Protein–RNA interactions for Protein: Q16394

EXT1, Exostosin-1, humanhuman

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Length 746 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXT1Q16394 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EXT1Q16394 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EXT1Q16394 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
EXT1Q16394 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EXT1Q16394 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EXT1Q16394 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EXT1Q16394 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EXT1Q16394 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EXT1Q16394 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EXT1Q16394 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EXT1Q16394 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EXT1Q16394 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EXT1Q16394 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EXT1Q16394 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EXT1Q16394 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EXT1Q16394 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EXT1Q16394 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EXT1Q16394 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EXT1Q16394 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EXT1Q16394 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EXT1Q16394 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EXT1Q16394 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EXT1Q16394 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EXT1Q16394 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
EXT1Q16394 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EXT1Q16394 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EXT1Q16394 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
EXT1Q16394 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EXT1Q16394 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EXT1Q16394 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EXT1Q16394 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EXT1Q16394 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
EXT1Q16394 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
EXT1Q16394 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
EXT1Q16394 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
EXT1Q16394 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
EXT1Q16394 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
EXT1Q16394 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
EXT1Q16394 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EXT1Q16394 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EXT1Q16394 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EXT1Q16394 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EXT1Q16394 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
EXT1Q16394 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EXT1Q16394 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EXT1Q16394 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EXT1Q16394 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
EXT1Q16394 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EXT1Q16394 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EXT1Q16394 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
EXT1Q16394 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
EXT1Q16394 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EXT1Q16394 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
EXT1Q16394 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EXT1Q16394 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EXT1Q16394 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EXT1Q16394 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EXT1Q16394 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EXT1Q16394 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EXT1Q16394 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EXT1Q16394 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EXT1Q16394 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EXT1Q16394 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EXT1Q16394 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EXT1Q16394 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EXT1Q16394 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EXT1Q16394 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EXT1Q16394 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EXT1Q16394 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EXT1Q16394 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EXT1Q16394 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
EXT1Q16394 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EXT1Q16394 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EXT1Q16394 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EXT1Q16394 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
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EXT1Q16394 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EXT1Q16394 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EXT1Q16394 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EXT1Q16394 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EXT1Q16394 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EXT1Q16394 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EXT1Q16394 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EXT1Q16394 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EXT1Q16394 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EXT1Q16394 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EXT1Q16394 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EXT1Q16394 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EXT1Q16394 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EXT1Q16394 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EXT1Q16394 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EXT1Q16394 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EXT1Q16394 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EXT1Q16394 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EXT1Q16394 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EXT1Q16394 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EXT1Q16394 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EXT1Q16394 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EXT1Q16394 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EXT1Q16394 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
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