Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HIF1AQ16665 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HIF1AQ16665 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HIF1AQ16665 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HIF1AQ16665 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HIF1AQ16665 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HIF1AQ16665 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HIF1AQ16665 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HIF1AQ16665 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HIF1AQ16665 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
HIF1AQ16665 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HIF1AQ16665 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
HIF1AQ16665 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HIF1AQ16665 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HIF1AQ16665 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HIF1AQ16665 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HIF1AQ16665 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HIF1AQ16665 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HIF1AQ16665 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HIF1AQ16665 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HIF1AQ16665 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HIF1AQ16665 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HIF1AQ16665 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HIF1AQ16665 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HIF1AQ16665 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HIF1AQ16665 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HIF1AQ16665 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HIF1AQ16665 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HIF1AQ16665 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HIF1AQ16665 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HIF1AQ16665 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HIF1AQ16665 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
HIF1AQ16665 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HIF1AQ16665 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HIF1AQ16665 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HIF1AQ16665 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HIF1AQ16665 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HIF1AQ16665 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HIF1AQ16665 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HIF1AQ16665 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HIF1AQ16665 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HIF1AQ16665 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HIF1AQ16665 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HIF1AQ16665 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HIF1AQ16665 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HIF1AQ16665 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HIF1AQ16665 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
HIF1AQ16665 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
HIF1AQ16665 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
HIF1AQ16665 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HIF1AQ16665 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
HIF1AQ16665 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HIF1AQ16665 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HIF1AQ16665 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HIF1AQ16665 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
HIF1AQ16665 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HIF1AQ16665 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HIF1AQ16665 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HIF1AQ16665 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HIF1AQ16665 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HIF1AQ16665 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HIF1AQ16665 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
HIF1AQ16665 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
HIF1AQ16665 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
HIF1AQ16665 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
HIF1AQ16665 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HIF1AQ16665 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HIF1AQ16665 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HIF1AQ16665 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HIF1AQ16665 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HIF1AQ16665 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HIF1AQ16665 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HIF1AQ16665 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HIF1AQ16665 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HIF1AQ16665 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HIF1AQ16665 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HIF1AQ16665 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HIF1AQ16665 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HIF1AQ16665 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HIF1AQ16665 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HIF1AQ16665 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HIF1AQ16665 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HIF1AQ16665 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HIF1AQ16665 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HIF1AQ16665 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HIF1AQ16665 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HIF1AQ16665 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HIF1AQ16665 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HIF1AQ16665 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HIF1AQ16665 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HIF1AQ16665 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HIF1AQ16665 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HIF1AQ16665 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HIF1AQ16665 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HIF1AQ16665 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HIF1AQ16665 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
HIF1AQ16665 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HIF1AQ16665 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HIF1AQ16665 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
HIF1AQ16665 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
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