Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWH9

SLTM, SAFB-like transcription modulator, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,034 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLTMQ9NWH9 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC14.72□□□□□ -0.052e-6■□□□□ 11.1
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SLTMQ9NWH9 AC073869.1-202ENST00000438378 3785 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.612e-6■□□□□ 11.1
SLTMQ9NWH9 ZBTB38-210ENST00000509883 2659 ntTSL 1 (best)7.83□□□□□ -1.162e-6■□□□□ 11.1
SLTMQ9NWH9 ZBTB38-212ENST00000510726 859 ntTSL 37.21□□□□□ -1.262e-6■□□□□ 11.1
SLTMQ9NWH9 ARIH1-201ENST00000379887 21681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.262e-6■□□□□ 11.1
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SLTMQ9NWH9 ZBTB38-202ENST00000441582 3662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.512e-6■□□□□ 11.1
SLTMQ9NWH9 ZBTB38-201ENST00000321464 3588 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.562e-6■□□□□ 11.1
SLTMQ9NWH9 PRKRIP1-207ENST00000482549 1625 ntTSL 1 (best)26.75■■□□□ 1.874e-10■□□□□ 11.1
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SLTMQ9NWH9 PRKRIP1-205ENST00000477886 986 ntTSL 1 (best)24.57■■□□□ 1.524e-10■□□□□ 11.1
SLTMQ9NWH9 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.634e-10■□□□□ 11.1
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SLTMQ9NWH9 PRKRIP1-202ENST00000462601 884 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.254e-10■□□□□ 11.1
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SLTMQ9NWH9 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -04e-6■□□□□ 11.1
SLTMQ9NWH9 THUMPD3-AS1-203ENST00000469846 670 ntTSL 311.53□□□□□ -0.564e-6■□□□□ 11.1
SLTMQ9NWH9 THUMPD3-AS1-205ENST00000481221 683 ntTSL 3 BASIC8.63□□□□□ -1.034e-6■□□□□ 11.1
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SLTMQ9NWH9 THUMPD3-AS1-207ENST00000494680 544 ntTSL 53.88□□□□□ -1.794e-6■□□□□ 11.1
SLTMQ9NWH9 AL121845.3-203ENST00000496820 507 ntTSL 523.92■■□□□ 1.423e-8■□□□□ 11.1
SLTMQ9NWH9 AL121845.3-202ENST00000632538 872 ntAPPRIS P1 TSL 322.06■■□□□ 1.123e-8■□□□□ 11.1
SLTMQ9NWH9 SHROOM1-204ENST00000440118 1080 ntTSL 220.56■□□□□ 0.883e-6■□□□□ 11.1
SLTMQ9NWH9 ZNF444-204ENST00000587236 5565 ntTSL 218.09■□□□□ 0.493e-6■□□□□ 11.1
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SLTMQ9NWH9 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.013e-6■□□□□ 11.1
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SLTMQ9NWH9 SLC17A9-205ENST00000483113 1624 ntTSL 315.67■□□□□ 0.12e-17■□□□□ 11.1
SLTMQ9NWH9 AC087380.1-204ENST00000418729 1026 ntTSL 1 (best)12.77□□□□□ -0.375e-9■□□□□ 11.1
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SLTMQ9NWH9 HBE1-202ENST00000380237 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.855e-9■□□□□ 11.1
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SLTMQ9NWH9 HBE1-203ENST00000396895 578 ntTSL 55.71□□□□□ -1.55e-9■□□□□ 11.1
SLTMQ9NWH9 BRD2-219ENST00000607833 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)14.4□□□□□ -0.113e-8■□□□□ 11.1
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SLTMQ9NWH9 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.482e-6■□□□□ 11
SLTMQ9NWH9 CDC14B-209ENST00000474602 4960 ntTSL 1 (best)23.74■■□□□ 1.395e-7■□□□□ 11
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SLTMQ9NWH9 ANO10-201ENST00000292246 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.696e-7■□□□□ 11
SLTMQ9NWH9 ANO10-212ENST00000448045 583 ntTSL 38.1□□□□□ -1.116e-7■□□□□ 11
SLTMQ9NWH9 PPP2R5C-213ENST00000554504 448 ntTSL 35.57□□□□□ -1.526e-7■□□□□ 11
SLTMQ9NWH9 PAX8-AS1-203ENST00000431844 597 ntTSL 418.19■□□□□ 0.59e-8■□□□□ 11
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SLTMQ9NWH9 PAX8-AS1-219ENST00000623306 840 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.49e-8■□□□□ 11
SLTMQ9NWH9 PAX8-AS1-217ENST00000617509 627 ntTSL 4 BASIC12.08□□□□□ -0.489e-8■□□□□ 11
SLTMQ9NWH9 PAX8-AS1-215ENST00000616073 512 ntTSL 410.65□□□□□ -0.79e-8■□□□□ 11
SLTMQ9NWH9 PAX8-AS1-207ENST00000451179 1196 ntTSL 1 (best)10.49□□□□□ -0.739e-8■□□□□ 11
SLTMQ9NWH9 PAX8-AS1-201ENST00000333145 2319 ntTSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.949e-8■□□□□ 11
SLTMQ9NWH9 PAX8-AS1-208ENST00000456685 1207 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.989e-8■□□□□ 11
SLTMQ9NWH9 PAX8-AS1-202ENST00000422956 11799 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.069e-8■□□□□ 11
SLTMQ9NWH9 PAX8-AS1-210ENST00000553869 560 ntTSL 58.4□□□□□ -1.069e-8■□□□□ 11
SLTMQ9NWH9 PAX8-AS1-212ENST00000556070 567 ntTSL 45.89□□□□□ -1.479e-8■□□□□ 11
SLTMQ9NWH9 PAX8-AS1-220ENST00000624706 434 ntTSL 53.92□□□□□ -1.789e-8■□□□□ 11
SLTMQ9NWH9 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.28e-6■□□□□ 11
SLTMQ9NWH9 JUND-202ENST00000600972 500 ntTSL 226.65■■□□□ 1.868e-6■□□□□ 11
SLTMQ9NWH9 TRNP1-202ENST00000531285 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 221.96■■□□□ 1.119e-7■□□□□ 11
SLTMQ9NWH9 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.832e-6■□□□□ 11
SLTMQ9NWH9 SMPD4-207ENST00000435455 842 ntTSL 516.89■□□□□ 0.292e-6■□□□□ 11
SLTMQ9NWH9 SMPD4-204ENST00000430682 820 ntTSL 312.95□□□□□ -0.342e-6■□□□□ 11
SLTMQ9NWH9 SMPD4-213ENST00000454468 3586 ntTSL 1 (best)12.58□□□□□ -0.42e-6■□□□□ 11
SLTMQ9NWH9 SMPD4-212ENST00000451542 796 ntTSL 512.55□□□□□ -0.42e-6■□□□□ 11
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SLTMQ9NWH9 SMPD4-217ENST00000473720 555 ntTSL 412.34□□□□□ -0.432e-6■□□□□ 11
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