Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI3

VPREB3, Pre-B lymphocyte protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB3Q9UKI3 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VPREB3Q9UKI3 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VPREB3Q9UKI3 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VPREB3Q9UKI3 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VPREB3Q9UKI3 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VPREB3Q9UKI3 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VPREB3Q9UKI3 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VPREB3Q9UKI3 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VPREB3Q9UKI3 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VPREB3Q9UKI3 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VPREB3Q9UKI3 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VPREB3Q9UKI3 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VPREB3Q9UKI3 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VPREB3Q9UKI3 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
VPREB3Q9UKI3 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VPREB3Q9UKI3 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VPREB3Q9UKI3 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VPREB3Q9UKI3 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VPREB3Q9UKI3 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VPREB3Q9UKI3 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VPREB3Q9UKI3 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VPREB3Q9UKI3 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VPREB3Q9UKI3 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VPREB3Q9UKI3 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VPREB3Q9UKI3 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VPREB3Q9UKI3 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VPREB3Q9UKI3 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VPREB3Q9UKI3 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VPREB3Q9UKI3 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VPREB3Q9UKI3 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VPREB3Q9UKI3 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VPREB3Q9UKI3 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VPREB3Q9UKI3 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VPREB3Q9UKI3 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VPREB3Q9UKI3 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VPREB3Q9UKI3 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
VPREB3Q9UKI3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VPREB3Q9UKI3 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VPREB3Q9UKI3 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VPREB3Q9UKI3 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VPREB3Q9UKI3 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
VPREB3Q9UKI3 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VPREB3Q9UKI3 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VPREB3Q9UKI3 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
VPREB3Q9UKI3 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VPREB3Q9UKI3 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VPREB3Q9UKI3 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VPREB3Q9UKI3 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VPREB3Q9UKI3 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VPREB3Q9UKI3 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VPREB3Q9UKI3 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VPREB3Q9UKI3 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VPREB3Q9UKI3 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VPREB3Q9UKI3 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VPREB3Q9UKI3 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VPREB3Q9UKI3 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VPREB3Q9UKI3 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VPREB3Q9UKI3 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VPREB3Q9UKI3 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VPREB3Q9UKI3 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VPREB3Q9UKI3 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VPREB3Q9UKI3 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VPREB3Q9UKI3 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VPREB3Q9UKI3 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VPREB3Q9UKI3 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VPREB3Q9UKI3 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VPREB3Q9UKI3 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VPREB3Q9UKI3 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
VPREB3Q9UKI3 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VPREB3Q9UKI3 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VPREB3Q9UKI3 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VPREB3Q9UKI3 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VPREB3Q9UKI3 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VPREB3Q9UKI3 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VPREB3Q9UKI3 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VPREB3Q9UKI3 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
VPREB3Q9UKI3 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VPREB3Q9UKI3 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VPREB3Q9UKI3 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VPREB3Q9UKI3 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VPREB3Q9UKI3 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VPREB3Q9UKI3 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VPREB3Q9UKI3 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VPREB3Q9UKI3 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VPREB3Q9UKI3 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VPREB3Q9UKI3 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VPREB3Q9UKI3 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VPREB3Q9UKI3 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VPREB3Q9UKI3 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VPREB3Q9UKI3 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VPREB3Q9UKI3 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VPREB3Q9UKI3 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VPREB3Q9UKI3 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VPREB3Q9UKI3 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VPREB3Q9UKI3 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VPREB3Q9UKI3 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
VPREB3Q9UKI3 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VPREB3Q9UKI3 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VPREB3Q9UKI3 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VPREB3Q9UKI3 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.7 ms