Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVX2

TMEM106C, Transmembrane protein 106C, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM106CQ9BVX2 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM106CQ9BVX2 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM106CQ9BVX2 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM106CQ9BVX2 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM106CQ9BVX2 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM106CQ9BVX2 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM106CQ9BVX2 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM106CQ9BVX2 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM106CQ9BVX2 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM106CQ9BVX2 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM106CQ9BVX2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM106CQ9BVX2 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM106CQ9BVX2 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM106CQ9BVX2 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM106CQ9BVX2 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM106CQ9BVX2 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM106CQ9BVX2 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM106CQ9BVX2 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM106CQ9BVX2 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM106CQ9BVX2 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM106CQ9BVX2 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM106CQ9BVX2 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM106CQ9BVX2 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM106CQ9BVX2 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM106CQ9BVX2 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM106CQ9BVX2 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM106CQ9BVX2 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM106CQ9BVX2 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM106CQ9BVX2 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM106CQ9BVX2 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM106CQ9BVX2 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM106CQ9BVX2 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM106CQ9BVX2 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM106CQ9BVX2 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM106CQ9BVX2 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM106CQ9BVX2 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM106CQ9BVX2 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM106CQ9BVX2 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM106CQ9BVX2 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM106CQ9BVX2 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM106CQ9BVX2 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM106CQ9BVX2 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM106CQ9BVX2 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM106CQ9BVX2 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM106CQ9BVX2 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM106CQ9BVX2 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM106CQ9BVX2 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TMEM106CQ9BVX2 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM106CQ9BVX2 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM106CQ9BVX2 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM106CQ9BVX2 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM106CQ9BVX2 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM106CQ9BVX2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM106CQ9BVX2 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM106CQ9BVX2 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM106CQ9BVX2 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM106CQ9BVX2 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM106CQ9BVX2 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM106CQ9BVX2 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM106CQ9BVX2 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM106CQ9BVX2 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM106CQ9BVX2 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM106CQ9BVX2 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM106CQ9BVX2 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM106CQ9BVX2 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM106CQ9BVX2 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM106CQ9BVX2 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM106CQ9BVX2 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM106CQ9BVX2 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM106CQ9BVX2 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM106CQ9BVX2 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM106CQ9BVX2 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM106CQ9BVX2 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM106CQ9BVX2 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM106CQ9BVX2 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM106CQ9BVX2 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM106CQ9BVX2 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM106CQ9BVX2 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM106CQ9BVX2 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM106CQ9BVX2 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM106CQ9BVX2 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM106CQ9BVX2 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM106CQ9BVX2 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM106CQ9BVX2 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM106CQ9BVX2 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM106CQ9BVX2 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM106CQ9BVX2 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM106CQ9BVX2 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM106CQ9BVX2 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM106CQ9BVX2 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM106CQ9BVX2 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM106CQ9BVX2 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM106CQ9BVX2 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM106CQ9BVX2 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM106CQ9BVX2 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM106CQ9BVX2 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM106CQ9BVX2 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM106CQ9BVX2 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM106CQ9BVX2 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM106CQ9BVX2 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms