Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2X0

DPM3, Dolichol-phosphate mannosyltransferase subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DPM3Q9P2X0 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DPM3Q9P2X0 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DPM3Q9P2X0 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DPM3Q9P2X0 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DPM3Q9P2X0 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DPM3Q9P2X0 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DPM3Q9P2X0 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DPM3Q9P2X0 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DPM3Q9P2X0 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DPM3Q9P2X0 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DPM3Q9P2X0 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DPM3Q9P2X0 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DPM3Q9P2X0 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DPM3Q9P2X0 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DPM3Q9P2X0 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DPM3Q9P2X0 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DPM3Q9P2X0 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DPM3Q9P2X0 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DPM3Q9P2X0 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DPM3Q9P2X0 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DPM3Q9P2X0 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
DPM3Q9P2X0 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DPM3Q9P2X0 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DPM3Q9P2X0 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DPM3Q9P2X0 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DPM3Q9P2X0 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DPM3Q9P2X0 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DPM3Q9P2X0 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DPM3Q9P2X0 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DPM3Q9P2X0 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DPM3Q9P2X0 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DPM3Q9P2X0 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DPM3Q9P2X0 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DPM3Q9P2X0 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DPM3Q9P2X0 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DPM3Q9P2X0 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DPM3Q9P2X0 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DPM3Q9P2X0 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DPM3Q9P2X0 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DPM3Q9P2X0 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DPM3Q9P2X0 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DPM3Q9P2X0 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DPM3Q9P2X0 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DPM3Q9P2X0 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DPM3Q9P2X0 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DPM3Q9P2X0 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DPM3Q9P2X0 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DPM3Q9P2X0 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DPM3Q9P2X0 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DPM3Q9P2X0 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DPM3Q9P2X0 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DPM3Q9P2X0 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DPM3Q9P2X0 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DPM3Q9P2X0 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DPM3Q9P2X0 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DPM3Q9P2X0 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
DPM3Q9P2X0 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DPM3Q9P2X0 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
DPM3Q9P2X0 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DPM3Q9P2X0 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DPM3Q9P2X0 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DPM3Q9P2X0 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DPM3Q9P2X0 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
DPM3Q9P2X0 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DPM3Q9P2X0 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DPM3Q9P2X0 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DPM3Q9P2X0 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DPM3Q9P2X0 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DPM3Q9P2X0 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DPM3Q9P2X0 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DPM3Q9P2X0 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DPM3Q9P2X0 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DPM3Q9P2X0 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DPM3Q9P2X0 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DPM3Q9P2X0 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DPM3Q9P2X0 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DPM3Q9P2X0 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DPM3Q9P2X0 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DPM3Q9P2X0 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DPM3Q9P2X0 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
DPM3Q9P2X0 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DPM3Q9P2X0 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
DPM3Q9P2X0 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DPM3Q9P2X0 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DPM3Q9P2X0 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
DPM3Q9P2X0 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DPM3Q9P2X0 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DPM3Q9P2X0 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DPM3Q9P2X0 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DPM3Q9P2X0 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DPM3Q9P2X0 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DPM3Q9P2X0 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DPM3Q9P2X0 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DPM3Q9P2X0 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DPM3Q9P2X0 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DPM3Q9P2X0 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DPM3Q9P2X0 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DPM3Q9P2X0 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DPM3Q9P2X0 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DPM3Q9P2X0 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.3 ms