RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482549.5

PRKRIP1-207, Transcript of PRKR interacting protein 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRKRIP1, Length 1,625 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKRIP1-207ENST00000482549 NISCHQ9Y2I1 1504 aa56.93■■■■■ 6.7
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PRKRIP1-207ENST00000482549 ABCC9O60706 1549 aa48.83■■■■■ 5.41
PRKRIP1-207ENST00000482549 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP47.9■■■■■ 5.26
PRKRIP1-207ENST00000482549 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa47.17■■■■■ 5.14
PRKRIP1-207ENST00000482549 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa47.08■■■■■ 5.13
PRKRIP1-207ENST00000482549 NACADO15069 1562 aa47.03■■■■■ 5.12
PRKRIP1-207ENST00000482549 DCAF8L2P0C7V8 631 aa47.01■■■■■ 5.12
PRKRIP1-207ENST00000482549 MYO15BQ96JP2 1530 aa46.78■■■■■ 5.08
PRKRIP1-207ENST00000482549 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa46.42■■■■■ 5.02
PRKRIP1-207ENST00000482549 UNC13AQ9UPW8 1703 aa46■■■■■ 4.95
PRKRIP1-207ENST00000482549 SCRIBQ14160 1630 aa45.69■■■■■ 4.9
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PRKRIP1-207ENST00000482549 DNAJC5BQ9UF47 199 aa44.56■■■■■ 4.72
PRKRIP1-207ENST00000482549 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP44.4■■■■■ 4.7
PRKRIP1-207ENST00000482549 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP44.21■■■■■ 4.67
PRKRIP1-207ENST00000482549 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa44.2■■■■■ 4.67
PRKRIP1-207ENST00000482549 CECR2Q9BXF3 1484 aa44.13■■■■■ 4.65
PRKRIP1-207ENST00000482549 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP43.97■■■■■ 4.63
PRKRIP1-207ENST00000482549 MROH2BQ7Z745 1585 aa43.94■■■■■ 4.62
PRKRIP1-207ENST00000482549 SMARCA4P51532 1647 aa43.72■■■■■ 4.59
PRKRIP1-207ENST00000482549 WIZO95785 1651 aa43.6■■■■■ 4.57
PRKRIP1-207ENST00000482549 SMARCA2P51531 1590 aa43.42■■■■■ 4.54
PRKRIP1-207ENST00000482549 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa43.39■■■■■ 4.54
PRKRIP1-207ENST00000482549 NCAPD3P42695 1498 aa43.35■■■■■ 4.53
PRKRIP1-207ENST00000482549 PEG3Q9GZU2 1588 aa43.26■■■■■ 4.52
PRKRIP1-207ENST00000482549 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP43.22■■■■■ 4.51
PRKRIP1-207ENST00000482549 HMGXB3Q12766 1538 aa43.21■■■■■ 4.51
PRKRIP1-207ENST00000482549 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP43.11■■■■■ 4.49
PRKRIP1-207ENST00000482549 CHIC1Q5VXU3 224 aa43.06■■■■■ 4.48
PRKRIP1-207ENST00000482549 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.71■■■■■ 4.43
PRKRIP1-207ENST00000482549 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.26■■■■■ 4.36
PRKRIP1-207ENST00000482549 NESP48681 1621 aa42.26■■■■■ 4.36
PRKRIP1-207ENST00000482549 TRIM41Q8WV44 630 aa42.17■■■■■ 4.34
PRKRIP1-207ENST00000482549 ERCC6Q03468 1493 aa42.15■■■■■ 4.34
PRKRIP1-207ENST00000482549 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.1■■■■■ 4.33
PRKRIP1-207ENST00000482549 PDS5BQ9NTI5 1447 aa41.95■■■■■ 4.31
PRKRIP1-207ENST00000482549 CFTRP13569 1480 aa41.88■■■■■ 4.29
PRKRIP1-207ENST00000482549 ABCC8Q09428 1581 aa41.86■■■■■ 4.29
PRKRIP1-207ENST00000482549 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa41.84■■■■■ 4.29
PRKRIP1-207ENST00000482549 PRDM2Q13029 1718 aa41.69■■■■■ 4.26
PRKRIP1-207ENST00000482549 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.65■■■■■ 4.26
PRKRIP1-207ENST00000482549 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP41.65■■■■■ 4.26
PRKRIP1-207ENST00000482549 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.63■■■■■ 4.25
PRKRIP1-207ENST00000482549 CUX2O14529 1486 aa41.63■■■■■ 4.25
PRKRIP1-207ENST00000482549 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.62■■■■■ 4.25
PRKRIP1-207ENST00000482549 MRC2Q9UBG0 1479 aa41.51■■■■■ 4.24
