Protein–RNA interactions for Protein: P40550

PDR11, ATP-dependent permease PDR11, yeastyeast

Predictions only

Length 1,411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PDR11P40550 YMR172C-AYMR172C-A 384 nt-3.01□□□□□ -2.89
PDR11P40550 YLR120W-AYLR120W-A 102 nt-3.03□□□□□ -2.89
PDR11P40550 YOR376W-AYOR376W-A 156 nt-3.03□□□□□ -2.89
PDR11P40550 YBR178WYBR178W 375 nt-3.04□□□□□ -2.9
PDR11P40550 tW(UCA)QtW(UCA)Q 74 nt-3.05□□□□□ -2.9
PDR11P40550 YLR406C-AYLR406C-A 150 nt-3.08□□□□□ -2.9
PDR11P40550 YGL041CYGL041C 204 nt-3.09□□□□□ -2.9
PDR11P40550 YLR342W-AYLR342W-A 174 nt-3.09□□□□□ -2.9
PDR11P40550 HTL1YCR020W-B 237 nt-3.1□□□□□ -2.91
PDR11P40550 YJR157WYJR157W 363 nt-3.11□□□□□ -2.91
PDR11P40550 YBR196C-AYBR196C-A 150 nt-3.11□□□□□ -2.91
PDR11P40550 BIL1YOR304C-A 231 nt-3.14□□□□□ -2.91
PDR11P40550 YAL016C-BYAL016C-B 186 nt-3.16□□□□□ -2.92
PDR11P40550 YOR316C-AYOR316C-A 210 nt-3.22□□□□□ -2.93
PDR11P40550 YOR329W-AYOR329W-A 210 nt-3.22□□□□□ -2.93
PDR11P40550 YDR524W-CYDR524W-C 90 nt-3.23□□□□□ -2.93
PDR11P40550 ATP19YOL077W-A 207 nt-3.24□□□□□ -2.93
PDR11P40550 YEL014CYEL014C 306 nt-3.25□□□□□ -2.93
PDR11P40550 YLR299C-AYLR299C-A 93 nt-3.25□□□□□ -2.93
PDR11P40550 YOL013W-BYOL013W-B 291 nt-3.26□□□□□ -2.93
PDR11P40550 snR78snR78 87 nt-3.27□□□□□ -2.93
PDR11P40550 YOL083C-AYOL083C-A 141 nt-3.3□□□□□ -2.94
PDR11P40550 YHR180C-BYHR180C-B 105 nt-3.34□□□□□ -2.94
PDR11P40550 snR55snR55 98 nt-3.37□□□□□ -2.95
PDR11P40550 YPR197CYPR197C 564 nt-3.4□□□□□ -2.95
PDR11P40550 YAL063C-AYAL063C-A 291 nt-3.44□□□□□ -2.96
PDR11P40550 YLR222C-AYLR222C-A 231 nt-3.44□□□□□ -2.96
PDR11P40550 YJR162CYJR162C 351 nt-3.47□□□□□ -2.97
PDR11P40550 YNL337WYNL337W 255 nt-3.47□□□□□ -2.97
PDR11P40550 YPR012WYPR012W 255 nt-3.47□□□□□ -2.97
PDR11P40550 YKL106C-AYKL106C-A 120 nt-3.49□□□□□ -2.97
PDR11P40550 YOR102WYOR102W 351 nt-3.5□□□□□ -2.97
PDR11P40550 YDR183C-AYDR183C-A 258 nt-3.52□□□□□ -2.97
PDR11P40550 YNR025CYNR025C 360 nt-3.52□□□□□ -2.97
PDR11P40550 YGR035CYGR035C 351 nt-3.53□□□□□ -2.98
PDR11P40550 YBR131C-AYBR131C-A 90 nt-3.56□□□□□ -2.98
PDR11P40550 YER181CYER181C 324 nt-3.58□□□□□ -2.98
PDR11P40550 tF(GAA)QtF(GAA)Q 75 nt-3.59□□□□□ -2.98
PDR11P40550 snR48snR48 113 nt-3.61□□□□□ -2.99
PDR11P40550 snR6snR6 112 nt-3.62□□□□□ -2.99
PDR11P40550 YGL188C-AYGL188C-A 141 nt-3.66□□□□□ -3
PDR11P40550 YDR413CYDR413C 576 nt-3.69□□□□□ -3
PDR11P40550 YKL118WYKL118W 312 nt-3.71□□□□□ -3
PDR11P40550 YPL038W-AYPL038W-A 192 nt-3.75□□□□□ -3.01
PDR11P40550 tL(UAA)QtL(UAA)Q 85 nt-3.8□□□□□ -3.02
PDR11P40550 YOL155W-AYOL155W-A 135 nt-3.81□□□□□ -3.02
PDR11P40550 YBR109W-AYBR109W-A 225 nt-3.81□□□□□ -3.02
PDR11P40550 YNL097C-BYNL097C-B 123 nt-3.82□□□□□ -3.02
PDR11P40550 snR80snR80 171 nt-3.83□□□□□ -3.02
