Protein–RNA interactions for Protein: Q96PE3

INPP4A, Type I inositol 3,4-bisphosphate 4-phosphatase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 977 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INPP4AQ96PE3 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
INPP4AQ96PE3 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
INPP4AQ96PE3 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
INPP4AQ96PE3 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
INPP4AQ96PE3 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
INPP4AQ96PE3 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
INPP4AQ96PE3 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
INPP4AQ96PE3 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
INPP4AQ96PE3 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
INPP4AQ96PE3 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
INPP4AQ96PE3 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
INPP4AQ96PE3 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
INPP4AQ96PE3 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
INPP4AQ96PE3 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
INPP4AQ96PE3 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
INPP4AQ96PE3 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
INPP4AQ96PE3 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
INPP4AQ96PE3 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
INPP4AQ96PE3 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
INPP4AQ96PE3 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
INPP4AQ96PE3 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
INPP4AQ96PE3 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
INPP4AQ96PE3 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
INPP4AQ96PE3 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
INPP4AQ96PE3 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
INPP4AQ96PE3 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
INPP4AQ96PE3 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
INPP4AQ96PE3 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
INPP4AQ96PE3 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
INPP4AQ96PE3 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
INPP4AQ96PE3 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
INPP4AQ96PE3 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
INPP4AQ96PE3 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
INPP4AQ96PE3 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
INPP4AQ96PE3 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
INPP4AQ96PE3 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
INPP4AQ96PE3 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
INPP4AQ96PE3 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
INPP4AQ96PE3 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
INPP4AQ96PE3 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
INPP4AQ96PE3 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
INPP4AQ96PE3 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
INPP4AQ96PE3 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
INPP4AQ96PE3 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
INPP4AQ96PE3 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
INPP4AQ96PE3 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
INPP4AQ96PE3 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
INPP4AQ96PE3 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
INPP4AQ96PE3 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
INPP4AQ96PE3 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
INPP4AQ96PE3 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
INPP4AQ96PE3 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
INPP4AQ96PE3 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
INPP4AQ96PE3 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
INPP4AQ96PE3 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
INPP4AQ96PE3 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
INPP4AQ96PE3 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
INPP4AQ96PE3 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
INPP4AQ96PE3 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
INPP4AQ96PE3 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
INPP4AQ96PE3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
INPP4AQ96PE3 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
INPP4AQ96PE3 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
INPP4AQ96PE3 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
INPP4AQ96PE3 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
INPP4AQ96PE3 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
INPP4AQ96PE3 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
INPP4AQ96PE3 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
INPP4AQ96PE3 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
INPP4AQ96PE3 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
INPP4AQ96PE3 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
INPP4AQ96PE3 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
INPP4AQ96PE3 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
INPP4AQ96PE3 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
INPP4AQ96PE3 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
INPP4AQ96PE3 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
INPP4AQ96PE3 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
INPP4AQ96PE3 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
INPP4AQ96PE3 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
INPP4AQ96PE3 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
INPP4AQ96PE3 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
INPP4AQ96PE3 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
INPP4AQ96PE3 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
INPP4AQ96PE3 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
INPP4AQ96PE3 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
INPP4AQ96PE3 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
INPP4AQ96PE3 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
INPP4AQ96PE3 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
INPP4AQ96PE3 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
INPP4AQ96PE3 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
INPP4AQ96PE3 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
INPP4AQ96PE3 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
INPP4AQ96PE3 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
INPP4AQ96PE3 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
INPP4AQ96PE3 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
INPP4AQ96PE3 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
INPP4AQ96PE3 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
INPP4AQ96PE3 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
INPP4AQ96PE3 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
INPP4AQ96PE3 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms