Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4S0

CCDC82, Coiled-coil domain-containing protein 82, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC82Q8N4S0 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC82Q8N4S0 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC82Q8N4S0 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC82Q8N4S0 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC82Q8N4S0 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC82Q8N4S0 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC82Q8N4S0 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC82Q8N4S0 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC82Q8N4S0 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC82Q8N4S0 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC82Q8N4S0 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC82Q8N4S0 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC82Q8N4S0 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC82Q8N4S0 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC82Q8N4S0 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC82Q8N4S0 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC82Q8N4S0 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC82Q8N4S0 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC82Q8N4S0 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC82Q8N4S0 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC82Q8N4S0 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC82Q8N4S0 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC82Q8N4S0 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC82Q8N4S0 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC82Q8N4S0 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC82Q8N4S0 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC82Q8N4S0 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC82Q8N4S0 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC82Q8N4S0 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC82Q8N4S0 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC82Q8N4S0 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC82Q8N4S0 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC82Q8N4S0 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC82Q8N4S0 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC82Q8N4S0 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC82Q8N4S0 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC82Q8N4S0 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC82Q8N4S0 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC82Q8N4S0 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC82Q8N4S0 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC82Q8N4S0 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC82Q8N4S0 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC82Q8N4S0 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC82Q8N4S0 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC82Q8N4S0 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC82Q8N4S0 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC82Q8N4S0 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC82Q8N4S0 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC82Q8N4S0 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC82Q8N4S0 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC82Q8N4S0 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC82Q8N4S0 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC82Q8N4S0 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC82Q8N4S0 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC82Q8N4S0 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC82Q8N4S0 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC82Q8N4S0 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC82Q8N4S0 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC82Q8N4S0 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC82Q8N4S0 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC82Q8N4S0 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC82Q8N4S0 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC82Q8N4S0 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC82Q8N4S0 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC82Q8N4S0 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC82Q8N4S0 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC82Q8N4S0 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC82Q8N4S0 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC82Q8N4S0 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC82Q8N4S0 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC82Q8N4S0 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC82Q8N4S0 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC82Q8N4S0 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC82Q8N4S0 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC82Q8N4S0 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
CCDC82Q8N4S0 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC82Q8N4S0 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC82Q8N4S0 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC82Q8N4S0 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC82Q8N4S0 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC82Q8N4S0 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC82Q8N4S0 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC82Q8N4S0 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC82Q8N4S0 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC82Q8N4S0 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC82Q8N4S0 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC82Q8N4S0 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC82Q8N4S0 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC82Q8N4S0 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC82Q8N4S0 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC82Q8N4S0 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC82Q8N4S0 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC82Q8N4S0 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC82Q8N4S0 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC82Q8N4S0 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC82Q8N4S0 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC82Q8N4S0 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC82Q8N4S0 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC82Q8N4S0 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC82Q8N4S0 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.4 ms