Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
ARID3CA6NKF2 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
ARID3CA6NKF2 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
ARID3CA6NKF2 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.6
ARID3CA6NKF2 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
ARID3CA6NKF2 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
ARID3CA6NKF2 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC31.26■■■□□ 2.59
ARID3CA6NKF2 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
ARID3CA6NKF2 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
ARID3CA6NKF2 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
ARID3CA6NKF2 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC31.26■■■□□ 2.59
ARID3CA6NKF2 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
ARID3CA6NKF2 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
ARID3CA6NKF2 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
ARID3CA6NKF2 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
ARID3CA6NKF2 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
ARID3CA6NKF2 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
ARID3CA6NKF2 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
ARID3CA6NKF2 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
ARID3CA6NKF2 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
ARID3CA6NKF2 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
ARID3CA6NKF2 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
ARID3CA6NKF2 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
ARID3CA6NKF2 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC31.25■■■□□ 2.59
ARID3CA6NKF2 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
ARID3CA6NKF2 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
ARID3CA6NKF2 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
ARID3CA6NKF2 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
ARID3CA6NKF2 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
ARID3CA6NKF2 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
ARID3CA6NKF2 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
ARID3CA6NKF2 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
ARID3CA6NKF2 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
ARID3CA6NKF2 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
ARID3CA6NKF2 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC31.24■■■□□ 2.59
ARID3CA6NKF2 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
ARID3CA6NKF2 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
ARID3CA6NKF2 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
ARID3CA6NKF2 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
ARID3CA6NKF2 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
ARID3CA6NKF2 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
ARID3CA6NKF2 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.24■■■□□ 2.59
ARID3CA6NKF2 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
ARID3CA6NKF2 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
ARID3CA6NKF2 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
ARID3CA6NKF2 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
ARID3CA6NKF2 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
ARID3CA6NKF2 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
ARID3CA6NKF2 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
ARID3CA6NKF2 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
ARID3CA6NKF2 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
ARID3CA6NKF2 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC31.23■■■□□ 2.59
ARID3CA6NKF2 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC31.23■■■□□ 2.59
ARID3CA6NKF2 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
ARID3CA6NKF2 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
ARID3CA6NKF2 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
ARID3CA6NKF2 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
ARID3CA6NKF2 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
ARID3CA6NKF2 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
ARID3CA6NKF2 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
ARID3CA6NKF2 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
ARID3CA6NKF2 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
ARID3CA6NKF2 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
ARID3CA6NKF2 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
ARID3CA6NKF2 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
ARID3CA6NKF2 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
ARID3CA6NKF2 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
ARID3CA6NKF2 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
ARID3CA6NKF2 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
ARID3CA6NKF2 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
ARID3CA6NKF2 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
ARID3CA6NKF2 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
ARID3CA6NKF2 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
ARID3CA6NKF2 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
ARID3CA6NKF2 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
ARID3CA6NKF2 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
ARID3CA6NKF2 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
ARID3CA6NKF2 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
ARID3CA6NKF2 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
ARID3CA6NKF2 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
ARID3CA6NKF2 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
ARID3CA6NKF2 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
ARID3CA6NKF2 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC31.21■■■□□ 2.59
ARID3CA6NKF2 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC31.21■■■□□ 2.59
ARID3CA6NKF2 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
ARID3CA6NKF2 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC31.21■■■□□ 2.59
ARID3CA6NKF2 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
ARID3CA6NKF2 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC31.21■■■□□ 2.59
ARID3CA6NKF2 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
ARID3CA6NKF2 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
ARID3CA6NKF2 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
ARID3CA6NKF2 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
ARID3CA6NKF2 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
ARID3CA6NKF2 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
ARID3CA6NKF2 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
ARID3CA6NKF2 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
ARID3CA6NKF2 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
ARID3CA6NKF2 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
ARID3CA6NKF2 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
ARID3CA6NKF2 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms