Protein–RNA interactions for Protein: Q15797

SMAD1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD1Q15797 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMAD1Q15797 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMAD1Q15797 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMAD1Q15797 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMAD1Q15797 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMAD1Q15797 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMAD1Q15797 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMAD1Q15797 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SMAD1Q15797 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMAD1Q15797 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SMAD1Q15797 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMAD1Q15797 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMAD1Q15797 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SMAD1Q15797 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMAD1Q15797 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMAD1Q15797 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMAD1Q15797 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMAD1Q15797 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMAD1Q15797 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMAD1Q15797 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMAD1Q15797 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMAD1Q15797 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMAD1Q15797 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMAD1Q15797 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMAD1Q15797 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMAD1Q15797 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMAD1Q15797 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMAD1Q15797 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMAD1Q15797 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMAD1Q15797 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMAD1Q15797 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SMAD1Q15797 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMAD1Q15797 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMAD1Q15797 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMAD1Q15797 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMAD1Q15797 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMAD1Q15797 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMAD1Q15797 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SMAD1Q15797 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMAD1Q15797 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SMAD1Q15797 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMAD1Q15797 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMAD1Q15797 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMAD1Q15797 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMAD1Q15797 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMAD1Q15797 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMAD1Q15797 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMAD1Q15797 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMAD1Q15797 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMAD1Q15797 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMAD1Q15797 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMAD1Q15797 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMAD1Q15797 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMAD1Q15797 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMAD1Q15797 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMAD1Q15797 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMAD1Q15797 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMAD1Q15797 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMAD1Q15797 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SMAD1Q15797 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMAD1Q15797 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMAD1Q15797 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMAD1Q15797 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMAD1Q15797 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMAD1Q15797 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMAD1Q15797 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMAD1Q15797 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMAD1Q15797 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMAD1Q15797 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMAD1Q15797 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMAD1Q15797 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMAD1Q15797 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMAD1Q15797 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SMAD1Q15797 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SMAD1Q15797 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SMAD1Q15797 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SMAD1Q15797 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SMAD1Q15797 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SMAD1Q15797 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SMAD1Q15797 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SMAD1Q15797 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SMAD1Q15797 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SMAD1Q15797 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SMAD1Q15797 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SMAD1Q15797 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SMAD1Q15797 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SMAD1Q15797 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SMAD1Q15797 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SMAD1Q15797 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SMAD1Q15797 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SMAD1Q15797 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SMAD1Q15797 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMAD1Q15797 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMAD1Q15797 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMAD1Q15797 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMAD1Q15797 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMAD1Q15797 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMAD1Q15797 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMAD1Q15797 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMAD1Q15797 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
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