Protein–RNA interactions for Protein: U3KQV3

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KQV3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
U3KQV3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
U3KQV3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
U3KQV3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
U3KQV3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
U3KQV3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
U3KQV3 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
U3KQV3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
U3KQV3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
U3KQV3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
U3KQV3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
U3KQV3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
U3KQV3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
U3KQV3 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
U3KQV3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
U3KQV3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
U3KQV3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
U3KQV3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
U3KQV3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
U3KQV3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
U3KQV3 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
U3KQV3 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
U3KQV3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
U3KQV3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
U3KQV3 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
U3KQV3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
U3KQV3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
U3KQV3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
U3KQV3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
U3KQV3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
U3KQV3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
U3KQV3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
U3KQV3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
U3KQV3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
U3KQV3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
U3KQV3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
U3KQV3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
U3KQV3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
U3KQV3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
U3KQV3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
U3KQV3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
U3KQV3 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
U3KQV3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
U3KQV3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
U3KQV3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
U3KQV3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
U3KQV3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
U3KQV3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
U3KQV3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
U3KQV3 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
U3KQV3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
U3KQV3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
U3KQV3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
U3KQV3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
U3KQV3 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
U3KQV3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
U3KQV3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
U3KQV3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
U3KQV3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
U3KQV3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
U3KQV3 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
U3KQV3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
U3KQV3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
U3KQV3 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
U3KQV3 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
U3KQV3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
U3KQV3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
U3KQV3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
U3KQV3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
U3KQV3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
U3KQV3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
U3KQV3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
U3KQV3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
U3KQV3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
U3KQV3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
U3KQV3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
U3KQV3 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
U3KQV3 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
U3KQV3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
U3KQV3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
U3KQV3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
U3KQV3 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
U3KQV3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
U3KQV3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
U3KQV3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
U3KQV3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
U3KQV3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
U3KQV3 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
U3KQV3 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
U3KQV3 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
U3KQV3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
U3KQV3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
U3KQV3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
U3KQV3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
U3KQV3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
U3KQV3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
U3KQV3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
U3KQV3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
U3KQV3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
U3KQV3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms