Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUK2

SOHLH1, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOHLH1Q5JUK2 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SOHLH1Q5JUK2 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SOHLH1Q5JUK2 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SOHLH1Q5JUK2 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SOHLH1Q5JUK2 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SOHLH1Q5JUK2 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SOHLH1Q5JUK2 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SOHLH1Q5JUK2 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SOHLH1Q5JUK2 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SOHLH1Q5JUK2 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SOHLH1Q5JUK2 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SOHLH1Q5JUK2 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SOHLH1Q5JUK2 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SOHLH1Q5JUK2 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SOHLH1Q5JUK2 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SOHLH1Q5JUK2 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SOHLH1Q5JUK2 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SOHLH1Q5JUK2 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOHLH1Q5JUK2 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOHLH1Q5JUK2 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOHLH1Q5JUK2 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOHLH1Q5JUK2 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOHLH1Q5JUK2 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOHLH1Q5JUK2 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOHLH1Q5JUK2 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOHLH1Q5JUK2 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOHLH1Q5JUK2 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOHLH1Q5JUK2 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOHLH1Q5JUK2 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOHLH1Q5JUK2 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOHLH1Q5JUK2 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOHLH1Q5JUK2 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOHLH1Q5JUK2 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOHLH1Q5JUK2 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOHLH1Q5JUK2 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOHLH1Q5JUK2 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOHLH1Q5JUK2 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOHLH1Q5JUK2 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOHLH1Q5JUK2 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SOHLH1Q5JUK2 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOHLH1Q5JUK2 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOHLH1Q5JUK2 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOHLH1Q5JUK2 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOHLH1Q5JUK2 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOHLH1Q5JUK2 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOHLH1Q5JUK2 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOHLH1Q5JUK2 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOHLH1Q5JUK2 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOHLH1Q5JUK2 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOHLH1Q5JUK2 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOHLH1Q5JUK2 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SOHLH1Q5JUK2 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SOHLH1Q5JUK2 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SOHLH1Q5JUK2 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SOHLH1Q5JUK2 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SOHLH1Q5JUK2 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SOHLH1Q5JUK2 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SOHLH1Q5JUK2 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SOHLH1Q5JUK2 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SOHLH1Q5JUK2 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SOHLH1Q5JUK2 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SOHLH1Q5JUK2 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SOHLH1Q5JUK2 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SOHLH1Q5JUK2 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SOHLH1Q5JUK2 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SOHLH1Q5JUK2 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SOHLH1Q5JUK2 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SOHLH1Q5JUK2 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SOHLH1Q5JUK2 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SOHLH1Q5JUK2 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOHLH1Q5JUK2 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOHLH1Q5JUK2 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOHLH1Q5JUK2 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOHLH1Q5JUK2 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOHLH1Q5JUK2 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOHLH1Q5JUK2 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOHLH1Q5JUK2 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOHLH1Q5JUK2 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOHLH1Q5JUK2 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOHLH1Q5JUK2 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOHLH1Q5JUK2 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOHLH1Q5JUK2 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOHLH1Q5JUK2 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOHLH1Q5JUK2 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOHLH1Q5JUK2 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SOHLH1Q5JUK2 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOHLH1Q5JUK2 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOHLH1Q5JUK2 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOHLH1Q5JUK2 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOHLH1Q5JUK2 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOHLH1Q5JUK2 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOHLH1Q5JUK2 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOHLH1Q5JUK2 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOHLH1Q5JUK2 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOHLH1Q5JUK2 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOHLH1Q5JUK2 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOHLH1Q5JUK2 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOHLH1Q5JUK2 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SOHLH1Q5JUK2 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SOHLH1Q5JUK2 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms