Protein–RNA interactions for Protein: Q8N205

SYNE4, Nesprin-4, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4Q8N205 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYNE4Q8N205 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYNE4Q8N205 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYNE4Q8N205 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYNE4Q8N205 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYNE4Q8N205 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYNE4Q8N205 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYNE4Q8N205 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYNE4Q8N205 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYNE4Q8N205 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYNE4Q8N205 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYNE4Q8N205 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYNE4Q8N205 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYNE4Q8N205 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYNE4Q8N205 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYNE4Q8N205 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SYNE4Q8N205 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYNE4Q8N205 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SYNE4Q8N205 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYNE4Q8N205 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYNE4Q8N205 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYNE4Q8N205 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYNE4Q8N205 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYNE4Q8N205 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYNE4Q8N205 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYNE4Q8N205 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYNE4Q8N205 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYNE4Q8N205 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYNE4Q8N205 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYNE4Q8N205 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYNE4Q8N205 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYNE4Q8N205 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SYNE4Q8N205 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYNE4Q8N205 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYNE4Q8N205 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYNE4Q8N205 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYNE4Q8N205 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYNE4Q8N205 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYNE4Q8N205 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYNE4Q8N205 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYNE4Q8N205 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYNE4Q8N205 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYNE4Q8N205 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYNE4Q8N205 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYNE4Q8N205 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYNE4Q8N205 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYNE4Q8N205 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYNE4Q8N205 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYNE4Q8N205 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYNE4Q8N205 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYNE4Q8N205 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYNE4Q8N205 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYNE4Q8N205 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYNE4Q8N205 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYNE4Q8N205 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYNE4Q8N205 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SYNE4Q8N205 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SYNE4Q8N205 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYNE4Q8N205 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYNE4Q8N205 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYNE4Q8N205 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYNE4Q8N205 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYNE4Q8N205 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SYNE4Q8N205 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SYNE4Q8N205 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYNE4Q8N205 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYNE4Q8N205 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYNE4Q8N205 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYNE4Q8N205 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYNE4Q8N205 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYNE4Q8N205 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYNE4Q8N205 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYNE4Q8N205 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SYNE4Q8N205 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SYNE4Q8N205 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SYNE4Q8N205 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SYNE4Q8N205 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SYNE4Q8N205 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SYNE4Q8N205 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SYNE4Q8N205 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SYNE4Q8N205 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SYNE4Q8N205 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SYNE4Q8N205 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SYNE4Q8N205 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SYNE4Q8N205 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SYNE4Q8N205 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SYNE4Q8N205 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SYNE4Q8N205 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SYNE4Q8N205 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYNE4Q8N205 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYNE4Q8N205 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYNE4Q8N205 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYNE4Q8N205 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYNE4Q8N205 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYNE4Q8N205 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SYNE4Q8N205 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYNE4Q8N205 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYNE4Q8N205 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SYNE4Q8N205 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYNE4Q8N205 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms