Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVZ3

NECAP2, Adaptin ear-binding coat-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECAP2Q9NVZ3 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NECAP2Q9NVZ3 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NECAP2Q9NVZ3 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NECAP2Q9NVZ3 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NECAP2Q9NVZ3 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NECAP2Q9NVZ3 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
NECAP2Q9NVZ3 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NECAP2Q9NVZ3 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
NECAP2Q9NVZ3 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NECAP2Q9NVZ3 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
NECAP2Q9NVZ3 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
NECAP2Q9NVZ3 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NECAP2Q9NVZ3 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NECAP2Q9NVZ3 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NECAP2Q9NVZ3 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NECAP2Q9NVZ3 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NECAP2Q9NVZ3 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NECAP2Q9NVZ3 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NECAP2Q9NVZ3 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NECAP2Q9NVZ3 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NECAP2Q9NVZ3 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NECAP2Q9NVZ3 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NECAP2Q9NVZ3 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NECAP2Q9NVZ3 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NECAP2Q9NVZ3 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NECAP2Q9NVZ3 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NECAP2Q9NVZ3 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NECAP2Q9NVZ3 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NECAP2Q9NVZ3 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NECAP2Q9NVZ3 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NECAP2Q9NVZ3 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NECAP2Q9NVZ3 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NECAP2Q9NVZ3 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NECAP2Q9NVZ3 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
NECAP2Q9NVZ3 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NECAP2Q9NVZ3 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NECAP2Q9NVZ3 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NECAP2Q9NVZ3 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NECAP2Q9NVZ3 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NECAP2Q9NVZ3 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NECAP2Q9NVZ3 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NECAP2Q9NVZ3 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NECAP2Q9NVZ3 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NECAP2Q9NVZ3 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NECAP2Q9NVZ3 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NECAP2Q9NVZ3 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NECAP2Q9NVZ3 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NECAP2Q9NVZ3 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NECAP2Q9NVZ3 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
NECAP2Q9NVZ3 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
NECAP2Q9NVZ3 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NECAP2Q9NVZ3 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NECAP2Q9NVZ3 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NECAP2Q9NVZ3 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NECAP2Q9NVZ3 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NECAP2Q9NVZ3 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NECAP2Q9NVZ3 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NECAP2Q9NVZ3 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NECAP2Q9NVZ3 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NECAP2Q9NVZ3 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NECAP2Q9NVZ3 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NECAP2Q9NVZ3 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NECAP2Q9NVZ3 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NECAP2Q9NVZ3 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NECAP2Q9NVZ3 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NECAP2Q9NVZ3 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NECAP2Q9NVZ3 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NECAP2Q9NVZ3 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NECAP2Q9NVZ3 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NECAP2Q9NVZ3 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NECAP2Q9NVZ3 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NECAP2Q9NVZ3 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NECAP2Q9NVZ3 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NECAP2Q9NVZ3 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NECAP2Q9NVZ3 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NECAP2Q9NVZ3 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NECAP2Q9NVZ3 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NECAP2Q9NVZ3 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NECAP2Q9NVZ3 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NECAP2Q9NVZ3 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NECAP2Q9NVZ3 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NECAP2Q9NVZ3 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NECAP2Q9NVZ3 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NECAP2Q9NVZ3 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NECAP2Q9NVZ3 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NECAP2Q9NVZ3 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NECAP2Q9NVZ3 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
NECAP2Q9NVZ3 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NECAP2Q9NVZ3 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NECAP2Q9NVZ3 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NECAP2Q9NVZ3 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NECAP2Q9NVZ3 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NECAP2Q9NVZ3 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
NECAP2Q9NVZ3 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NECAP2Q9NVZ3 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NECAP2Q9NVZ3 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NECAP2Q9NVZ3 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
NECAP2Q9NVZ3 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NECAP2Q9NVZ3 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
NECAP2Q9NVZ3 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms