Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBJ2

ABCD2, ATP-binding cassette sub-family D member 2, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD2Q9UBJ2 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ABCD2Q9UBJ2 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ABCD2Q9UBJ2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ABCD2Q9UBJ2 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ABCD2Q9UBJ2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ABCD2Q9UBJ2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
ABCD2Q9UBJ2 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ABCD2Q9UBJ2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ABCD2Q9UBJ2 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ABCD2Q9UBJ2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ABCD2Q9UBJ2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ABCD2Q9UBJ2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ABCD2Q9UBJ2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ABCD2Q9UBJ2 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ABCD2Q9UBJ2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ABCD2Q9UBJ2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ABCD2Q9UBJ2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ABCD2Q9UBJ2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ABCD2Q9UBJ2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ABCD2Q9UBJ2 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ABCD2Q9UBJ2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
ABCD2Q9UBJ2 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ABCD2Q9UBJ2 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ABCD2Q9UBJ2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ABCD2Q9UBJ2 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ABCD2Q9UBJ2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ABCD2Q9UBJ2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ABCD2Q9UBJ2 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ABCD2Q9UBJ2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ABCD2Q9UBJ2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ABCD2Q9UBJ2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ABCD2Q9UBJ2 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ABCD2Q9UBJ2 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ABCD2Q9UBJ2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ABCD2Q9UBJ2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ABCD2Q9UBJ2 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ABCD2Q9UBJ2 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ABCD2Q9UBJ2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ABCD2Q9UBJ2 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ABCD2Q9UBJ2 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ABCD2Q9UBJ2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ABCD2Q9UBJ2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ABCD2Q9UBJ2 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ABCD2Q9UBJ2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ABCD2Q9UBJ2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ABCD2Q9UBJ2 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ABCD2Q9UBJ2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ABCD2Q9UBJ2 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ABCD2Q9UBJ2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ABCD2Q9UBJ2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
ABCD2Q9UBJ2 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ABCD2Q9UBJ2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ABCD2Q9UBJ2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ABCD2Q9UBJ2 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ABCD2Q9UBJ2 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ABCD2Q9UBJ2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ABCD2Q9UBJ2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ABCD2Q9UBJ2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ABCD2Q9UBJ2 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ABCD2Q9UBJ2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ABCD2Q9UBJ2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ABCD2Q9UBJ2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ABCD2Q9UBJ2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ABCD2Q9UBJ2 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ABCD2Q9UBJ2 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ABCD2Q9UBJ2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ABCD2Q9UBJ2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ABCD2Q9UBJ2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ABCD2Q9UBJ2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ABCD2Q9UBJ2 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ABCD2Q9UBJ2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ABCD2Q9UBJ2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ABCD2Q9UBJ2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ABCD2Q9UBJ2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ABCD2Q9UBJ2 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ABCD2Q9UBJ2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ABCD2Q9UBJ2 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ABCD2Q9UBJ2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ABCD2Q9UBJ2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ABCD2Q9UBJ2 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ABCD2Q9UBJ2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ABCD2Q9UBJ2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ABCD2Q9UBJ2 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ABCD2Q9UBJ2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ABCD2Q9UBJ2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ABCD2Q9UBJ2 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ABCD2Q9UBJ2 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ABCD2Q9UBJ2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ABCD2Q9UBJ2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ABCD2Q9UBJ2 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ABCD2Q9UBJ2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ABCD2Q9UBJ2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ABCD2Q9UBJ2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ABCD2Q9UBJ2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ABCD2Q9UBJ2 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ABCD2Q9UBJ2 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ABCD2Q9UBJ2 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ABCD2Q9UBJ2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ABCD2Q9UBJ2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ABCD2Q9UBJ2 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms