Protein–RNA interactions for Protein: Q15797

SMAD1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD1Q15797 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMAD1Q15797 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMAD1Q15797 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMAD1Q15797 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMAD1Q15797 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMAD1Q15797 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMAD1Q15797 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMAD1Q15797 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMAD1Q15797 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMAD1Q15797 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMAD1Q15797 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMAD1Q15797 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMAD1Q15797 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMAD1Q15797 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMAD1Q15797 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMAD1Q15797 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMAD1Q15797 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMAD1Q15797 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMAD1Q15797 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMAD1Q15797 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMAD1Q15797 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMAD1Q15797 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMAD1Q15797 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMAD1Q15797 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMAD1Q15797 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMAD1Q15797 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMAD1Q15797 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMAD1Q15797 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMAD1Q15797 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMAD1Q15797 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMAD1Q15797 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMAD1Q15797 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMAD1Q15797 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMAD1Q15797 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMAD1Q15797 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMAD1Q15797 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMAD1Q15797 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMAD1Q15797 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMAD1Q15797 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMAD1Q15797 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMAD1Q15797 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMAD1Q15797 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMAD1Q15797 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMAD1Q15797 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMAD1Q15797 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMAD1Q15797 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMAD1Q15797 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMAD1Q15797 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMAD1Q15797 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMAD1Q15797 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMAD1Q15797 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMAD1Q15797 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMAD1Q15797 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMAD1Q15797 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMAD1Q15797 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMAD1Q15797 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMAD1Q15797 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMAD1Q15797 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMAD1Q15797 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMAD1Q15797 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMAD1Q15797 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMAD1Q15797 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMAD1Q15797 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMAD1Q15797 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SMAD1Q15797 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMAD1Q15797 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMAD1Q15797 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMAD1Q15797 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMAD1Q15797 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMAD1Q15797 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMAD1Q15797 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMAD1Q15797 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMAD1Q15797 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMAD1Q15797 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMAD1Q15797 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMAD1Q15797 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMAD1Q15797 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMAD1Q15797 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMAD1Q15797 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMAD1Q15797 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SMAD1Q15797 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMAD1Q15797 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMAD1Q15797 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMAD1Q15797 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMAD1Q15797 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMAD1Q15797 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SMAD1Q15797 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMAD1Q15797 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMAD1Q15797 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMAD1Q15797 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMAD1Q15797 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMAD1Q15797 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMAD1Q15797 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMAD1Q15797 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMAD1Q15797 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMAD1Q15797 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMAD1Q15797 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMAD1Q15797 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMAD1Q15797 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMAD1Q15797 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
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