Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z403

TMC6, Transmembrane channel-like protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 805 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC6Q7Z403 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TMC6Q7Z403 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TMC6Q7Z403 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TMC6Q7Z403 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TMC6Q7Z403 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TMC6Q7Z403 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TMC6Q7Z403 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TMC6Q7Z403 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TMC6Q7Z403 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TMC6Q7Z403 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TMC6Q7Z403 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TMC6Q7Z403 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TMC6Q7Z403 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TMC6Q7Z403 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TMC6Q7Z403 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TMC6Q7Z403 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TMC6Q7Z403 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TMC6Q7Z403 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TMC6Q7Z403 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TMC6Q7Z403 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TMC6Q7Z403 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TMC6Q7Z403 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TMC6Q7Z403 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TMC6Q7Z403 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TMC6Q7Z403 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TMC6Q7Z403 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TMC6Q7Z403 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TMC6Q7Z403 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TMC6Q7Z403 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TMC6Q7Z403 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TMC6Q7Z403 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TMC6Q7Z403 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TMC6Q7Z403 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TMC6Q7Z403 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.15
TMC6Q7Z403 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TMC6Q7Z403 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
TMC6Q7Z403 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TMC6Q7Z403 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TMC6Q7Z403 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TMC6Q7Z403 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TMC6Q7Z403 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TMC6Q7Z403 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TMC6Q7Z403 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
TMC6Q7Z403 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TMC6Q7Z403 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TMC6Q7Z403 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TMC6Q7Z403 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TMC6Q7Z403 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TMC6Q7Z403 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TMC6Q7Z403 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
TMC6Q7Z403 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
TMC6Q7Z403 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TMC6Q7Z403 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
TMC6Q7Z403 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TMC6Q7Z403 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TMC6Q7Z403 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TMC6Q7Z403 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TMC6Q7Z403 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TMC6Q7Z403 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TMC6Q7Z403 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TMC6Q7Z403 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TMC6Q7Z403 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TMC6Q7Z403 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TMC6Q7Z403 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TMC6Q7Z403 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TMC6Q7Z403 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TMC6Q7Z403 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TMC6Q7Z403 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TMC6Q7Z403 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TMC6Q7Z403 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TMC6Q7Z403 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TMC6Q7Z403 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TMC6Q7Z403 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TMC6Q7Z403 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TMC6Q7Z403 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TMC6Q7Z403 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TMC6Q7Z403 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TMC6Q7Z403 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TMC6Q7Z403 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TMC6Q7Z403 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TMC6Q7Z403 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TMC6Q7Z403 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TMC6Q7Z403 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TMC6Q7Z403 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TMC6Q7Z403 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TMC6Q7Z403 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TMC6Q7Z403 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TMC6Q7Z403 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TMC6Q7Z403 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TMC6Q7Z403 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TMC6Q7Z403 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TMC6Q7Z403 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TMC6Q7Z403 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
TMC6Q7Z403 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TMC6Q7Z403 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TMC6Q7Z403 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TMC6Q7Z403 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TMC6Q7Z403 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TMC6Q7Z403 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TMC6Q7Z403 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms