Protein–RNA interactions for Protein: P59089

LINC00205, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00205, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00205P59089 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00205P59089 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00205P59089 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00205P59089 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00205P59089 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00205P59089 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00205P59089 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00205P59089 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00205P59089 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00205P59089 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00205P59089 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00205P59089 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00205P59089 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00205P59089 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00205P59089 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00205P59089 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00205P59089 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00205P59089 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00205P59089 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00205P59089 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00205P59089 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00205P59089 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00205P59089 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00205P59089 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00205P59089 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00205P59089 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00205P59089 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00205P59089 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00205P59089 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00205P59089 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00205P59089 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00205P59089 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00205P59089 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00205P59089 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00205P59089 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00205P59089 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00205P59089 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00205P59089 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00205P59089 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00205P59089 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00205P59089 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00205P59089 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00205P59089 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00205P59089 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00205P59089 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00205P59089 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00205P59089 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00205P59089 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00205P59089 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00205P59089 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00205P59089 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00205P59089 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00205P59089 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00205P59089 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00205P59089 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00205P59089 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00205P59089 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00205P59089 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00205P59089 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00205P59089 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00205P59089 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00205P59089 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00205P59089 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00205P59089 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00205P59089 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00205P59089 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00205P59089 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00205P59089 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00205P59089 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00205P59089 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00205P59089 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00205P59089 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00205P59089 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00205P59089 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00205P59089 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00205P59089 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00205P59089 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00205P59089 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00205P59089 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00205P59089 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00205P59089 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00205P59089 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00205P59089 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00205P59089 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00205P59089 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00205P59089 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00205P59089 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00205P59089 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00205P59089 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00205P59089 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00205P59089 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00205P59089 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00205P59089 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00205P59089 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00205P59089 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00205P59089 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00205P59089 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00205P59089 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00205P59089 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00205P59089 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms