Protein–RNA interactions for Protein: Q12175

MSH5, MutS protein homolog 5, yeastyeast

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Length 901 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MSH5Q12175 THI3YDL080C 1830 nt7.99□□□□□ -1.13
MSH5Q12175 MRS4YKR052C 915 nt7.98□□□□□ -1.13
MSH5Q12175 CRC1YOR100C 984 nt7.98□□□□□ -1.13
MSH5Q12175 ESS1YJR017C 513 nt7.97□□□□□ -1.13
MSH5Q12175 YMR253CYMR253C 1245 nt7.97□□□□□ -1.13
MSH5Q12175 ERR3YMR323W 1314 nt7.97□□□□□ -1.13
MSH5Q12175 RPT5YOR117W 1305 nt7.97□□□□□ -1.13
MSH5Q12175 ERR1YOR393W 1314 nt7.97□□□□□ -1.13
MSH5Q12175 ERR2YPL281C 1314 nt7.97□□□□□ -1.13
MSH5Q12175 GGA2YHR108W 1758 nt7.96□□□□□ -1.14
MSH5Q12175 TPS1YBR126C 1488 nt7.95□□□□□ -1.14
MSH5Q12175 ABP1YCR088W 1779 nt7.95□□□□□ -1.14
MSH5Q12175 YEL034C-AYEL034C-A 603 nt7.95□□□□□ -1.14
MSH5Q12175 RRT8YOL048C 1029 nt7.95□□□□□ -1.14
MSH5Q12175 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt7.95□□□□□ -1.14
MSH5Q12175 RTG2YGL252C 1767 nt7.94□□□□□ -1.14
MSH5Q12175 snR86snR86 1004 nt7.94□□□□□ -1.14
MSH5Q12175 snR31snR31 225 nt7.94□□□□□ -1.14
MSH5Q12175 NDE1YMR145C 1683 nt7.94□□□□□ -1.14
MSH5Q12175 HXT9YJL219W 1704 nt7.93□□□□□ -1.14
MSH5Q12175 YDR510C-AYDR510C-A 117 nt7.93□□□□□ -1.14
MSH5Q12175 SMM1YNR015W 1155 nt7.93□□□□□ -1.14
MSH5Q12175 YER152CYER152C 1332 nt7.92□□□□□ -1.14
MSH5Q12175 MAS1YLR163C 1389 nt7.92□□□□□ -1.14
MSH5Q12175 YJR114WYJR114W 393 nt7.91□□□□□ -1.14
MSH5Q12175 TMA23YMR269W 636 nt7.91□□□□□ -1.14
MSH5Q12175 KGD2YDR148C 1392 nt7.91□□□□□ -1.14
MSH5Q12175 YMR316C-BYMR316C-B 309 nt7.9□□□□□ -1.14
MSH5Q12175 HIS3YOR202W 663 nt7.9□□□□□ -1.14
MSH5Q12175 NDE2YDL085W 1638 nt7.89□□□□□ -1.15
MSH5Q12175 WSC4YHL028W 1818 nt7.88□□□□□ -1.15
MSH5Q12175 YJL118WYJL118W 660 nt7.88□□□□□ -1.15
MSH5Q12175 MET1YKR069W 1782 nt7.87□□□□□ -1.15
MSH5Q12175 AQR1YNL065W 1761 nt7.87□□□□□ -1.15
MSH5Q12175 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt7.87□□□□□ -1.15
MSH5Q12175 RRT6YGL146C 936 nt7.87□□□□□ -1.15
MSH5Q12175 ATO2YNR002C 849 nt7.87□□□□□ -1.15
MSH5Q12175 GNP1YDR508C 1992 nt7.87□□□□□ -1.15
MSH5Q12175 ADE8YDR408C 645 nt7.86□□□□□ -1.15
MSH5Q12175 IMO32YGR031W 1029 nt7.86□□□□□ -1.15
MSH5Q12175 SAM50YNL026W 1455 nt7.86□□□□□ -1.15
MSH5Q12175 YRF1-3YGR296W 5580 nt7.86□□□□□ -1.15
MSH5Q12175 YRF1-6YNL339C 5580 nt7.86□□□□□ -1.15
MSH5Q12175 YRF1-7YPL283C 5580 nt7.86□□□□□ -1.15
MSH5Q12175 ECM10YEL030W 1935 nt7.86□□□□□ -1.15
MSH5Q12175 GCD11YER025W 1584 nt7.85□□□□□ -1.15
MSH5Q12175 ADE5,7YGL234W 2409 nt7.84□□□□□ -1.15
MSH5Q12175 YIL108WYIL108W 2091 nt7.84□□□□□ -1.15