PRKRIP1-207ENST00000482549 SYNJ1O43426 1573 aa41.43■■■■■ 4.22
PRKRIP1-207ENST00000482549 WDR62O43379 1518 aa41.37■■■■■ 4.21
PRKRIP1-207ENST00000482549 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa41.33■■■■■ 4.21
PRKRIP1-207ENST00000482549 TOP2BQ02880 1626 aa41.31■■■■■ 4.2
PRKRIP1-207ENST00000482549 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP41.29■■■■■ 4.2
PRKRIP1-207ENST00000482549 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.28■■■■■ 4.2
PRKRIP1-207ENST00000482549 EEA1Q15075 1411 aa41.24■■■■■ 4.19
PRKRIP1-207ENST00000482549 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP41.19■■■■■ 4.18
PRKRIP1-207ENST00000482549 SOGA1O94964 1423 aa41.11■■■■■ 4.17
PRKRIP1-207ENST00000482549 CUX1P39880 1505 aa41.09■■■■■ 4.17
PRKRIP1-207ENST00000482549 TOPBP1Q92547 1522 aa40.99■■■■■ 4.15
PRKRIP1-207ENST00000482549 DNMBPQ6XZF7 1577 aa40.98■■■■■ 4.15
PRKRIP1-207ENST00000482549 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa40.92■■■■■ 4.14
PRKRIP1-207ENST00000482549 CSRNP3Q8WYN3 585 aa40.86■■■■■ 4.13
PRKRIP1-207ENST00000482549 IFT140Q96RY7 1462 aa40.72■■■■■ 4.11
PRKRIP1-207ENST00000482549 KIF21BO75037 1637 aa40.68■■■■■ 4.1
PRKRIP1-207ENST00000482549 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP40.64■■■■■ 4.1
PRKRIP1-207ENST00000482549 GOLGA3Q08378 1498 aa40.63■■■■■ 4.1
PRKRIP1-207ENST00000482549 EHMT2Q96KQ7 1210 aa40.62■■■■■ 4.09
PRKRIP1-207ENST00000482549 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.61■■■■■ 4.09
PRKRIP1-207ENST00000482549 KIF27Q86VH2 1401 aa40.58■■■■■ 4.09
PRKRIP1-207ENST00000482549 TNIKQ9UKE5 1360 aa40.54■■■■■ 4.08
PRKRIP1-207ENST00000482549 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP40.52■■■■■ 4.08
PRKRIP1-207ENST00000482549 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP40.47■■■■■ 4.07
PRKRIP1-207ENST00000482549 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.44■■■■■ 4.06
PRKRIP1-207ENST00000482549 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP40.4■■■■■ 4.06
PRKRIP1-207ENST00000482549 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.38■■■■■ 4.05
PRKRIP1-207ENST00000482549 PRXQ9BXM0 1461 aa40.36■■■■■ 4.05
PRKRIP1-207ENST00000482549 UBTFP17480 764 aaKnown RBP40.32■■■■■ 4.05
PRKRIP1-207ENST00000482549 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.3■■■■■ 4.04
PRKRIP1-207ENST00000482549 CEP162Q5TB80 1403 aa40.3■■■■■ 4.04
PRKRIP1-207ENST00000482549 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa40.29■■■■■ 4.04
PRKRIP1-207ENST00000482549 WDR97A6NE52 1622 aa40.29■■■■■ 4.04
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PRKRIP1-207ENST00000482549 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa40.11■■■■■ 4.01
PRKRIP1-207ENST00000482549 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.03■■■■■ 4
PRKRIP1-207ENST00000482549 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.03■■■■■ 4
PRKRIP1-207ENST00000482549 GRIN2BQ13224 1484 aa40.02■■■■■ 4
PRKRIP1-207ENST00000482549 PBRM1Q86U86 1689 aa39.99■■■■□ 3.99
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PRKRIP1-207ENST00000482549 CLIP1P30622 1438 aa39.95■■■■□ 3.99
PRKRIP1-207ENST00000482549 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa39.94■■■■□ 3.98
PRKRIP1-207ENST00000482549 CUL7Q14999 1698 aa39.93■■■■□ 3.98
PRKRIP1-207ENST00000482549 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP39.91■■■■□ 3.98
PRKRIP1-207ENST00000482549 OSCARQ8IYS5 282 aa39.89■■■■□ 3.98
PRKRIP1-207ENST00000482549 CHD1O14646 1710 aa39.87■■■■□ 3.97
PRKRIP1-207ENST00000482549 FBLN2P98095 1184 aa39.8■■■■□ 3.96
PRKRIP1-207ENST00000482549 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP39.76■■■■□ 3.96
PRKRIP1-207ENST00000482549 SYNJ2O15056 1496 aa39.75■■■■□ 3.95
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