Protein–RNA interactions for Protein: Q16394

EXT1, Exostosin-1, humanhuman

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Length 746 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXT1Q16394 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EXT1Q16394 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EXT1Q16394 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EXT1Q16394 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EXT1Q16394 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EXT1Q16394 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EXT1Q16394 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EXT1Q16394 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
EXT1Q16394 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EXT1Q16394 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EXT1Q16394 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EXT1Q16394 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EXT1Q16394 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EXT1Q16394 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EXT1Q16394 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
EXT1Q16394 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EXT1Q16394 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EXT1Q16394 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EXT1Q16394 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EXT1Q16394 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EXT1Q16394 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EXT1Q16394 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EXT1Q16394 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EXT1Q16394 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EXT1Q16394 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
EXT1Q16394 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EXT1Q16394 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EXT1Q16394 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EXT1Q16394 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EXT1Q16394 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EXT1Q16394 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EXT1Q16394 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EXT1Q16394 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EXT1Q16394 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EXT1Q16394 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EXT1Q16394 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EXT1Q16394 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EXT1Q16394 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EXT1Q16394 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EXT1Q16394 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EXT1Q16394 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EXT1Q16394 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EXT1Q16394 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EXT1Q16394 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EXT1Q16394 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EXT1Q16394 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EXT1Q16394 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EXT1Q16394 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EXT1Q16394 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
EXT1Q16394 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EXT1Q16394 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EXT1Q16394 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EXT1Q16394 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EXT1Q16394 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
EXT1Q16394 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
EXT1Q16394 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EXT1Q16394 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EXT1Q16394 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EXT1Q16394 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EXT1Q16394 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EXT1Q16394 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EXT1Q16394 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EXT1Q16394 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EXT1Q16394 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EXT1Q16394 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
EXT1Q16394 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
EXT1Q16394 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
EXT1Q16394 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
EXT1Q16394 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
EXT1Q16394 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
EXT1Q16394 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EXT1Q16394 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EXT1Q16394 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EXT1Q16394 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
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EXT1Q16394 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EXT1Q16394 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EXT1Q16394 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EXT1Q16394 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EXT1Q16394 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EXT1Q16394 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EXT1Q16394 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
EXT1Q16394 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EXT1Q16394 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EXT1Q16394 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EXT1Q16394 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EXT1Q16394 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EXT1Q16394 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EXT1Q16394 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EXT1Q16394 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EXT1Q16394 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EXT1Q16394 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EXT1Q16394 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EXT1Q16394 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EXT1Q16394 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EXT1Q16394 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EXT1Q16394 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EXT1Q16394 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EXT1Q16394 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EXT1Q16394 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
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