Protein–RNA interactions for Protein: O96020

CCNE2, G1/S-specific cyclin-E2, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNE2O96020 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCNE2O96020 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCNE2O96020 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCNE2O96020 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCNE2O96020 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CCNE2O96020 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCNE2O96020 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CCNE2O96020 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCNE2O96020 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCNE2O96020 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCNE2O96020 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCNE2O96020 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CCNE2O96020 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCNE2O96020 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCNE2O96020 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCNE2O96020 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CCNE2O96020 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCNE2O96020 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCNE2O96020 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCNE2O96020 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCNE2O96020 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCNE2O96020 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCNE2O96020 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCNE2O96020 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCNE2O96020 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCNE2O96020 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCNE2O96020 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCNE2O96020 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCNE2O96020 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCNE2O96020 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CCNE2O96020 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCNE2O96020 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CCNE2O96020 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CCNE2O96020 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCNE2O96020 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCNE2O96020 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCNE2O96020 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCNE2O96020 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCNE2O96020 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCNE2O96020 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CCNE2O96020 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CCNE2O96020 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCNE2O96020 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCNE2O96020 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCNE2O96020 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCNE2O96020 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCNE2O96020 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCNE2O96020 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCNE2O96020 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCNE2O96020 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCNE2O96020 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCNE2O96020 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCNE2O96020 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCNE2O96020 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCNE2O96020 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCNE2O96020 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCNE2O96020 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCNE2O96020 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCNE2O96020 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCNE2O96020 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCNE2O96020 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCNE2O96020 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCNE2O96020 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCNE2O96020 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCNE2O96020 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCNE2O96020 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCNE2O96020 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCNE2O96020 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCNE2O96020 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCNE2O96020 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCNE2O96020 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCNE2O96020 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCNE2O96020 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CCNE2O96020 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCNE2O96020 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCNE2O96020 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCNE2O96020 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCNE2O96020 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCNE2O96020 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCNE2O96020 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CCNE2O96020 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCNE2O96020 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCNE2O96020 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCNE2O96020 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCNE2O96020 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCNE2O96020 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCNE2O96020 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCNE2O96020 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCNE2O96020 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CCNE2O96020 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCNE2O96020 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCNE2O96020 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCNE2O96020 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCNE2O96020 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CCNE2O96020 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCNE2O96020 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCNE2O96020 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCNE2O96020 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCNE2O96020 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCNE2O96020 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms