Protein–RNA interactions for Protein: Q9C035

TRIM5, Tripartite motif-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM5Q9C035 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TRIM5Q9C035 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TRIM5Q9C035 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TRIM5Q9C035 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
TRIM5Q9C035 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TRIM5Q9C035 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TRIM5Q9C035 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TRIM5Q9C035 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TRIM5Q9C035 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TRIM5Q9C035 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TRIM5Q9C035 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TRIM5Q9C035 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TRIM5Q9C035 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TRIM5Q9C035 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TRIM5Q9C035 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TRIM5Q9C035 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TRIM5Q9C035 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TRIM5Q9C035 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
TRIM5Q9C035 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TRIM5Q9C035 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TRIM5Q9C035 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TRIM5Q9C035 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
TRIM5Q9C035 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TRIM5Q9C035 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TRIM5Q9C035 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TRIM5Q9C035 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TRIM5Q9C035 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.76■■■□□ 2.2
TRIM5Q9C035 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TRIM5Q9C035 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRIM5Q9C035 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRIM5Q9C035 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRIM5Q9C035 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRIM5Q9C035 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRIM5Q9C035 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TRIM5Q9C035 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TRIM5Q9C035 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TRIM5Q9C035 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TRIM5Q9C035 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRIM5Q9C035 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TRIM5Q9C035 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TRIM5Q9C035 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TRIM5Q9C035 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.19
TRIM5Q9C035 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRIM5Q9C035 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRIM5Q9C035 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRIM5Q9C035 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRIM5Q9C035 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TRIM5Q9C035 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TRIM5Q9C035 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TRIM5Q9C035 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TRIM5Q9C035 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TRIM5Q9C035 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TRIM5Q9C035 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TRIM5Q9C035 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TRIM5Q9C035 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TRIM5Q9C035 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TRIM5Q9C035 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TRIM5Q9C035 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TRIM5Q9C035 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TRIM5Q9C035 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TRIM5Q9C035 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TRIM5Q9C035 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TRIM5Q9C035 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TRIM5Q9C035 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TRIM5Q9C035 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TRIM5Q9C035 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TRIM5Q9C035 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TRIM5Q9C035 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TRIM5Q9C035 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TRIM5Q9C035 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TRIM5Q9C035 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TRIM5Q9C035 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TRIM5Q9C035 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TRIM5Q9C035 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TRIM5Q9C035 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TRIM5Q9C035 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TRIM5Q9C035 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TRIM5Q9C035 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TRIM5Q9C035 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TRIM5Q9C035 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TRIM5Q9C035 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TRIM5Q9C035 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TRIM5Q9C035 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TRIM5Q9C035 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TRIM5Q9C035 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRIM5Q9C035 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRIM5Q9C035 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRIM5Q9C035 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRIM5Q9C035 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
TRIM5Q9C035 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRIM5Q9C035 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRIM5Q9C035 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TRIM5Q9C035 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TRIM5Q9C035 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TRIM5Q9C035 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TRIM5Q9C035 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TRIM5Q9C035 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TRIM5Q9C035 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TRIM5Q9C035 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TRIM5Q9C035 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.2 ms