Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY6

WDR88, WD repeat-containing protein 88, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR88Q6ZMY6 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
WDR88Q6ZMY6 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
WDR88Q6ZMY6 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
WDR88Q6ZMY6 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
WDR88Q6ZMY6 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
WDR88Q6ZMY6 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
WDR88Q6ZMY6 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
WDR88Q6ZMY6 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
WDR88Q6ZMY6 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
WDR88Q6ZMY6 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
WDR88Q6ZMY6 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
WDR88Q6ZMY6 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
WDR88Q6ZMY6 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
WDR88Q6ZMY6 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
WDR88Q6ZMY6 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
WDR88Q6ZMY6 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
WDR88Q6ZMY6 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
WDR88Q6ZMY6 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
WDR88Q6ZMY6 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
WDR88Q6ZMY6 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
WDR88Q6ZMY6 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
WDR88Q6ZMY6 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
WDR88Q6ZMY6 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
WDR88Q6ZMY6 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
WDR88Q6ZMY6 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
WDR88Q6ZMY6 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
WDR88Q6ZMY6 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
WDR88Q6ZMY6 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
WDR88Q6ZMY6 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
WDR88Q6ZMY6 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
WDR88Q6ZMY6 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
WDR88Q6ZMY6 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
WDR88Q6ZMY6 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
WDR88Q6ZMY6 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
WDR88Q6ZMY6 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
WDR88Q6ZMY6 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
WDR88Q6ZMY6 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
WDR88Q6ZMY6 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
WDR88Q6ZMY6 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
WDR88Q6ZMY6 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
WDR88Q6ZMY6 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
WDR88Q6ZMY6 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
WDR88Q6ZMY6 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
WDR88Q6ZMY6 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
WDR88Q6ZMY6 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
WDR88Q6ZMY6 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
WDR88Q6ZMY6 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
WDR88Q6ZMY6 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
WDR88Q6ZMY6 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
WDR88Q6ZMY6 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
WDR88Q6ZMY6 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
WDR88Q6ZMY6 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
WDR88Q6ZMY6 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
WDR88Q6ZMY6 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
WDR88Q6ZMY6 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
WDR88Q6ZMY6 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
WDR88Q6ZMY6 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
WDR88Q6ZMY6 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
WDR88Q6ZMY6 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
WDR88Q6ZMY6 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
WDR88Q6ZMY6 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
WDR88Q6ZMY6 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
WDR88Q6ZMY6 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
WDR88Q6ZMY6 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
WDR88Q6ZMY6 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
WDR88Q6ZMY6 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
WDR88Q6ZMY6 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
WDR88Q6ZMY6 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
WDR88Q6ZMY6 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
WDR88Q6ZMY6 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
WDR88Q6ZMY6 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
WDR88Q6ZMY6 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
WDR88Q6ZMY6 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
WDR88Q6ZMY6 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
WDR88Q6ZMY6 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
WDR88Q6ZMY6 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
WDR88Q6ZMY6 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
WDR88Q6ZMY6 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
WDR88Q6ZMY6 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
WDR88Q6ZMY6 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
WDR88Q6ZMY6 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
WDR88Q6ZMY6 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
WDR88Q6ZMY6 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
WDR88Q6ZMY6 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
WDR88Q6ZMY6 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
WDR88Q6ZMY6 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
WDR88Q6ZMY6 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
WDR88Q6ZMY6 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
WDR88Q6ZMY6 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
WDR88Q6ZMY6 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
WDR88Q6ZMY6 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
WDR88Q6ZMY6 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
WDR88Q6ZMY6 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
WDR88Q6ZMY6 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
WDR88Q6ZMY6 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
WDR88Q6ZMY6 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
WDR88Q6ZMY6 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
WDR88Q6ZMY6 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
WDR88Q6ZMY6 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
WDR88Q6ZMY6 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms