Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAL6

VWC2, Brorin, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWC2Q2TAL6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
VWC2Q2TAL6 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VWC2Q2TAL6 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
VWC2Q2TAL6 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
VWC2Q2TAL6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VWC2Q2TAL6 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VWC2Q2TAL6 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
VWC2Q2TAL6 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VWC2Q2TAL6 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VWC2Q2TAL6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VWC2Q2TAL6 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VWC2Q2TAL6 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VWC2Q2TAL6 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VWC2Q2TAL6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VWC2Q2TAL6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VWC2Q2TAL6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VWC2Q2TAL6 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VWC2Q2TAL6 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VWC2Q2TAL6 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VWC2Q2TAL6 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VWC2Q2TAL6 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
VWC2Q2TAL6 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
VWC2Q2TAL6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VWC2Q2TAL6 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VWC2Q2TAL6 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
VWC2Q2TAL6 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VWC2Q2TAL6 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VWC2Q2TAL6 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VWC2Q2TAL6 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
VWC2Q2TAL6 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VWC2Q2TAL6 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VWC2Q2TAL6 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VWC2Q2TAL6 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
VWC2Q2TAL6 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
VWC2Q2TAL6 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VWC2Q2TAL6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
VWC2Q2TAL6 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
VWC2Q2TAL6 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
VWC2Q2TAL6 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
VWC2Q2TAL6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
VWC2Q2TAL6 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VWC2Q2TAL6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VWC2Q2TAL6 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
VWC2Q2TAL6 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VWC2Q2TAL6 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VWC2Q2TAL6 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VWC2Q2TAL6 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
VWC2Q2TAL6 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
VWC2Q2TAL6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VWC2Q2TAL6 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
VWC2Q2TAL6 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
VWC2Q2TAL6 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
VWC2Q2TAL6 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
VWC2Q2TAL6 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
VWC2Q2TAL6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
VWC2Q2TAL6 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
VWC2Q2TAL6 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VWC2Q2TAL6 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
VWC2Q2TAL6 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
VWC2Q2TAL6 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VWC2Q2TAL6 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VWC2Q2TAL6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VWC2Q2TAL6 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
VWC2Q2TAL6 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VWC2Q2TAL6 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
VWC2Q2TAL6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
VWC2Q2TAL6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VWC2Q2TAL6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
VWC2Q2TAL6 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
VWC2Q2TAL6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
VWC2Q2TAL6 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
VWC2Q2TAL6 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VWC2Q2TAL6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
VWC2Q2TAL6 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VWC2Q2TAL6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VWC2Q2TAL6 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VWC2Q2TAL6 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
VWC2Q2TAL6 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
VWC2Q2TAL6 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
VWC2Q2TAL6 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
VWC2Q2TAL6 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VWC2Q2TAL6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VWC2Q2TAL6 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VWC2Q2TAL6 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
VWC2Q2TAL6 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VWC2Q2TAL6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VWC2Q2TAL6 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VWC2Q2TAL6 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VWC2Q2TAL6 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VWC2Q2TAL6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VWC2Q2TAL6 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VWC2Q2TAL6 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
VWC2Q2TAL6 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VWC2Q2TAL6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VWC2Q2TAL6 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VWC2Q2TAL6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VWC2Q2TAL6 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VWC2Q2TAL6 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VWC2Q2TAL6 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VWC2Q2TAL6 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms