Protein–RNA interactions for Protein: Q12072

IOC2, ISWI one complex protein 2, yeastyeast

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Length 812 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
IOC2Q12072 NUP192YJL039C 5052 nt2.01□□□□□ -2.09
IOC2Q12072 SWI4YER111C 3282 nt2□□□□□ -2.09
IOC2Q12072 YNL054W-BYNL054W-B 5250 nt2□□□□□ -2.09
IOC2Q12072 snR77snR77 88 nt1.98□□□□□ -2.09
IOC2Q12072 NUP145YGL092W 3954 nt1.98□□□□□ -2.09
IOC2Q12072 TMA7YLR262C-A 195 nt1.96□□□□□ -2.1
IOC2Q12072 SEC31YDL195W 3822 nt1.92□□□□□ -2.1
IOC2Q12072 YNL284C-BYNL284C-B 5268 nt1.92□□□□□ -2.1
IOC2Q12072 tT(UGU)HtT(UGU)H 72 nt1.9□□□□□ -2.11
IOC2Q12072 YMR247W-AYMR247W-A 144 nt1.9□□□□□ -2.11
IOC2Q12072 FAB1YFR019W 6837 nt1.89□□□□□ -2.11
IOC2Q12072 PMD1YER132C 5262 nt1.89□□□□□ -2.11
IOC2Q12072 LAA1YJL207C 6045 nt1.88□□□□□ -2.11
IOC2Q12072 VPS15YBR097W 4365 nt1.88□□□□□ -2.11
IOC2Q12072 FIG2YCR089W 4830 nt1.87□□□□□ -2.11
IOC2Q12072 MON2YNL297C 4911 nt1.87□□□□□ -2.11
IOC2Q12072 YOR093CYOR093C 4947 nt1.86□□□□□ -2.11
IOC2Q12072 TRM732YMR259C 4263 nt1.85□□□□□ -2.11
IOC2Q12072 NUP188YML103C 4968 nt1.85□□□□□ -2.11
IOC2Q12072 MEC1YBR136W 7107 nt1.83□□□□□ -2.12
IOC2Q12072 PEP1YBL017C 4740 nt1.83□□□□□ -2.12
IOC2Q12072 YOR316C-AYOR316C-A 210 nt1.83□□□□□ -2.12
IOC2Q12072 IRA1YBR140C 9279 nt1.82□□□□□ -2.12
IOC2Q12072 SSK2YNR031C 4740 nt1.82□□□□□ -2.12
IOC2Q12072 VAM6YDL077C 3150 nt1.8□□□□□ -2.12
IOC2Q12072 MYO1YHR023W 5787 nt1.79□□□□□ -2.12
IOC2Q12072 YGR130CYGR130C 2451 nt1.78□□□□□ -2.12
IOC2Q12072 DNF3YMR162C 4971 nt1.77□□□□□ -2.13
IOC2Q12072 SOV1YMR066W 2697 nt1.77□□□□□ -2.13
IOC2Q12072 SBH2YER019C-A 267 nt1.77□□□□□ -2.13
IOC2Q12072 YMR272W-BYMR272W-B 108 nt1.77□□□□□ -2.13
IOC2Q12072 CDC39YCR093W 6327 nt1.76□□□□□ -2.13
IOC2Q12072 BST1YFL025C 3090 nt1.7□□□□□ -2.14
IOC2Q12072 YPR117WYPR117W 7470 nt1.69□□□□□ -2.14
IOC2Q12072 CFT1YDR301W 4074 nt1.66□□□□□ -2.14
IOC2Q12072 SPT7YBR081C 3999 nt1.65□□□□□ -2.14
IOC2Q12072 YOR192C-BYOR192C-B 5313 nt1.64□□□□□ -2.15
IOC2Q12072 tC(GCA)QtC(GCA)Q 76 nt1.62□□□□□ -2.15
IOC2Q12072 LTE1YAL024C 4308 nt1.59□□□□□ -2.15
IOC2Q12072 tQ(UUG)E2tQ(UUG)E2 72 nt1.56□□□□□ -2.16
IOC2Q12072 CCH1YGR217W 6120 nt1.55□□□□□ -2.16
IOC2Q12072 BRR2YER172C 6492 nt1.53□□□□□ -2.16
IOC2Q12072 HKR1YDR420W 5409 nt1.49□□□□□ -2.17
IOC2Q12072 RPL41BYDL133C-A 78 nt1.43□□□□□ -2.18
IOC2Q12072 RKR1YMR247C 4689 nt1.43□□□□□ -2.18
IOC2Q12072 BUD3YCL014W 4911 nt1.41□□□□□ -2.18
IOC2Q12072 PAU24YBR301W 363 nt1.4□□□□□ -2.19
IOC2Q12072 YOL014WYOL014W 375 nt1.39□□□□□ -2.19
IOC2Q12072 YML100W-AYML100W-A 174 nt1.38□□□□□ -2.19
IOC2Q12072 THO2YNL139C 4794 nt1.33□□□□□ -2.2
IOC2Q12072 YBL100W-BYBL100W-B 5313 nt1.32□□□□□ -2.2
IOC2Q12072 YKL145W-AYKL145W-A 93 nt1.29□□□□□ -2.2
IOC2Q12072 tH(GUG)E1tH(GUG)E1 72 nt1.27□□□□□ -2.21
IOC2Q12072 tH(GUG)E2tH(GUG)E2 72 nt1.27□□□□□ -2.21
IOC2Q12072 tH(GUG)G1tH(GUG)G1 72 nt1.27□□□□□ -2.21
IOC2Q12072 tH(GUG)G2tH(GUG)G2 72 nt1.27□□□□□ -2.21
IOC2Q12072 tH(GUG)HtH(GUG)H 72 nt1.27□□□□□ -2.21
IOC2Q12072 tH(GUG)KtH(GUG)K 72 nt1.27□□□□□ -2.21
IOC2Q12072 tH(GUG)MtH(GUG)M 72 nt1.27□□□□□ -2.21
IOC2Q12072 IML1YJR138W 4755 nt1.26□□□□□ -2.21
IOC2Q12072 DOP1YDR141C 5097 nt1.26□□□□□ -2.21
IOC2Q12072 snR58snR58 96 nt1.21□□□□□ -2.22
IOC2Q12072 YOR335W-AYOR335W-A 81 nt1.21□□□□□ -2.22
IOC2Q12072 YJR029WYJR029W 5268 nt1.21□□□□□ -2.22
IOC2Q12072 tV(UAC)BtV(UAC)B 74 nt1.2□□□□□ -2.22
IOC2Q12072 tV(UAC)DtV(UAC)D 74 nt1.2□□□□□ -2.22
IOC2Q12072 SCC2YDR180W 4482 nt1.18□□□□□ -2.22
IOC2Q12072 ESP1YGR098C 4893 nt1.18□□□□□ -2.22
IOC2Q12072 YPR137C-BYPR137C-B 5268 nt1.14□□□□□ -2.23
IOC2Q12072 tF(GAA)BtF(GAA)B 73 nt1.14□□□□□ -2.23
IOC2Q12072 tF(GAA)FtF(GAA)F 73 nt1.14□□□□□ -2.23
IOC2Q12072 tF(GAA)GtF(GAA)G 73 nt1.14□□□□□ -2.23
IOC2Q12072 tF(GAA)H1tF(GAA)H1 73 nt1.14□□□□□ -2.23
IOC2Q12072 tF(GAA)H2tF(GAA)H2 73 nt1.14□□□□□ -2.23
IOC2Q12072 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt1.14□□□□□ -2.23
IOC2Q12072 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt1.14□□□□□ -2.23
IOC2Q12072 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt1.14□□□□□ -2.23
IOC2Q12072 PAU9YBL108C-A 129 nt1.14□□□□□ -2.23
IOC2Q12072 YOR186C-AYOR186C-A 210 nt1.12□□□□□ -2.23
IOC2Q12072 MLP1YKR095W 5628 nt1.09□□□□□ -2.24
IOC2Q12072 UTP20YBL004W 7482 nt1.08□□□□□ -2.24
IOC2Q12072 snR6snR6 112 nt1.07□□□□□ -2.24
IOC2Q12072 EMT1tM(CAU)D 73 nt1.05□□□□□ -2.24
IOC2Q12072 EMT5tM(CAU)J1 73 nt1.05□□□□□ -2.24
IOC2Q12072 EMT3tM(CAU)J2 73 nt1.05□□□□□ -2.24
IOC2Q12072 EMT4tM(CAU)M 73 nt1.05□□□□□ -2.24
IOC2Q12072 EMT2tM(CAU)O2 73 nt1.05□□□□□ -2.24
IOC2Q12072 BEM2YER155C 6504 nt1.05□□□□□ -2.24
IOC2Q12072 YJL113WYJL113W 4647 nt1.03□□□□□ -2.25
IOC2Q12072 FMP27YLR454W 7887 nt1.02□□□□□ -2.25
IOC2Q12072 snR73snR73 106 nt0.92□□□□□ -2.26
IOC2Q12072 YMR272W-AYMR272W-A 114 nt0.92□□□□□ -2.26
IOC2Q12072 snR161snR161 161 nt0.88□□□□□ -2.27
IOC2Q12072 IQG1YPL242C 4488 nt0.86□□□□□ -2.27
IOC2Q12072 snR128snR128 126 nt0.81□□□□□ -2.28
IOC2Q12072 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.74□□□□□ -2.29
IOC2Q12072 UTP10YJL109C 5310 nt0.71□□□□□ -2.3
IOC2Q12072 tA(UGC)QtA(UGC)Q 76 nt0.71□□□□□ -2.3
IOC2Q12072 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.67□□□□□ -2.3
IOC2Q12072 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.67□□□□□ -2.3
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