Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVX2

TMEM106C, Transmembrane protein 106C, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM106CQ9BVX2 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM106CQ9BVX2 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM106CQ9BVX2 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM106CQ9BVX2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM106CQ9BVX2 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM106CQ9BVX2 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM106CQ9BVX2 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM106CQ9BVX2 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM106CQ9BVX2 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM106CQ9BVX2 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM106CQ9BVX2 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM106CQ9BVX2 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM106CQ9BVX2 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM106CQ9BVX2 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM106CQ9BVX2 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM106CQ9BVX2 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM106CQ9BVX2 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM106CQ9BVX2 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM106CQ9BVX2 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM106CQ9BVX2 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM106CQ9BVX2 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM106CQ9BVX2 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM106CQ9BVX2 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM106CQ9BVX2 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM106CQ9BVX2 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM106CQ9BVX2 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM106CQ9BVX2 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM106CQ9BVX2 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM106CQ9BVX2 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM106CQ9BVX2 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM106CQ9BVX2 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM106CQ9BVX2 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM106CQ9BVX2 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM106CQ9BVX2 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM106CQ9BVX2 AC012183.1-201ENST00000625197 499 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM106CQ9BVX2 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM106CQ9BVX2 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM106CQ9BVX2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM106CQ9BVX2 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM106CQ9BVX2 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM106CQ9BVX2 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM106CQ9BVX2 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM106CQ9BVX2 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM106CQ9BVX2 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM106CQ9BVX2 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM106CQ9BVX2 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM106CQ9BVX2 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM106CQ9BVX2 DCD-201ENST00000293371 645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM106CQ9BVX2 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM106CQ9BVX2 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM106CQ9BVX2 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM106CQ9BVX2 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM106CQ9BVX2 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM106CQ9BVX2 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM106CQ9BVX2 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM106CQ9BVX2 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM106CQ9BVX2 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM106CQ9BVX2 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM106CQ9BVX2 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM106CQ9BVX2 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM106CQ9BVX2 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM106CQ9BVX2 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM106CQ9BVX2 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM106CQ9BVX2 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM106CQ9BVX2 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM106CQ9BVX2 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM106CQ9BVX2 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM106CQ9BVX2 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM106CQ9BVX2 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM106CQ9BVX2 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM106CQ9BVX2 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM106CQ9BVX2 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM106CQ9BVX2 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM106CQ9BVX2 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM106CQ9BVX2 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM106CQ9BVX2 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM106CQ9BVX2 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM106CQ9BVX2 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM106CQ9BVX2 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM106CQ9BVX2 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM106CQ9BVX2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM106CQ9BVX2 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM106CQ9BVX2 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM106CQ9BVX2 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM106CQ9BVX2 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM106CQ9BVX2 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM106CQ9BVX2 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM106CQ9BVX2 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM106CQ9BVX2 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM106CQ9BVX2 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM106CQ9BVX2 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM106CQ9BVX2 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM106CQ9BVX2 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM106CQ9BVX2 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM106CQ9BVX2 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM106CQ9BVX2 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM106CQ9BVX2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM106CQ9BVX2 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM106CQ9BVX2 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM106CQ9BVX2 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.6 ms