Protein–RNA interactions for Protein: P53992

SEC24C, Protein transport protein Sec24C, humanhuman

Predictions only

Length 1,094 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24CP53992 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SEC24CP53992 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SEC24CP53992 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SEC24CP53992 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SEC24CP53992 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SEC24CP53992 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SEC24CP53992 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SEC24CP53992 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SEC24CP53992 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SEC24CP53992 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SEC24CP53992 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SEC24CP53992 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SEC24CP53992 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SEC24CP53992 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SEC24CP53992 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SEC24CP53992 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SEC24CP53992 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SEC24CP53992 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SEC24CP53992 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SEC24CP53992 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SEC24CP53992 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SEC24CP53992 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SEC24CP53992 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SEC24CP53992 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SEC24CP53992 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SEC24CP53992 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SEC24CP53992 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SEC24CP53992 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SEC24CP53992 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SEC24CP53992 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SEC24CP53992 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SEC24CP53992 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SEC24CP53992 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SEC24CP53992 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SEC24CP53992 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SEC24CP53992 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SEC24CP53992 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SEC24CP53992 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
SEC24CP53992 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SEC24CP53992 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SEC24CP53992 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SEC24CP53992 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SEC24CP53992 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SEC24CP53992 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SEC24CP53992 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SEC24CP53992 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SEC24CP53992 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SEC24CP53992 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SEC24CP53992 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SEC24CP53992 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SEC24CP53992 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SEC24CP53992 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SEC24CP53992 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
SEC24CP53992 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SEC24CP53992 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SEC24CP53992 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SEC24CP53992 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SEC24CP53992 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SEC24CP53992 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SEC24CP53992 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SEC24CP53992 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
SEC24CP53992 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SEC24CP53992 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SEC24CP53992 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SEC24CP53992 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SEC24CP53992 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SEC24CP53992 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SEC24CP53992 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
SEC24CP53992 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SEC24CP53992 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SEC24CP53992 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SEC24CP53992 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SEC24CP53992 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SEC24CP53992 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SEC24CP53992 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SEC24CP53992 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SEC24CP53992 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SEC24CP53992 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SEC24CP53992 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SEC24CP53992 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SEC24CP53992 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SEC24CP53992 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
SEC24CP53992 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SEC24CP53992 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
SEC24CP53992 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SEC24CP53992 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SEC24CP53992 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SEC24CP53992 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SEC24CP53992 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SEC24CP53992 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SEC24CP53992 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SEC24CP53992 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SEC24CP53992 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SEC24CP53992 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SEC24CP53992 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SEC24CP53992 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SEC24CP53992 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SEC24CP53992 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SEC24CP53992 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SEC24CP53992 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.8 ms