Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5S1

CCDC183, Coiled-coil domain-containing protein 183, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC183Q5T5S1 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC183Q5T5S1 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC183Q5T5S1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC183Q5T5S1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC183Q5T5S1 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCDC183Q5T5S1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCDC183Q5T5S1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCDC183Q5T5S1 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
CCDC183Q5T5S1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCDC183Q5T5S1 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCDC183Q5T5S1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCDC183Q5T5S1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCDC183Q5T5S1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC183Q5T5S1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
CCDC183Q5T5S1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
CCDC183Q5T5S1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
CCDC183Q5T5S1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CCDC183Q5T5S1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CCDC183Q5T5S1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CCDC183Q5T5S1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CCDC183Q5T5S1 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CCDC183Q5T5S1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CCDC183Q5T5S1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CCDC183Q5T5S1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CCDC183Q5T5S1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CCDC183Q5T5S1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
CCDC183Q5T5S1 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC183Q5T5S1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC183Q5T5S1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC183Q5T5S1 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC183Q5T5S1 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC183Q5T5S1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC183Q5T5S1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC183Q5T5S1 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCDC183Q5T5S1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC183Q5T5S1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC183Q5T5S1 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC183Q5T5S1 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC183Q5T5S1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC183Q5T5S1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC183Q5T5S1 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC183Q5T5S1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC183Q5T5S1 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC183Q5T5S1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC183Q5T5S1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC183Q5T5S1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC183Q5T5S1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC183Q5T5S1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC183Q5T5S1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC183Q5T5S1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC183Q5T5S1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC183Q5T5S1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC183Q5T5S1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC183Q5T5S1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC183Q5T5S1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC183Q5T5S1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC183Q5T5S1 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC183Q5T5S1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC183Q5T5S1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCDC183Q5T5S1 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCDC183Q5T5S1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCDC183Q5T5S1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCDC183Q5T5S1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCDC183Q5T5S1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CCDC183Q5T5S1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CCDC183Q5T5S1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CCDC183Q5T5S1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CCDC183Q5T5S1 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CCDC183Q5T5S1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CCDC183Q5T5S1 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC183Q5T5S1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC183Q5T5S1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC183Q5T5S1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC183Q5T5S1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC183Q5T5S1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC183Q5T5S1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC183Q5T5S1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC183Q5T5S1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC183Q5T5S1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC183Q5T5S1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC183Q5T5S1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC183Q5T5S1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC183Q5T5S1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCDC183Q5T5S1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCDC183Q5T5S1 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCDC183Q5T5S1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCDC183Q5T5S1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCDC183Q5T5S1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCDC183Q5T5S1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCDC183Q5T5S1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCDC183Q5T5S1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCDC183Q5T5S1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC183Q5T5S1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC183Q5T5S1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC183Q5T5S1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC183Q5T5S1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC183Q5T5S1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC183Q5T5S1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC183Q5T5S1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
CCDC183Q5T5S1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms