4S0 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC82Q8N4S0 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC82Q8N4S0 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC82Q8N4S0 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC82Q8N4S0 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC82Q8N4S0 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC82Q8N4S0 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC82Q8N4S0 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC82Q8N4S0 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC82Q8N4S0 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC82Q8N4S0 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC82Q8N4S0 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC82Q8N4S0 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC82Q8N4S0 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC82Q8N4S0 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC82Q8N4S0 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC82Q8N4S0 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC82Q8N4S0 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC82Q8N4S0 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC82Q8N4S0 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC82Q8N4S0 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC82Q8N4S0 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC82Q8N4S0 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC82Q8N4S0 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC82Q8N4S0 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC82Q8N4S0 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC82Q8N4S0 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC82Q8N4S0 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC82Q8N4S0 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC82Q8N4S0 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC82Q8N4S0 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC82Q8N4S0 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC82Q8N4S0 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC82Q8N4S0 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC82Q8N4S0 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC82Q8N4S0 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC82Q8N4S0 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC82Q8N4S0 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC82Q8N4S0 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC82Q8N4S0 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC82Q8N4S0 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC82Q8N4S0 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC82Q8N4S0 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC82Q8N4S0 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC82Q8N4S0 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC82Q8N4S0 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC82Q8N4S0 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC82Q8N4S0 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC82Q8N4S0 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC82Q8N4S0 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC82Q8N4S0 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC82Q8N4S0 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC82Q8N4S0 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC82Q8N4S0 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CCDC82Q8N4S0 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC82Q8N4S0 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC82Q8N4S0 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC82Q8N4S0 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC82Q8N4S0 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC82Q8N4S0 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC82Q8N4S0 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC82Q8N4S0 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC82Q8N4S0 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC82Q8N4S0 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC82Q8N4S0 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC82Q8N4S0 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC82Q8N4S0 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC82Q8N4S0 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC82Q8N4S0 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC82Q8N4S0 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC82Q8N4S0 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC82Q8N4S0 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC82Q8N4S0 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC82Q8N4S0 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC82Q8N4S0 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC82Q8N4S0 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC82Q8N4S0 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC82Q8N4S0 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms