Protein–RNA interactions for Protein: Q12221

PUF2, mRNA-binding protein PUF2, yeastyeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 1,075 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PUF2Q12221 tA(UGC)EtA(UGC)E 73 nt8.54□□□□□ -1.04
PUF2Q12221 tA(UGC)GtA(UGC)G 73 nt8.54□□□□□ -1.04
PUF2Q12221 tA(UGC)LtA(UGC)L 73 nt8.54□□□□□ -1.04
PUF2Q12221 tA(UGC)OtA(UGC)O 73 nt8.54□□□□□ -1.04
PUF2Q12221 ENO1YGR254W 1314 nt8.54□□□□□ -1.04
PUF2Q12221 YIA6YIL006W 1122 nt8.53□□□□□ -1.04
PUF2Q12221 RIB1YBL033C 1038 nt8.53□□□□□ -1.04
PUF2Q12221 SOD2YHR008C 702 nt8.52□□□□□ -1.05
PUF2Q12221 CWP2YKL096W-A 279 nt8.52□□□□□ -1.05
PUF2Q12221 ERG6YML008C 1152 nt8.52□□□□□ -1.05
PUF2Q12221 ESBP6YNL125C 2022 nt8.52□□□□□ -1.05
PUF2Q12221 ERO1YML130C 1692 nt8.51□□□□□ -1.05
PUF2Q12221 SRP102YKL154W 735 nt8.51□□□□□ -1.05 RIP-Chip
PUF2Q12221 YLR280CYLR280C 351 nt8.51□□□□□ -1.05
PUF2Q12221 RPC31YNL151C 756 nt8.51□□□□□ -1.05
PUF2Q12221 RIM8YGL045W 1629 nt8.51□□□□□ -1.05
PUF2Q12221 HTS1YPR033C 1641 nt8.51□□□□□ -1.05
PUF2Q12221 DPL1YDR294C 1770 nt8.5□□□□□ -1.05
PUF2Q12221 YGR210CYGR210C 1236 nt8.48□□□□□ -1.05
PUF2Q12221 YGL114WYGL114W 2178 nt8.46□□□□□ -1.05
PUF2Q12221 HMG2YLR450W 3138 nt8.45□□□□□ -1.06
PUF2Q12221 YFR020WYFR020W 699 nt8.45□□□□□ -1.06
PUF2Q12221 SBP1YHL034C 885 nt8.45□□□□□ -1.06
PUF2Q12221 YPT11YNL304W 1254 nt8.45□□□□□ -1.06
PUF2Q12221 FCY1YPR062W 477 nt8.45□□□□□ -1.06
PUF2Q12221 GAS1YMR307W 1680 nt8.45□□□□□ -1.06
PUF2Q12221 PTC6YCR079W 1329 nt8.45□□□□□ -1.06
PUF2Q12221 ILV2YMR108W 2064 nt8.44□□□□□ -1.06
PUF2Q12221 YMR007WYMR007W 381 nt8.43□□□□□ -1.06
PUF2Q12221 YMR209CYMR209C 1374 nt8.43□□□□□ -1.06 RIP-Chip
PUF2Q12221 TPO4YOR273C 1980 nt8.42□□□□□ -1.06
PUF2Q12221 KRR1YCL059C 951 nt8.42□□□□□ -1.06
PUF2Q12221 MDM35YKL053C-A 261 nt8.41□□□□□ -1.06
PUF2Q12221 THI3YDL080C 1830 nt8.4□□□□□ -1.06
PUF2Q12221 YPL108WYPL108W 507 nt8.4□□□□□ -1.06
PUF2Q12221 YER152W-AYER152W-A 567 nt8.38□□□□□ -1.07
PUF2Q12221 LEU4YNL104C 1860 nt8.38□□□□□ -1.07
PUF2Q12221 POP2YNR052C 1302 nt8.37□□□□□ -1.07 RIP-Chip
PUF2Q12221 YMR316C-BYMR316C-B 309 nt8.37□□□□□ -1.07
PUF2Q12221 NME1NME1 340 nt8.37□□□□□ -1.07
PUF2Q12221 MAE1YKL029C 2010 nt8.37□□□□□ -1.07 RIP-Chip
PUF2Q12221 YJL160CYJL160C 864 nt8.36□□□□□ -1.07
PUF2Q12221 RSM7YJR113C 744 nt8.36□□□□□ -1.07
PUF2Q12221 DTR1YBR180W 1719 nt8.36□□□□□ -1.07
PUF2Q12221 GGA2YHR108W 1758 nt8.35□□□□□ -1.07
PUF2Q12221 GPM1YKL152C 744 nt8.35□□□□□ -1.07
PUF2Q12221 DMA2YNL116W 1569 nt8.35□□□□□ -1.07
PUF2Q12221 PET18YCR020C 648 nt8.34□□□□□ -1.07