MSH5Q12175 POB3YML069W 1659 nt7.84□□□□□ -1.15
MSH5Q12175 YJL055WYJL055W 738 nt7.84□□□□□ -1.15
MSH5Q12175 LYS20YDL182W 1287 nt7.83□□□□□ -1.16
MSH5Q12175 OPI3YJR073C 621 nt7.83□□□□□ -1.16
MSH5Q12175 YNL040WYNL040W 1371 nt7.83□□□□□ -1.16
MSH5Q12175 RAD23YEL037C 1197 nt7.82□□□□□ -1.16
MSH5Q12175 SBP1YHL034C 885 nt7.82□□□□□ -1.16
MSH5Q12175 SWT21YNL187W 1074 nt7.82□□□□□ -1.16
MSH5Q12175 AAC3YBR085W 924 nt7.82□□□□□ -1.16
MSH5Q12175 AFG2YLR397C 2343 nt7.81□□□□□ -1.16
MSH5Q12175 MAS2YHR024C 1449 nt7.81□□□□□ -1.16
MSH5Q12175 MET13YGL125W 1803 nt7.8□□□□□ -1.16
MSH5Q12175 VRG4YGL225W 1014 nt7.8□□□□□ -1.16
MSH5Q12175 SNU66YOR308C 1764 nt7.79□□□□□ -1.16
MSH5Q12175 ADE2YOR128C 1716 nt7.79□□□□□ -1.16
MSH5Q12175 YNL140CYNL140C 570 nt7.79□□□□□ -1.16
MSH5Q12175 RIB7YBR153W 735 nt7.79□□□□□ -1.16
MSH5Q12175 SGF73YGL066W 1974 nt7.79□□□□□ -1.16
MSH5Q12175 TIF3YPR163C 1311 nt7.78□□□□□ -1.16
MSH5Q12175 YKL053WYKL053W 375 nt7.78□□□□□ -1.16
MSH5Q12175 LSB3YFR024C-A 1380 nt7.75□□□□□ -1.17
MSH5Q12175 CAB5YDR196C 726 nt7.75□□□□□ -1.17
MSH5Q12175 RIB3YDR487C 627 nt7.75□□□□□ -1.17
MSH5Q12175 RPL2AYFR031C-A 765 nt7.75□□□□□ -1.17
MSH5Q12175 HXT13YEL069C 1695 nt7.75□□□□□ -1.17
MSH5Q12175 GAL3YDR009W 1563 nt7.75□□□□□ -1.17
MSH5Q12175 PAR32YDL173W 888 nt7.74□□□□□ -1.17
MSH5Q12175 APS2YJR058C 444 nt7.74□□□□□ -1.17
MSH5Q12175 YJL009WYJL009W 327 nt7.73□□□□□ -1.17
MSH5Q12175 MAM3YOL060C 2121 nt7.73□□□□□ -1.17
MSH5Q12175 YLR111WYLR111W 333 nt7.72□□□□□ -1.17
MSH5Q12175 SAN1YDR143C 1833 nt7.72□□□□□ -1.17
MSH5Q12175 MRN1YPL184C 1839 nt7.72□□□□□ -1.17
MSH5Q12175 TMS1YDR105C 1422 nt7.71□□□□□ -1.17
MSH5Q12175 YER137CYER137C 447 nt7.71□□□□□ -1.18
MSH5Q12175 YFR036W-AYFR036W-A 651 nt7.71□□□□□ -1.18
MSH5Q12175 TVP23YDR084C 600 nt7.7□□□□□ -1.18
MSH5Q12175 RSC9YML127W 1746 nt7.69□□□□□ -1.18
MSH5Q12175 YLR030WYLR030W 792 nt7.69□□□□□ -1.18
MSH5Q12175 INO1YJL153C 1602 nt7.68□□□□□ -1.18
MSH5Q12175 INM1YHR046C 888 nt7.68□□□□□ -1.18
MSH5Q12175 BNA3YJL060W 1335 nt7.68□□□□□ -1.18
MSH5Q12175 MEP1YGR121C 1479 nt7.68□□□□□ -1.18
MSH5Q12175 GLY1YEL046C 1164 nt7.67□□□□□ -1.18
MSH5Q12175 CCR4YAL021C 2514 nt7.66□□□□□ -1.18
MSH5Q12175 MSB3YNL293W 1902 nt7.66□□□□□ -1.18
MSH5Q12175 LRO1YNR008W 1986 nt7.66□□□□□ -1.18
MSH5Q12175 FCP1YMR277W 2199 nt7.66□□□□□ -1.18
MSH5Q12175 RPL12BYDR418W 498 nt7.65□□□□□ -1.18
MSH5Q12175 RIB2YOL066C 1776 nt7.65□□□□□ -1.18
MSH5Q12175 YBL111CYBL111C 2004 nt7.65□□□□□ -1.18
MSH5Q12175 TGL5YOR081C 2250 nt7.64□□□□□ -1.19
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