Protein–RNA interactions for Protein: P53618

COPB1, Coatomer subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB1P53618 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
COPB1P53618 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
COPB1P53618 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
COPB1P53618 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
COPB1P53618 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
COPB1P53618 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
COPB1P53618 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
COPB1P53618 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
COPB1P53618 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
COPB1P53618 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
COPB1P53618 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
COPB1P53618 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
COPB1P53618 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
COPB1P53618 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
COPB1P53618 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
COPB1P53618 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
COPB1P53618 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
COPB1P53618 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
COPB1P53618 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
COPB1P53618 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
COPB1P53618 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
COPB1P53618 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
COPB1P53618 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
COPB1P53618 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
COPB1P53618 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
COPB1P53618 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
COPB1P53618 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
COPB1P53618 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
COPB1P53618 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
COPB1P53618 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
COPB1P53618 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
COPB1P53618 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
COPB1P53618 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
COPB1P53618 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
COPB1P53618 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
COPB1P53618 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
COPB1P53618 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
COPB1P53618 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
COPB1P53618 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
COPB1P53618 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
COPB1P53618 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
COPB1P53618 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
COPB1P53618 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
COPB1P53618 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
COPB1P53618 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
COPB1P53618 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
COPB1P53618 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
COPB1P53618 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
COPB1P53618 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
COPB1P53618 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
COPB1P53618 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
COPB1P53618 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
COPB1P53618 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
COPB1P53618 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
COPB1P53618 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
COPB1P53618 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
COPB1P53618 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
COPB1P53618 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
COPB1P53618 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
COPB1P53618 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
COPB1P53618 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
COPB1P53618 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
COPB1P53618 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
COPB1P53618 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
COPB1P53618 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
COPB1P53618 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
COPB1P53618 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
COPB1P53618 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
COPB1P53618 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
COPB1P53618 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
COPB1P53618 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
COPB1P53618 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
COPB1P53618 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
COPB1P53618 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
COPB1P53618 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
COPB1P53618 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
COPB1P53618 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
COPB1P53618 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
COPB1P53618 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
COPB1P53618 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
COPB1P53618 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
COPB1P53618 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
COPB1P53618 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
COPB1P53618 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
COPB1P53618 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
COPB1P53618 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
COPB1P53618 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
COPB1P53618 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
COPB1P53618 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
COPB1P53618 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
COPB1P53618 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
COPB1P53618 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
COPB1P53618 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
COPB1P53618 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
COPB1P53618 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
COPB1P53618 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
COPB1P53618 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
COPB1P53618 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
COPB1P53618 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
COPB1P53618 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms