Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HIF1AQ16665 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HIF1AQ16665 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HIF1AQ16665 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HIF1AQ16665 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HIF1AQ16665 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HIF1AQ16665 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HIF1AQ16665 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HIF1AQ16665 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HIF1AQ16665 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HIF1AQ16665 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HIF1AQ16665 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
HIF1AQ16665 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
HIF1AQ16665 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
HIF1AQ16665 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HIF1AQ16665 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HIF1AQ16665 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HIF1AQ16665 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HIF1AQ16665 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HIF1AQ16665 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HIF1AQ16665 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HIF1AQ16665 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
HIF1AQ16665 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HIF1AQ16665 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HIF1AQ16665 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HIF1AQ16665 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HIF1AQ16665 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HIF1AQ16665 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HIF1AQ16665 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HIF1AQ16665 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HIF1AQ16665 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HIF1AQ16665 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HIF1AQ16665 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HIF1AQ16665 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
HIF1AQ16665 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HIF1AQ16665 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HIF1AQ16665 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HIF1AQ16665 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HIF1AQ16665 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HIF1AQ16665 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HIF1AQ16665 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HIF1AQ16665 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HIF1AQ16665 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HIF1AQ16665 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HIF1AQ16665 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HIF1AQ16665 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HIF1AQ16665 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HIF1AQ16665 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HIF1AQ16665 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HIF1AQ16665 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HIF1AQ16665 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HIF1AQ16665 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HIF1AQ16665 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HIF1AQ16665 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HIF1AQ16665 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HIF1AQ16665 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HIF1AQ16665 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HIF1AQ16665 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HIF1AQ16665 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HIF1AQ16665 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HIF1AQ16665 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HIF1AQ16665 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HIF1AQ16665 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HIF1AQ16665 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HIF1AQ16665 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HIF1AQ16665 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HIF1AQ16665 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
HIF1AQ16665 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HIF1AQ16665 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HIF1AQ16665 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HIF1AQ16665 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HIF1AQ16665 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HIF1AQ16665 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HIF1AQ16665 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HIF1AQ16665 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HIF1AQ16665 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HIF1AQ16665 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HIF1AQ16665 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HIF1AQ16665 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HIF1AQ16665 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HIF1AQ16665 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HIF1AQ16665 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HIF1AQ16665 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HIF1AQ16665 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HIF1AQ16665 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
HIF1AQ16665 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
HIF1AQ16665 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
HIF1AQ16665 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
HIF1AQ16665 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
HIF1AQ16665 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.83
HIF1AQ16665 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HIF1AQ16665 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HIF1AQ16665 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HIF1AQ16665 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HIF1AQ16665 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HIF1AQ16665 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HIF1AQ16665 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HIF1AQ16665 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HIF1AQ16665 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HIF1AQ16665 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
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