PUF2Q12221 YDR467CYDR467C 327 nt8.34□□□□□ -1.07
PUF2Q12221 RCR1YBR005W 642 nt8.34□□□□□ -1.07 RIP-Chip
PUF2Q12221 RFC1YOR217W 2586 nt8.33□□□□□ -1.08
PUF2Q12221 GTB1YDR221W 2109 nt8.32□□□□□ -1.08 RIP-Chip
PUF2Q12221 YMR166CYMR166C 1107 nt8.32□□□□□ -1.08
PUF2Q12221 LSP1YPL004C 1026 nt8.32□□□□□ -1.08 RIP-Chip
PUF2Q12221 HXT10YFL011W 1641 nt8.32□□□□□ -1.08
PUF2Q12221 EMC3YKL207W 762 nt8.31□□□□□ -1.08
PUF2Q12221 tE(CUC)DtE(CUC)D 72 nt8.3□□□□□ -1.08
PUF2Q12221 tE(CUC)ItE(CUC)I 72 nt8.3□□□□□ -1.08
PUF2Q12221 YMR210WYMR210W 1350 nt8.3□□□□□ -1.08
PUF2Q12221 URA8YJR103W 1737 nt8.28□□□□□ -1.08
PUF2Q12221 CAK1YFL029C 1107 nt8.26□□□□□ -1.09
PUF2Q12221 MET22YOL064C 1074 nt8.26□□□□□ -1.09
PUF2Q12221 OCH1YGL038C 1443 nt8.26□□□□□ -1.09
PUF2Q12221 NPP2YEL016C 1482 nt8.26□□□□□ -1.09
PUF2Q12221 YHR218WYHR218W 1812 nt8.25□□□□□ -1.09
PUF2Q12221 BUD20YLR074C 501 nt8.25□□□□□ -1.09
PUF2Q12221 YLR460CYLR460C 1131 nt8.25□□□□□ -1.09
PUF2Q12221 RNA170RNA170 169 nt8.25□□□□□ -1.09
PUF2Q12221 YBL095WYBL095W 813 nt8.25□□□□□ -1.09
PUF2Q12221 PAU21YOR394W 495 nt8.25□□□□□ -1.09
PUF2Q12221 PAU22YPL282C 495 nt8.25□□□□□ -1.09
PUF2Q12221 AGP3YFL055W 1677 nt8.24□□□□□ -1.09
PUF2Q12221 GRH1YDR517W 1119 nt8.24□□□□□ -1.09
PUF2Q12221 UTR5YEL035C 501 nt8.24□□□□□ -1.09
PUF2Q12221 AAC3YBR085W 924 nt8.24□□□□□ -1.09
PUF2Q12221 GAL2YLR081W 1725 nt8.23□□□□□ -1.09
PUF2Q12221 CHS7YHR142W 951 nt8.22□□□□□ -1.09
PUF2Q12221 PSD1YNL169C 1503 nt8.22□□□□□ -1.09
PUF2Q12221 INH1YDL181W 258 nt8.21□□□□□ -1.1
PUF2Q12221 RRT14YIL127C 621 nt8.21□□□□□ -1.1
PUF2Q12221 YMC2YBR104W 990 nt8.21□□□□□ -1.1
PUF2Q12221 PDC6YGR087C 1692 nt8.21□□□□□ -1.1
PUF2Q12221 TMS1YDR105C 1422 nt8.2□□□□□ -1.1
PUF2Q12221 YJR149WYJR149W 1215 nt8.2□□□□□ -1.1
PUF2Q12221 RPS6AYPL090C 711 nt8.19□□□□□ -1.1 RIP-Chip
PUF2Q12221 RPS6BYBR181C 711 nt8.19□□□□□ -1.1
PUF2Q12221 YER156CYER156C 1017 nt8.18□□□□□ -1.1
PUF2Q12221 MRS4YKR052C 915 nt8.18□□□□□ -1.1
PUF2Q12221 BXI1YNL305C 894 nt8.18□□□□□ -1.1
PUF2Q12221 YOR343CYOR343C 327 nt8.18□□□□□ -1.1
PUF2Q12221 YDR510C-AYDR510C-A 117 nt8.17□□□□□ -1.1
PUF2Q12221 OLA1YBR025C 1185 nt8.17□□□□□ -1.1
PUF2Q12221 ADA2YDR448W 1305 nt8.17□□□□□ -1.1
PUF2Q12221 YIR035CYIR035C 765 nt8.16□□□□□ -1.1
PUF2Q12221 TOK1YJL093C 2076 nt8.16□□□□□ -1.1
PUF2Q12221 AAT1YKL106W 1356 nt8.16□□□□□ -1.1 RIP-Chip
PUF2Q12221 YBR056WYBR056W 1506 nt8.15□□□□□ -1.1
PUF2Q12221 HRA1HRA1 564 nt8.15□□□□□ -1.1
PUF2Q12221 BUB2YMR055C 921 nt8.15□□□□□ -1.1
PUF2Q12221 TPN1YGL186C 1740 nt8.15□□□□□ -1.11
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