PDR11P40550 YJL150WYJL150W 303 nt-3.84□□□□□ -3.02
PDR11P40550 snR73snR73 106 nt-3.85□□□□□ -3.03
PDR11P40550 YOR335W-AYOR335W-A 81 nt-3.9□□□□□ -3.03
PDR11P40550 RPL41BYDL133C-A 78 nt-3.92□□□□□ -3.04
PDR11P40550 YBR296C-AYBR296C-A 120 nt-3.96□□□□□ -3.04
PDR11P40550 snR56snR56 88 nt-4□□□□□ -3.05
PDR11P40550 RPL41AYDL184C 78 nt-4□□□□□ -3.05
PDR11P40550 YDR524C-AYDR524C-A 120 nt-4□□□□□ -3.05
PDR11P40550 tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 73 nt-4□□□□□ -3.05
PDR11P40550 RPL39YJL189W 156 nt-4.02□□□□□ -3.05
PDR11P40550 GIM4YEL003W 336 nt-4.04□□□□□ -3.06
PDR11P40550 YNL198CYNL198C 303 nt-4.09□□□□□ -3.06
PDR11P40550 YNL277W-AYNL277W-A 189 nt-4.1□□□□□ -3.07
PDR11P40550 YHL015W-AYHL015W-A 84 nt-4.13□□□□□ -3.07
PDR11P40550 snR38snR38 95 nt-4.15□□□□□ -3.07
PDR11P40550 snR52snR52 92 nt-4.21□□□□□ -3.08
PDR11P40550 YEL050W-AYEL050W-A 192 nt-4.22□□□□□ -3.09
PDR11P40550 YOR302WYOR302W 78 nt-4.23□□□□□ -3.09
PDR11P40550 YDR406W-AYDR406W-A 246 nt-4.29□□□□□ -3.1
PDR11P40550 SOM1YEL059C-A 225 nt-4.35□□□□□ -3.11
PDR11P40550 YDL240C-AYDL240C-A 138 nt-4.41□□□□□ -3.12
PDR11P40550 YCR095W-AYCR095W-A 159 nt-4.46□□□□□ -3.12
PDR11P40550 snR85snR85 171 nt-4.49□□□□□ -3.13
PDR11P40550 tV(UAC)QtV(UAC)Q 76 nt-4.52□□□□□ -3.13
PDR11P40550 YOL164W-AYOL164W-A 183 nt-4.55□□□□□ -3.14
PDR11P40550 YDR157WYDR157W 402 nt-4.56□□□□□ -3.14
PDR11P40550 YBL071C-BYBL071C-B 99 nt-4.56□□□□□ -3.14
PDR11P40550 YDL114W-AYDL114W-A 114 nt-4.58□□□□□ -3.14
PDR11P40550 snR87snR87 109 nt-4.58□□□□□ -3.14
PDR11P40550 YGR151CYGR151C 336 nt-4.64□□□□□ -3.15
PDR11P40550 snR47snR47 99 nt-4.67□□□□□ -3.16
PDR11P40550 YPL152W-AYPL152W-A 99 nt-4.68□□□□□ -3.16
PDR11P40550 YBL100W-CYBL100W-C 120 nt-4.85□□□□□ -3.19
PDR11P40550 snR65snR65 100 nt-4.87□□□□□ -3.19
PDR11P40550 YAL037C-AYAL037C-A 93 nt-4.87□□□□□ -3.19
PDR11P40550 YDR118W-AYDR118W-A 117 nt-4.89□□□□□ -3.19
PDR11P40550 YKL225WYKL225W 348 nt-4.89□□□□□ -3.19
PDR11P40550 YBL053WYBL053W 375 nt-4.89□□□□□ -3.19
PDR11P40550 SPG3YDR504C 384 nt-4.97□□□□□ -3.21
PDR11P40550 snR58snR58 96 nt-5.07□□□□□ -3.22
PDR11P40550 YHR175W-AYHR175W-A 150 nt-5.1□□□□□ -3.23
PDR11P40550 YKL096C-BYKL096C-B 150 nt-5.1□□□□□ -3.23
PDR11P40550 tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 86 nt-5.13□□□□□ -3.23
PDR11P40550 Q0017Q0017 162 nt-5.14□□□□□ -3.23
PDR11P40550 YGR122C-AYGR122C-A 129 nt-5.35□□□□□ -3.27
PDR11P40550 YJL136W-AYJL136W-A 84 nt-5.36□□□□□ -3.27
PDR11P40550 YDL159W-AYDL159W-A 132 nt-5.41□□□□□ -3.28
PDR11P40550 YDR034C-AYDR034C-A 177 nt-5.44□□□□□ -3.28
PDR11P40550 YCL001W-BYCL001W-B 255 nt-5.44□□□□□ -3.28
PDR11P40550 VAR1Q0140 1197 nt-5.46□□□□□ -3.28
PDR11P40550 YOR231C-AYOR231C-A 201 nt-5.5□□□□□ -3.29
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 35.5 ms